MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015428	TCTTT	2	10	1853	1862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015428	TCATT	2	10	3184	3193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015428	GTAAA	2	10	12281	12290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015428	AATGA	2	10	16103	16112	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015428	TGAGA	2	10	16200	16209	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015428	CTAAA	2	10	23144	23153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015428	GGTTT	2	10	40752	40761	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015428	TAAAA	2	10	43536	43545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015428	TTTGA	2	10	68430	68439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015428	TAAAA	2	10	71327	71336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015428	AAATT	2	10	88687	88696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015428	ATGAC	2	10	100967	100976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015428	TGAAA	2	10	101420	101429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015428	ATTAT	2	10	107044	107053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015428	AATTT	2	10	109574	109583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015428	ATTAA	2	10	121931	121940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015428	TTCGT	2	10	122524	122533	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015428	CAGGG	2	10	126222	126231	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015428	AATCC	2	10	139620	139629	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015428	TCGCC	2	10	139743	139752	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015428	CAATT	2	10	151442	151451	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015428	GAAAA	2	10	151776	151785	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015428	AAATC	2	10	154786	154795	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015428	CAAAA	2	10	160576	160585	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015428	AAAGG	2	10	161449	161458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015428	TAACA	2	10	162399	162408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015428	ATTTC	2	10	164796	164805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015428	AACAA	2	10	178023	178032	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015428	TTTTA	2	10	179224	179233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015428	TGATA	2	10	185765	185774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015428	AAAAT	2	10	190541	190550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015428	AAAGT	2	10	192558	192567	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015428	TTGTT	2	10	201358	201367	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015428	TTTTC	2	10	201394	201403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015428	TATAA	2	10	202421	202430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015428	GTGAT	2	10	202579	202588	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015428	CAGTG	2	10	204334	204343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015428	TAGTC	2	10	224207	224216	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015428	AATTA	2	10	224271	224280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015428	CGAAG	2	10	231810	231819	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015428	GTGGA	2	10	235647	235656	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015428	AATTT	2	10	235688	235697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015428	ATTTT	2	10	242818	242827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015428	GGTGG	2	10	244553	244562	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015428	ACATT	2	10	247354	247363	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015428	GAAGA	2	10	247405	247414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015428	GTTTT	2	10	247528	247537	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015428	AATTG	2	10	265189	265198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015428	CATGC	2	10	274836	274845	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015428	TTTCT	2	10	275075	275084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015428	AATTT	2	10	275130	275139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015428	CTGTC	2	10	276973	276982	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015428	AATCT	2	10	280785	280794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015428	ATTTA	2	10	280881	280890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015428	TTTGT	2	10	281608	281617	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015428	TTAAA	2	10	299754	299763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015428	AAATA	2	10	312308	312317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015428	TTGAT	2	10	316397	316406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015428	TCCTT	2	10	318829	318838	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015428	GTTTT	2	10	320751	320760	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015428	TGATT	2	10	353479	353488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015428	AGGAA	2	10	353732	353741	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015428	CTTTA	2	10	353764	353773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015428	CTCTT	2	10	358265	358274	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015428	TGAAA	2	10	378548	378557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015428	TTATG	2	10	382802	382811	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015428	CAAAT	2	10	400338	400347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015428	CAAAC	2	10	431611	431620	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015428	AATAT	2	10	431874	431883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015428	TGAAT	2	10	431960	431969	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015428	TAGTT	2	10	436797	436806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015428	GGAAT	2	10	436957	436966	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015428	TCAAA	2	10	444947	444956	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015428	TAAAA	2	10	452362	452371	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015428	AAAAT	2	10	459507	459516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015428	GGTAT	2	10	460577	460586	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015428	TGAAA	2	10	466445	466454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015428	GAGTG	2	10	466785	466794	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015428	TTTTA	2	10	485182	485191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015428	TTTTG	2	10	502252	502261	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015428	TAGGC	2	10	503800	503809	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015428	ACTCT	2	10	504009	504018	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015428	GTACC	2	10	504038	504047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015428	TTTGT	2	10	505185	505194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015428	TTATA	2	10	514313	514322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015428	GCAAA	2	10	520835	520844	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015428	GTGTT	2	10	522001	522010	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015428	TTTGC	2	10	535277	535286	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015428	ATTTA	2	10	557182	557191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015428	ATTCA	2	10	560445	560454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015428	ATTGA	2	10	564996	565005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015428	TAGTA	2	10	574291	574300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015428	ATATA	2	10	585411	585420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015428	ACGGA	2	10	601753	601762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015428	TTTAC	2	10	612486	612495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015428	AATAT	2	10	616680	616689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015428	