MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015429	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015429	TTC	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370682
3	NC_015429	GAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370683
4	NC_015429	TCA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370683
5	NC_015429	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370683
6	NC_015429	TAT	2	6	744	749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370683
7	NC_015429	GTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370683
8	NC_015429	AAC	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370683
9	NC_015429	TCG	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370683
10	NC_015429	GTT	2	6	1202	1207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370683
11	NC_015429	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370683
12	NC_015429	GTT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370683
13	NC_015429	ACC	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370683
14	NC_015429	TAA	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370683
15	NC_015429	CCT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015429	TAG	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015429	TTA	2	6	1401	1406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015429	AAT	2	6	1407	1412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015429	GTC	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370684
20	NC_015429	CTG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370684
21	NC_015429	TTG	3	9	1636	1644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370684
22	NC_015429	AAT	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370684
23	NC_015429	AAT	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370684
24	NC_015429	GTT	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370684
25	NC_015429	AAT	2	6	1940	1945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370684
26	NC_015429	ATT	2	6	2142	2147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015429	CTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015429	ATT	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015429	GTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015429	TGT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015429	AAT	2	6	2422	2427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015429	TAA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015429	TAT	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015429	GAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015429	GTA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015429	GAA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015429	CAA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015429	GTC	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015429	GAT	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015429	TCA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015429	TTC	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015429	GCG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015429	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015429	TGT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015429	AGC	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015429	GAA	2	6	3324	3329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015429	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015429	GTT	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015429	GTC	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015429	ATT	2	6	3725	3730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015429	TGA	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370685
52	NC_015429	TAA	2	6	3828	3833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370685
53	NC_015429	AGA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370685
54	NC_015429	ATT	2	6	3924	3929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370685
55	NC_015429	AAG	2	6	4091	4096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370685
56	NC_015429	TTA	2	6	4148	4153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370685
57	NC_015429	CAA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370686
58	NC_015429	TTA	2	6	4274	4279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
59	NC_015429	GAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
60	NC_015429	TCT	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370686
61	NC_015429	GCA	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370686
62	NC_015429	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
63	NC_015429	TTA	2	6	4380	4385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
64	NC_015429	TAT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
65	NC_015429	TGC	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370686
66	NC_015429	GTT	2	6	4490	4495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370686
67	NC_015429	AAG	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
68	NC_015429	GAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
69	NC_015429	ATG	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
70	NC_015429	TTA	2	6	4698	4703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
71	NC_015429	GCT	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370686
72	NC_015429	TGA	3	9	4768	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
73	NC_015429	TAC	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370686
74	NC_015429	ATT	2	6	4859	4864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
75	NC_015429	AGA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
76	NC_015429	GTT	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370686
77	NC_015429	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
78	NC_015429	TAG	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
79	NC_015429	GTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370686
80	NC_015429	GGT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
81	NC_015429	AGA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
82	NC_015429	TGG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
83	NC_015429	AGA	2	6	5323	5328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
84	NC_015429	TAT	2	6	5417	5422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
85	NC_015429	GAA	2	6	5444	5449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
86	NC_015429	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
87	NC_015429	TTA	2	6	5708	5713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
88	NC_015429	CTT	2	6	5744	5749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370686
89	NC_015429	ATG	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
90	NC_015429	CTT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370686
91	NC_015429	GTG	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
92	NC_015429	TGA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
93	NC_015429	TAG	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
94	NC_015429	CGT	3	9	6206	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015429	TAC	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015429	ATG	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370687
97	NC_015429	ACA	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370687
98	NC_015429	TGA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370687
99	NC_015429	AAG	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370687
100	NC_015429	AAT	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370687
101	NC_015429	ACC	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370687
102	NC_015429	CGA	2	6	7021	7026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370687
103	NC_015429	CTT	2	6	7250	7255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370688
104	NC_015429	GCA	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370688
105	NC_015429	AAT	2	6	7269	7274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370688
106	NC_015429	GCA	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370688
107	NC_015429	TCG	2	6	7405	7410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
108	NC_015429	CAT	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
109	NC_015429	TCT	2	6	7571	7576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370688
110	NC_015429	GCC	2	6	7621	7626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330370688
111	NC_015429	CTG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
112	NC_015429	CAT	2	6	7676	7681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
113	NC_015429	TCG	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
114	NC_015429	AGA	2	6	8243	8248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370688
115	NC_015429	TAA	2	6	8357	8362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370688
116	NC_015429	CCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370688
117	NC_015429	TGC	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
118	NC_015429	CCA	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370688
119	NC_015429	ATC	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
120	NC_015429	CAA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370688
121	NC_015429	CCG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330370688
122	NC_015429	TTC	2	6	8824	8829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370688
123	NC_015429	CAT	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
124	NC_015429	TCA	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
125	NC_015429	ATT	2	6	9015	9020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015429	TGA	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370689
127	NC_015429	TGC	2	6	9127	9132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370689
128	NC_015429	TCA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370689
129	NC_015429	GAA	2	6	9178	9183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370689
130	NC_015429	GTT	2	6	9524	9529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370689
131	NC_015429	GTT	2	6	9534	9539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370689
132	NC_015429	TGC	2	6	9745	9750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370689
133	NC_015429	ACG	2	6	9763	9768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370689
134	NC_015429	CTA	2	6	9998	10003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015429	ACC	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015429	TCA	2	6	10163	10168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015429	ATG	2	6	10361	10366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370690
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139	NC_015429	TGG	2	6	10526	10531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370690
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149	NC_015429	AAG	2	6	11555	11560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_015429	CAG	2	6	11802	11807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015429	AAG	2	6	11861	11866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015429	AAG	2	6	11895	11900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_015429	AAC	2	6	18369	18374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.