MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 34508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015428	AAT	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015428	GTT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015428	GCA	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700396
4	NC_015428	ATT	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700396
5	NC_015428	TAA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700396
6	NC_015428	ATC	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
7	NC_015428	TAT	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700396
8	NC_015428	GCT	2	6	771	776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700396
9	NC_015428	GAA	2	6	789	794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
10	NC_015428	TGG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700396
11	NC_015428	ATC	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
12	NC_015428	TCA	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
13	NC_015428	GAA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
14	NC_015428	TCG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700396
15	NC_015428	TGA	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700396
16	NC_015428	AAG	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
17	NC_015428	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700396
18	NC_015428	TTC	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700396
19	NC_015428	CCG	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331700396
20	NC_015428	GGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700396
21	NC_015428	ATC	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700396
22	NC_015428	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015428	ACC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700397
24	NC_015428	GAT	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
25	NC_015428	TTC	2	6	2145	2150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700397
26	NC_015428	GAT	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
27	NC_015428	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700397
28	NC_015428	ATT	2	6	2337	2342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700397
29	NC_015428	GTC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700397
30	NC_015428	GAT	2	6	2543	2548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
31	NC_015428	TGA	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700397
32	NC_015428	GAA	2	6	2844	2849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700397
33	NC_015428	CAA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015428	GTT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015428	TGC	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015428	AGA	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700398
37	NC_015428	ATT	2	6	3417	3422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700398
38	NC_015428	GGC	2	6	3429	3434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700398
39	NC_015428	ACA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700398
40	NC_015428	CAC	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
41	NC_015428	CGG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700399
42	NC_015428	CAC	2	6	4255	4260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
43	NC_015428	TGC	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700399
44	NC_015428	CCA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
45	NC_015428	TGA	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700399
46	NC_015428	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700399
47	NC_015428	CAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700399
48	NC_015428	TGA	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700399
49	NC_015428	TAT	2	6	4515	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700399
50	NC_015428	TGA	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700399
51	NC_015428	TTA	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700399
52	NC_015428	ACC	3	9	4604	4612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700399
53	NC_015428	CAG	2	6	4628	4633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700399
54	NC_015428	CGA	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
55	NC_015428	ATG	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
56	NC_015428	TCA	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
57	NC_015428	TGA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
58	NC_015428	CCA	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700400
59	NC_015428	ACA	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700400
60	NC_015428	TGA	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
61	NC_015428	AGA	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700400
62	NC_015428	TTC	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700400
63	NC_015428	GGT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700400
64	NC_015428	GGC	3	9	5051	5059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700400
65	NC_015428	TGG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700400
66	NC_015428	GTT	2	6	5102	5107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
67	NC_015428	TAC	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
68	NC_015428	GTC	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700400
69	NC_015428	GAT	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
70	NC_015428	ACT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
71	NC_015428	TTG	2	6	5352	5357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
72	NC_015428	TTG	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
73	NC_015428	TAA	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700400
74	NC_015428	GAA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700400
75	NC_015428	ACG	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
76	NC_015428	TGT	2	6	5713	5718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
77	NC_015428	TTG	2	6	5862	5867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
78	NC_015428	CAG	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
79	NC_015428	TCG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700400
80	NC_015428	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700400
81	NC_015428	GAA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700400
82	NC_015428	ATT	2	6	6157	6162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700400
83	NC_015428	ATC	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700400
84	NC_015428	TGT	2	6	6273	6278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700400
85	NC_015428	GAT	3	9	6392	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700400
86	NC_015428	TCC	2	6	6539	6544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331700400
87	NC_015428	TCT	2	6	6567	6572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700400
88	NC_015428	ACG	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700400
89	NC_015428	GCT	2	6	6657	6662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015428	TAA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015428	AAT	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015428	ATG	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
93	NC_015428	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700401
94	NC_015428	TCG	2	6	6885	6890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
95	NC_015428	CCG	2	6	6998	7003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331700401
96	NC_015428	TGC	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
97	NC_015428	CAA	2	6	7164	7169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700401
98	NC_015428	ATG	2	6	7196	7201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
99	NC_015428	TCA	2	6	7319	7324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700401
100	NC_015428	TGA	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
101	NC_015428	CAG	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700401
102	NC_015428	CGG	2	6	7407	7412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700401
103	NC_015428	ATT	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700401
