MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015429	TATT	2	8	108	115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015429	ATTA	2	8	246	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015429	TTTA	3	12	254	265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015429	TCTT	2	8	436	443	0 %	75 %	0 %	25 %	330370682
5	NC_015429	TGAA	2	8	500	507	50 %	25 %	25 %	0 %	330370682
6	NC_015429	AAAT	2	8	1382	1389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015429	AAAC	2	8	1390	1397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015429	TGCC	2	8	1530	1537	0 %	25 %	25 %	50 %	330370684
9	NC_015429	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015429	TAGC	2	8	3639	3646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015429	ATGG	2	8	4685	4692	25 %	25 %	50 %	0 %	330370686
12	NC_015429	TGAA	2	8	4794	4801	50 %	25 %	25 %	0 %	330370686
13	NC_015429	AAAG	2	8	5477	5484	75 %	0 %	25 %	0 %	330370686
14	NC_015429	CAAA	2	8	5947	5954	75 %	0 %	0 %	25 %	330370686
15	NC_015429	TGGT	2	8	6007	6014	0 %	50 %	50 %	0 %	330370686
16	NC_015429	TTGA	2	8	6895	6902	25 %	50 %	25 %	0 %	330370687
17	NC_015429	TGCC	2	8	7188	7195	0 %	25 %	25 %	50 %	330370688
18	NC_015429	GCTT	2	8	7342	7349	0 %	50 %	25 %	25 %	330370688
19	NC_015429	ACCA	2	8	7518	7525	50 %	0 %	0 %	50 %	330370688
20	NC_015429	GGCC	2	8	7534	7541	0 %	0 %	50 %	50 %	330370688
21	NC_015429	TGCT	2	8	8672	8679	0 %	50 %	25 %	25 %	330370688
22	NC_015429	GCAA	2	8	8788	8795	50 %	0 %	25 %	25 %	330370688
23	NC_015429	AGCA	2	8	8943	8950	50 %	0 %	25 %	25 %	330370688
24	NC_015429	ATTA	2	8	9112	9119	50 %	50 %	0 %	0 %	330370689
25	NC_015429	ATGG	2	8	9237	9244	25 %	25 %	50 %	0 %	330370689
26	NC_015429	AGCC	2	8	9632	9639	25 %	0 %	25 %	50 %	330370689
27	NC_015429	TTGG	2	8	9984	9991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015429	ATTA	2	8	10046	10053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015429	CTTT	2	8	10931	10938	0 %	75 %	0 %	25 %	330370690
30	NC_015429	GTTC	2	8	11771	11778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015429	CATG	2	8	11833	11840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015429	AAAG	2	8	11849	11856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015429	GTTC	2	8	12557	12564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015429	TTTC	2	8	12730	12737	0 %	75 %	0 %	25 %	330370693
35	NC_015429	CGTT	2	8	13539	13546	0 %	50 %	25 %	25 %	330370693
36	NC_015429	TGTT	2	8	13568	13575	0 %	75 %	25 %	0 %	330370693
37	NC_015429	TTAA	2	8	13590	13597	50 %	50 %	0 %	0 %	330370693
38	NC_015429	TTTA	2	8	13673	13680	25 %	75 %	0 %	0 %	330370693
39	NC_015429	TTAA	2	8	13764	13771	50 %	50 %	0 %	0 %	330370693
40	NC_015429	ATTG	2	8	13919	13926	25 %	50 %	25 %	0 %	330370693
41	NC_015429	TTGA	2	8	14111	14118	25 %	50 %	25 %	0 %	330370693
42	NC_015429	CAAC	2	8	14173	14180	50 %	0 %	0 %	50 %	330370693
43	NC_015429	TTCT	2	8	14408	14415	0 %	75 %	0 %	25 %	330370693
44	NC_015429	TCTT	2	8	14487	14494	0 %	75 %	0 %	25 %	330370693
45	NC_015429	CCTT	2	8	14604	14611	0 %	50 %	0 %	50 %	330370693
46	NC_015429	CGTT	2	8	15799	15806	0 %	50 %	25 %	25 %	330370696
47	NC_015429	TCAA	2	8	15886	15893	50 %	25 %	0 %	25 %	330370696
48	NC_015429	TATC	2	8	16154	16161	25 %	50 %	0 %	25 %	330370696
49	NC_015429	ATTT	2	8	16370	16377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015429	TTGT	2	8	17962	17969	0 %	75 %	25 %	0 %	330370699
51	NC_015429	TGAT	2	8	18165	18172	25 %	50 %	25 %	0 %	330370699

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.