MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanosaeta concilii GP6 plasmid pGP6

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015430	ATTT	2	8	252	259	25 %	75 %	0 %	0 %	330506029
2	NC_015430	ACCC	2	8	266	273	25 %	0 %	0 %	75 %	330506029
3	NC_015430	TGCG	2	8	339	346	0 %	25 %	50 %	25 %	330506029
4	NC_015430	CCTA	2	8	483	490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015430	TTGT	2	8	2226	2233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015430	CTCC	2	8	2420	2427	0 %	25 %	0 %	75 %	330506032
7	NC_015430	ATTT	2	8	2970	2977	25 %	75 %	0 %	0 %	330506033
8	NC_015430	ACCC	2	8	2984	2991	25 %	0 %	0 %	75 %	330506033
9	NC_015430	TGCG	2	8	3056	3063	0 %	25 %	50 %	25 %	330506033
10	NC_015430	CCTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015430	GATA	2	8	4855	4862	50 %	25 %	25 %	0 %	330506034
12	NC_015430	CCTT	2	8	6357	6364	0 %	50 %	0 %	50 %	330506035
13	NC_015430	GGCG	2	8	6745	6752	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015430	CTCA	2	8	7058	7065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015430	GCTA	2	8	7369	7376	25 %	25 %	25 %	25 %	330506036
16	NC_015430	ACCA	2	8	9177	9184	50 %	0 %	0 %	50 %	330506037
17	NC_015430	GGCC	2	8	9221	9228	0 %	0 %	50 %	50 %	330506037
18	NC_015430	GCTC	2	8	9544	9551	0 %	25 %	25 %	50 %	330506037
19	NC_015430	AGAT	2	8	10035	10042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015430	GGAA	2	8	10276	10283	50 %	0 %	50 %	0 %	330506038
21	NC_015430	ATCT	2	8	10492	10499	25 %	50 %	0 %	25 %	330506038
22	NC_015430	TCCT	2	8	11149	11156	0 %	50 %	0 %	50 %	330506039
23	NC_015430	TATT	2	8	11291	11298	25 %	75 %	0 %	0 %	330506039
24	NC_015430	CTGG	2	8	11388	11395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015430	ACTT	2	8	12154	12161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015430	GGCA	2	8	12344	12351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015430	CTGC	2	8	12357	12364	0 %	25 %	25 %	50 %	330506041
28	NC_015430	TGCA	2	8	12521	12528	25 %	25 %	25 %	25 %	330506041
29	NC_015430	CTAA	2	8	12909	12916	50 %	25 %	0 %	25 %	330506042
30	NC_015430	TGTA	2	8	12937	12944	25 %	50 %	25 %	0 %	330506042
31	NC_015430	ATTA	2	8	12980	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015430	ATGA	2	8	13095	13102	50 %	25 %	25 %	0 %	330506043
33	NC_015430	GCAG	2	8	13238	13245	25 %	0 %	50 %	25 %	330506043
34	NC_015430	TCGA	2	8	13365	13372	25 %	25 %	25 %	25 %	330506043
35	NC_015430	GAGG	2	8	13602	13609	25 %	0 %	75 %	0 %	330506043
36	NC_015430	TTGT	2	8	14827	14834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015430	CTCC	2	8	15021	15028	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015430	ATTT	2	8	15574	15581	25 %	75 %	0 %	0 %	330506046
39	NC_015430	ACCC	2	8	15588	15595	25 %	0 %	0 %	75 %	330506046
40	NC_015430	TGCG	2	8	15660	15667	0 %	25 %	50 %	25 %	330506046
41	NC_015430	CCTA	2	8	15804	15811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015430	TATC	2	8	15887	15894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015430	GATT	2	8	17235	17242	25 %	50 %	25 %	0 %	330506049
44	NC_015430	GATC	2	8	17340	17347	25 %	25 %	25 %	25 %	330506049
45	NC_015430	GATA	2	8	17383	17390	50 %	25 %	25 %	0 %	330506049
46	NC_015430	GCCC	2	8	17421	17428	0 %	0 %	25 %	75 %	330506049

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.