104	NC_015428	CGG	2	6	7506	7511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700401
105	NC_015428	CAA	2	6	7551	7556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700401
106	NC_015428	ATG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
107	NC_015428	TCG	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
108	NC_015428	TAT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700401
109	NC_015428	ACG	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700401
110	NC_015428	TGA	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
111	NC_015428	TGA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
112	NC_015428	GAA	2	6	8101	8106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700401
113	NC_015428	ATT	2	6	8160	8165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700401
114	NC_015428	ACG	2	6	8193	8198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700401
115	NC_015428	TGG	2	6	8210	8215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700401
116	NC_015428	GAA	3	9	8251	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700401
117	NC_015428	GTG	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700401
118	NC_015428	GTG	2	6	8342	8347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700401
119	NC_015428	GAT	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
120	NC_015428	TGT	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700401
121	NC_015428	GTA	2	6	8654	8659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
122	NC_015428	GAT	3	9	8686	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
123	NC_015428	TGC	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
124	NC_015428	GCT	2	6	8926	8931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700401
125	NC_015428	CAT	2	6	9036	9041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700401
126	NC_015428	GAT	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
127	NC_015428	TGA	2	6	9234	9239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700401
128	NC_015428	TGT	2	6	9473	9478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700402
129	NC_015428	GAA	2	6	9504	9509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700402
130	NC_015428	GAA	2	6	9540	9545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700402
131	NC_015428	TCG	2	6	9586	9591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700402
132	NC_015428	AAC	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700402
133	NC_015428	ATG	2	6	9732	9737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700402
134	NC_015428	TGG	2	6	9809	9814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700402
135	NC_015428	CTG	2	6	9859	9864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700402
136	NC_015428	TTC	2	6	9888	9893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700402
137	NC_015428	ACT	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700402
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139	NC_015428	TGC	2	6	10109	10114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700402
140	NC_015428	GCT	2	6	10116	10121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700402
141	NC_015428	CGA	2	6	10136	10141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700402
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143	NC_015428	AGA	2	6	10202	10207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700402
144	NC_015428	TGG	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700402
145	NC_015428	CAT	2	6	10288	10293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700402
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147	NC_015428	TGA	2	6	10490	10495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700402
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149	NC_015428	TCT	2	6	10556	10561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700402
150	NC_015428	ATC	2	6	10595	10600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015428	ATG	2	6	10644	10649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015428	ATA	2	6	10654	10659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015428	TGC	2	6	10678	10683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015428	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015428	ATT	2	6	10746	10751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015428	GTT	2	6	10811	10816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700403
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159	NC_015428	ATT	2	6	11154	11159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015428	ATT	2	6	11165	11170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015428	ATT	2	6	11187	11192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015428	AAT	2	6	11204	11209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015428	GGT	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015428	TAT	2	6	11286	11291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_015428	GAG	2	6	12296	12301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015428	GGC	2	6	12328	12333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700406
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228	NC_015428	ACC	2	6	14352	14357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
229	NC_015428	ACT	2	6	14382	14387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
230	NC_015428	ATT	2	6	14406	14411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_015428	TGA	2	6	14429	14434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
232	NC_015428	AAT	2	6	14515	14520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_015428	ATA	2	6	14626	14631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_015428	CAT	2	6	15830	15835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700408
258	NC_015428	CTT	2	6	15902	15907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700408
259	NC_015428	AGA	2	6	15986	15991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700408
260	NC_015428	ATT	2	6	15993	15998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700408
261	NC_015428	GTT	2	6	16026	16031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700408
262	NC_015428	TCA	2	6	16193	16198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_015428	CCA	2	6	16212	16217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_015428	ATA	2	6	16221	16226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_015428	TAT	2	6	16264	16269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015428	GTG	2	6	16309	16314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700409
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343	NC_015428	GAT	2	6	20441	20446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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359	NC_015428	ATT	2	6	21716	21721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_015428	GTT	2	6	23033	23038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
383	NC_015428	CCT	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
384	NC_015428	CAA	2	6	23085	23090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_015428	CAA	2	6	23198	23203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700414
386	NC_015428	TCC	2	6	23259	23264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331700414
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420	NC_015428	TTA	2	6	26217	26222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_015428	AGG	2	6	26262	26267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_015428	TGA	2	6	32394	32399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700429
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495	NC_015428	ATA	2	6	32502	32507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700429
496	NC_015428	GTT	2	6	32855	32860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700430
497	NC_015428	ATA	2	6	32875	32880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700430
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500	NC_015428	CTA	2	6	33005	33010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700430

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