MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015428	GCAATT	2	12	102133	102144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015428	ATTGTA	2	12	108060	108071	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015428	CAAATA	2	12	108073	108084	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015428	AATATT	2	12	120666	120677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015428	AATATC	2	12	131791	131802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015428	TTTTGA	2	12	164011	164022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015428	ACTGGA	2	12	167664	167675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015428	GTTTTT	2	12	192538	192549	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015428	TTGAAT	2	12	196337	196348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015428	AGTATG	2	12	228288	228299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015428	ATTTCA	2	12	254193	254204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015428	AATTAT	2	12	275160	275171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015428	GTTCAT	2	12	283553	283564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015428	TGACCC	2	12	310162	310173	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015428	ACCGTT	2	12	321731	321742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015428	AGAGTG	2	12	323354	323365	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015428	AACTTT	2	12	351710	351721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015428	GATTTT	2	12	357169	357180	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015428	AAAATA	2	12	373982	373993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015428	GGGGCA	2	12	400155	400166	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015428	AATGGG	2	12	420778	420789	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015428	CAATGC	2	12	430660	430671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015428	TATCAA	2	12	436888	436899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015428	TGACCC	2	12	465676	465687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015428	GTTAAA	2	12	466698	466709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015428	CTTTTT	2	12	468221	468232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015428	GGGTGT	2	12	477158	477169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015428	ATTTTT	2	12	485150	485161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015428	AATGGA	2	12	488041	488052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015428	ACGATG	2	12	490093	490104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015428	GTCCCA	2	12	511709	511720	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015428	TATTAA	2	12	512077	512088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015428	CTGTCA	2	12	519362	519373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015428	GAATAT	2	12	556668	556679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015428	TAATCA	2	12	560087	560098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015428	AACCAA	2	12	567663	567674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015428	AAAAAG	2	12	574311	574322	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015428	AAAATG	2	12	634573	634584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015428	TTAATT	2	12	647929	647940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015428	GGATGC	2	12	655965	655976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015428	AAATAA	2	12	656594	656605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015428	AGAATC	2	12	699765	699776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015428	TGGTTT	2	12	706475	706486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015428	TGGAAG	2	12	711132	711143	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015428	TCAACA	2	12	748000	748011	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015428	TGGTTT	2	12	829679	829690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015428	TGGAAG	2	12	834338	834349	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015428	AAAAGA	2	12	836158	836169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015428	GGGGTC	2	12	850946	850957	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015428	CTGCTT	2	12	851079	851090	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015428	TTTTAA	2	12	861116	861127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015428	CTTTTT	2	12	864797	864808	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015428	TTGGGA	2	12	879312	879323	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015428	AAAAAG	2	12	885865	885876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015428	TGGCAA	2	12	889487	889498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015428	ATTAAA	2	12	952479	952490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015428	TTCATT	2	12	998614	998625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015428	AGTCAA	2	12	999617	999628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015428	AAAAGA	2	12	1046940	1046951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015428	ATTGTT	2	12	1218972	1218983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015428	TATACT	2	12	1280723	1280734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015428	TAAATA	2	12	1311539	1311550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015428	AAAAGA	2	12	1385606	1385617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015428	CAATTA	2	12	1386947	1386958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015428	AAATGT	2	12	1411820	1411831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015428	TTTTCG	2	12	1490895	1490906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015428	GTTTTT	2	12	1491924	1491935	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015428	AAACCC	2	12	1535768	1535779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015428	CTTTTT	2	12	1559805	1559816	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015428	TAGTCT	2	12	1559906	1559917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015428	ATCTTT	2	12	1560383	1560394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015428	TATATC	2	12	1575714	1575725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015428	CACTTC	2	12	1594700	1594711	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015428	GGCCTC	2	12	1608316	1608327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015428	CACTTC	2	12	1675657	1675668	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015428	AAACCA	2	12	1680094	1680105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015428	AAATTT	2	12	1689841	1689852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015428	TGGTTG	2	12	1709137	1709148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015428	ATCATT	2	12	1710786	1710797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015428	TCTTTA	2	12	1761680	1761691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015428	AATATA	2	12	1790781	1790792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015428	ACGCAA	2	12	1829430	1829441	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015428	ATAACC	2	12	1853271	1853282	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015428	AGTTGA	2	12	1865267	1865278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015428	CAAAAT	2	12	1871750	1871761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015428	CTTTCA	2	12	1887481	1887492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015428	TTGTGA	2	12	1958590	1958601	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015428	AAAGGA	2	12	1958686	1958697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015428	AATTTA	2	12	1980096	1980107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015428	TTTGAT	2	12	1983653	1983664	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015428	AAGTAA	2	12	1983690	1983701	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015428	TGTGAT	2	12	2004222	2004233	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015428	CAGGTT	2	12	2106004	2106015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015428	GCGTTG	2	12	2106033	2106044	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015428	GTCAAC	2	12	2116870	2116881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015428	ATTTTT	2	12	2202472	2202483	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015428	ATATTG	2	12	2220968	2220979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015428	AATACG	2	12	2235572	2235583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015428	CAAACC	2	12	2246415	2246426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015428	CTTTAG	2	12	2263012	2263023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015428	TTTTCA	2	12	2273795	2273806	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015428	ATTCAA	2	12	2276641	2276652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015428	CACTTC	2	12	2297380	2297391	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015428	AAACCA	2	12	2301817	2301828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015428	CTTGGG	2	12	2373620	2373631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015428	TGCTTA	2	12	2386244	2386255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015428	AAATTC	2	12	2386541	2386552	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015428	CTGTCA	2	12	2399180	2399191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015428	CTGATC	2	12	2418407	2418418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015428	AAAATG	2	12	2458577	2458588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015428	TCCCAC	2	12	2488383	2488394	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015428	TCATAT	2	12	2490018	2490029	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.