GATAT	2	10	621929	621938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015428	TATTC	2	10	623202	623211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015428	TTTTA	2	10	637206	637215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015428	GTAAT	2	10	655816	655825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015428	TGTTA	2	10	660408	660417	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015428	TATCG	2	10	669100	669109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015428	CGAAA	2	10	670348	670357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015428	ATTTG	2	10	674531	674540	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015428	TGATT	2	10	678209	678218	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015428	TGAAT	2	10	680861	680870	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015428	TCATC	2	10	685313	685322	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015428	ATTTT	2	10	693142	693151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015428	TAGGC	2	10	693558	693567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015428	CCAAA	2	10	697820	697829	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015428	AGATA	2	10	699746	699755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015428	GATTG	2	10	700322	700331	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015428	CATCA	2	10	703176	703185	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015428	TGAGC	2	10	704454	704463	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015428	GTCTG	2	10	707024	707033	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015428	TCGTG	2	10	707358	707367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015428	GTTAA	2	10	708275	708284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015428	TTATG	2	10	742855	742864	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015428	AGAAA	2	10	747756	747765	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015428	TAATA	2	10	758270	758279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015428	TAATC	2	10	772304	772313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015428	TTCTA	2	10	782780	782789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015428	AGGAA	2	10	783007	783016	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015428	TAATC	2	10	795118	795127	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015428	CTTGA	2	10	800898	800907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015428	CATGC	2	10	802192	802201	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015428	GATAT	2	10	802538	802547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015428	TTCAA	2	10	813841	813850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015428	TTCAA	2	10	813965	813974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015428	GTCTG	2	10	830228	830237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015428	TCGTG	2	10	830562	830571	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015428	GTTAA	2	10	831481	831490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015428	AACAT	2	10	842080	842089	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015428	ACAAA	2	10	851024	851033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015428	TGAAT	2	10	859356	859365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015428	AATTA	2	10	861004	861013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015428	TCATA	2	10	875671	875680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015428	TTTGA	2	10	881377	881386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015428	TCGAT	2	10	882904	882913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015428	TAGGC	2	10	886006	886015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015428	TACGA	2	10	897886	897895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015428	TATCA	2	10	899885	899894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015428	TATTT	2	10	918765	918774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015428	TACTT	2	10	944424	944433	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015428	AAATC	2	10	946093	946102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015428	TTGCT	2	10	946848	946857	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015428	AATCA	2	10	961031	961040	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_015428	GTTAC	2	10	1932618	1932627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_015428	GAACC	2	10	2020561	2020570	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
275	NC_015428	GTTCA	2	10	2020600	2020609	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_015428	TTAAC	2	10	2034171	2034180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_015428	ATTTT	2	10	2044158	2044167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_015428	TAGGC	2	10	2061528	2061537	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_015428	TAGGC	2	10	2061727	2061736	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_015428	CCTTT	2	10	2066330	2066339	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_015428	CATTT	2	10	2067220	2067229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_015428	CAAAT	2	10	2069800	2069809	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_015428	ATAAA	2	10	2088859	2088868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015428	CATTT	2	10	2093459	2093468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_015428	TCTTT	2	10	2100502	2100511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_015428	ATTCT	2	10	2101615	2101624	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_015428	TTTTA	2	10	2102823	2102832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015428	AAAAT	2	10	2106899	2106908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_015428	ATATA	2	10	2112783	2112792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_015428	TGCTA	2	10	2121918	2121927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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305	NC_015428	TAAAA	2	10	2128218	2128227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_015428	TATGA	2	10	2143409	2143418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_015428	TGGAG	2	10	2257722	2257731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015428	GAATT	2	10	2263632	2263641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_015428	CATAG	2	10	2270885	2270894	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
325	NC_015428	AACAT	2	10	2271053	2271062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
326	NC_015428	TTATT	2	10	2275435	2275444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_015428	CAATT	2	10	2278423	2278432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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329	NC_015428	GCCTA	2	10	2286807	2286816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
330	NC_015428	GACCA	2	10	2291084	2291093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
331	NC_015428	TTAAC	2	10	2300241	2300250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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333	NC_015428	CAGAC	2	10	2301270	2301279	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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336	NC_015428	TGACC	2	10	2335662	2335671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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339	NC_015428	TTTTG	2	10	2345466	2345475	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
340	NC_015428	TTGGC	2	10	2347463	2347472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
341	NC_015428	ACTAC	2	10	2355119	2355128	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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344	NC_015428	CAAAA	2	10	2365736	2365745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
345	NC_015428	ATCGG	2	10	2370374	2370383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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349	NC_015428	TGGGC	2	10	2393808	2393817	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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361	NC_015428	ATTTG	2	10	2477598	2477607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.