MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 plasmid pGP6

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015430	GCT	2	6	142	147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506029
2	NC_015430	TTA	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506029
3	NC_015430	TAC	2	6	309	314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506029
4	NC_015430	ATG	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506030
5	NC_015430	ATC	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506030
6	NC_015430	GAA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506030
7	NC_015430	GGA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506030
8	NC_015430	ATA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506030
9	NC_015430	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506031
10	NC_015430	GCT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
11	NC_015430	TCA	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506031
12	NC_015430	GGC	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506031
13	NC_015430	AGC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506031
14	NC_015430	TCT	2	6	1824	1829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506031
15	NC_015430	ATC	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506031
16	NC_015430	CTG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
17	NC_015430	GGC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506031
18	NC_015430	GCT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
19	NC_015430	GCT	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506031
20	NC_015430	CTG	2	6	2493	2498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506032
21	NC_015430	GCC	2	6	2527	2532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506032
22	NC_015430	GCT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506033
23	NC_015430	TTA	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506033
24	NC_015430	TAC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506033
25	NC_015430	TAT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506034
26	NC_015430	TCC	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506034
27	NC_015430	CAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506034
28	NC_015430	TTC	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
29	NC_015430	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506034
30	NC_015430	TGC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506034
31	NC_015430	TCA	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506034
32	NC_015430	TGT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506034
33	NC_015430	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506034
34	NC_015430	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
35	NC_015430	GCA	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506034
36	NC_015430	GCT	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506034
37	NC_015430	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
38	NC_015430	TAA	2	6	5339	5344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506034
39	NC_015430	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506034
40	NC_015430	CTT	2	6	5642	5647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506034
41	NC_015430	TCT	2	6	5952	5957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506035
42	NC_015430	CTT	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506035
43	NC_015430	GTG	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506035
44	NC_015430	CAT	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506035
45	NC_015430	ATC	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506035
46	NC_015430	TGC	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506035
47	NC_015430	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506035
48	NC_015430	TGC	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506035
49	NC_015430	ATG	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506035
50	NC_015430	TGC	2	6	6563	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506035
51	NC_015430	CTC	3	9	7277	7285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506036
52	NC_015430	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506036
53	NC_015430	CCA	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506036
54	NC_015430	ATC	2	6	7661	7666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
55	NC_015430	GGC	2	6	7727	7732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506037
56	NC_015430	CTG	2	6	7788	7793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
57	NC_015430	TAG	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506037
58	NC_015430	CAG	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506037
59	NC_015430	TCA	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
60	NC_015430	TCT	2	6	7934	7939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
61	NC_015430	AAT	2	6	7983	7988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506037
62	NC_015430	TAC	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
63	NC_015430	TCG	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
64	NC_015430	GCA	2	6	8234	8239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506037
65	NC_015430	CAA	2	6	8289	8294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506037
66	NC_015430	TTC	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
67	NC_015430	GAA	2	6	8494	8499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506037
68	NC_015430	CCT	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506037
69	NC_015430	CTT	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
70	NC_015430	TTC	2	6	8614	8619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
71	NC_015430	TCA	2	6	8648	8653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
72	NC_015430	TTA	2	6	8703	8708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506037
73	NC_015430	GCT	2	6	8789	8794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
74	NC_015430	CAT	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
75	NC_015430	CCG	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506037
76	NC_015430	GCA	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506037
77	NC_015430	ACC	2	6	8923	8928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506037
78	NC_015430	CTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
79	NC_015430	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506037
80	NC_015430	AGG	2	6	9310	9315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506037
81	NC_015430	AGG	2	6	9319	9324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506037
82	NC_015430	CTT	2	6	9340	9345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506037
83	NC_015430	TGC	3	9	9379	9387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506037
84	NC_015430	TCC	2	6	9484	9489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506037
85	NC_015430	CCT	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506037
86	NC_015430	TCA	2	6	9569	9574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506037
87	NC_015430	CCG	2	6	9851	9856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506037
88	NC_015430	AAG	2	6	10164	10169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506038
89	NC_015430	CCA	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506038
90	NC_015430	GAT	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506038
91	NC_015430	CAG	2	6	10402	10407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506038
92	NC_015430	ATT	2	6	10410	10415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506038
93	NC_015430	GAT	2	6	10464	10469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506038
94	NC_015430	ACC	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506038
95	NC_015430	TGG	2	6	10563	10568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506038
96	NC_015430	TGA	2	6	10862	10867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506039
97	NC_015430	TCT	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506039
98	NC_015430	TGA	2	6	11198	11203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506039
99	NC_015430	TCT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506039
100	NC_015430	TCG	2	6	11638	11643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506040
101	NC_015430	ACC	2	6	11670	11675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506040
102	NC_015430	GCC	2	6	11780	11785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506040
103	NC_015430	AGA	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506041
104	NC_015430	TCA	2	6	12470	12475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506041
105	NC_015430	CAG	2	6	12552	12557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506041
106	NC_015430	CGC	2	6	12778	12783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506042
107	NC_015430	CAG	2	6	13123	13128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506043
108	NC_015430	CGA	2	6	13199	13204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506043
109	NC_015430	TGT	2	6	13214	13219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506043
110	NC_015430	GCT	2	6	13295	13300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506043
111	NC_015430	ATC	2	6	13305	13310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506043
112	NC_015430	CAC	2	6	13635	13640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506043
113	NC_015430	CAA	2	6	13663	13668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506043
114	NC_015430	CTC	2	6	13971	13976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506044
115	NC_015430	TGG	2	6	14143	14148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506045
116	NC_015430	GCT	2	6	14192	14197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506045
117	NC_015430	TCA	2	6	14266	14271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506045
118	NC_015430	GGC	2	6	14374	14379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506045
119	NC_015430	AGC	2	6	14419	14424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506045
120	NC_015430	TCT	2	6	14425	14430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506045
121	NC_015430	ATC	2	6	14452	14457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506045
122	NC_015430	CTG	2	6	14492	14497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506045
123	NC_015430	GGC	2	6	14548	14553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506045
124	NC_015430	GCT	2	6	14675	14680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506045
125	NC_015430	GCT	2	6	14683	14688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506045
126	NC_015430	GCT	2	6	15464	15469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506046
127	NC_015430	TTA	2	6	15568	15573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506046
128	NC_015430	TAC	2	6	15630	15635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506046
129	NC_015430	TGA	2	6	16126	16131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506047
130	NC_015430	GCG	2	6	16307	16312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506047
131	NC_015430	ATG	2	6	16537	16542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506047
132	NC_015430	ATC	2	6	16580	16585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506047
133	NC_015430	GAA	2	6	16681	16686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506048
134	NC_015430	GGA	2	6	16815	16820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506048
135	NC_015430	ATA	2	6	16889	16894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506048
136	NC_015430	ACC	2	6	17198	17203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506049
137	NC_015430	CTT	2	6	17247	17252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506049
138	NC_015430	GCG	2	6	17504	17509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506049
139	NC_015430	CTT	2	6	17541	17546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506049

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.