MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015429	TTC	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370682
2	NC_015429	GAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370683
3	NC_015429	TCA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370683
4	NC_015429	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370683
5	NC_015429	TAT	2	6	744	749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370683
6	NC_015429	GTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370683
7	NC_015429	AAC	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370683
8	NC_015429	TCG	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370683
9	NC_015429	GTT	2	6	1202	1207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370683
10	NC_015429	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370683
11	NC_015429	GTT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370683
12	NC_015429	ACC	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370683
13	NC_015429	TAA	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370683
14	NC_015429	GTC	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370684
15	NC_015429	CTG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370684
16	NC_015429	TTG	3	9	1636	1644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370684
17	NC_015429	AAT	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370684
18	NC_015429	AAT	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370684
19	NC_015429	GTT	2	6	1822	1827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370684
20	NC_015429	AAT	2	6	1940	1945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370684
21	NC_015429	TGA	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370685
22	NC_015429	TAA	2	6	3828	3833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370685
23	NC_015429	AGA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370685
24	NC_015429	ATT	2	6	3924	3929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370685
25	NC_015429	AAG	2	6	4091	4096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370685
26	NC_015429	TTA	2	6	4148	4153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370685
27	NC_015429	CAA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370686
28	NC_015429	TTA	2	6	4274	4279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
29	NC_015429	GAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
30	NC_015429	TCT	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370686
31	NC_015429	GCA	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370686
32	NC_015429	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
33	NC_015429	TTA	2	6	4380	4385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
34	NC_015429	TAT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
35	NC_015429	TGC	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370686
36	NC_015429	GTT	2	6	4490	4495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370686
37	NC_015429	AAG	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
38	NC_015429	GAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
39	NC_015429	ATG	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
40	NC_015429	TTA	2	6	4698	4703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
41	NC_015429	GCT	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370686
42	NC_015429	TGA	3	9	4768	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
43	NC_015429	TAC	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370686
44	NC_015429	ATT	2	6	4859	4864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
45	NC_015429	AGA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
46	NC_015429	GTT	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370686
47	NC_015429	ATT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
48	NC_015429	TAG	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
49	NC_015429	GTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370686
50	NC_015429	GGT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
51	NC_015429	AGA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
52	NC_015429	TGG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
53	NC_015429	AGA	2	6	5323	5328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
54	NC_015429	TAT	2	6	5417	5422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
55	NC_015429	GAA	2	6	5444	5449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370686
56	NC_015429	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
57	NC_015429	TTA	2	6	5708	5713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370686
58	NC_015429	CTT	2	6	5744	5749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370686
59	NC_015429	ATG	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
60	NC_015429	CTT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370686
61	NC_015429	GTG	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370686
62	NC_015429	TGA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
63	NC_015429	TAG	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370686
64	NC_015429	ATG	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370687
65	NC_015429	ACA	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370687
66	NC_015429	TGA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370687
67	NC_015429	AAG	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370687
68	NC_015429	AAT	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370687
69	NC_015429	ACC	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370687
70	NC_015429	CGA	2	6	7021	7026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370687
71	NC_015429	CTT	2	6	7250	7255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370688
72	NC_015429	GCA	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370688
73	NC_015429	AAT	2	6	7269	7274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370688
74	NC_015429	GCA	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370688
75	NC_015429	TCG	2	6	7405	7410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
76	NC_015429	CAT	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
77	NC_015429	TCT	2	6	7571	7576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370688
78	NC_015429	GCC	2	6	7621	7626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330370688
79	NC_015429	CTG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
80	NC_015429	CAT	2	6	7676	7681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
81	NC_015429	TCG	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
82	NC_015429	AGA	2	6	8243	8248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370688
83	NC_015429	TAA	2	6	8357	8362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370688
84	NC_015429	CCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370688
85	NC_015429	TGC	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370688
86	NC_015429	CCA	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370688
87	NC_015429	ATC	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
88	NC_015429	CAA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370688
89	NC_015429	CCG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330370688
90	NC_015429	TTC	2	6	8824	8829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370688
91	NC_015429	CAT	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
92	NC_015429	TCA	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370688
93	NC_015429	TGA	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370689
94	NC_015429	TGC	2	6	9127	9132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370689
95	NC_015429	TCA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370689
96	NC_015429	GAA	2	6	9178	9183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370689
97	NC_015429	GTT	2	6	9524	9529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370689
98	NC_015429	GTT	2	6	9534	9539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370689
99	NC_015429	TGC	2	6	9745	9750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370689
100	NC_015429	ACG	2	6	9763	9768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370689
101	NC_015429	ATG	2	6	10361	10366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370690
102	NC_015429	AAG	2	6	10370	10375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370690
103	NC_015429	TGG	2	6	10526	10531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370690
104	NC_015429	TGA	2	6	10583	10588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370690
105	NC_015429	TGT	2	6	10648	10653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370690
106	NC_015429	GAC	2	6	10767	10772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370690
107	NC_015429	TTA	2	6	10835	10840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370690
108	NC_015429	ATA	2	6	10972	10977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370690
109	NC_015429	GGC	3	9	11091	11099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370691
110	NC_015429	AAG	2	6	11171	11176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370691
111	NC_015429	TAA	2	6	11993	11998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370692
112	NC_015429	CTT	2	6	12061	12066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370692
113	NC_015429	TAA	2	6	12115	12120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370692
114	NC_015429	TCT	2	6	12163	12168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370692
115	NC_015429	CAA	2	6	12241	12246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370692
116	NC_015429	CTT	2	6	12260	12265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370692
117	NC_015429	GAC	2	6	12278	12283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370692
118	NC_015429	CCA	2	6	12666	12671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370693
119	NC_015429	TCA	2	6	12771	12776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370693
120	NC_015429	AGT	2	6	12823	12828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370693
121	NC_015429	GTC	2	6	12893	12898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370693
122	NC_015429	TTG	2	6	12905	12910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370693
123	NC_015429	GTT	2	6	12988	12993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370693
124	NC_015429	CAT	2	6	13000	13005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370693
125	NC_015429	TGA	2	6	13026	13031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370693
126	NC_015429	TGG	2	6	13109	13114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370693
127	NC_015429	CTT	2	6	13245	13250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370693
128	NC_015429	ATC	2	6	13407	13412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370693
129	NC_015429	TAA	2	6	13457	13462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370693
130	NC_015429	AAT	2	6	13497	13502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370693
131	NC_015429	TGT	2	6	13503	13508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370693
132	NC_015429	CAA	2	6	13511	13516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370693
133	NC_015429	ATC	2	6	13517	13522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370693
134	NC_015429	TTG	2	6	13712	13717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370693
135	NC_015429	AAT	2	6	13728	13733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370693
136	NC_015429	ATC	2	6	13808	13813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370693
137	NC_015429	TTG	2	6	13979	13984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370693
138	NC_015429	GCC	2	6	14137	14142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330370693
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146	NC_015429	ATC	2	6	15085	15090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370694
147	NC_015429	CAA	2	6	15245	15250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370695
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150	NC_015429	GAA	2	6	15413	15418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370695
151	NC_015429	TAA	2	6	15484	15489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370695
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.