MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	AATAA	2	10	60	69	80 %	20 %	0 %	0 %	331270708
2	NC_015427	TCTAA	2	10	618	627	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015427	ATTTT	2	10	2134	2143	20 %	80 %	0 %	0 %	331270709
4	NC_015427	TATCT	2	10	2250	2259	20 %	60 %	0 %	20 %	331270709
5	NC_015427	ACCAA	2	10	2666	2675	60 %	0 %	0 %	40 %	331270710
6	NC_015427	TTTTA	2	10	2798	2807	20 %	80 %	0 %	0 %	331270710
7	NC_015427	AGAAT	2	10	3335	3344	60 %	20 %	20 %	0 %	331270710
8	NC_015427	ATTGA	2	10	3386	3395	40 %	40 %	20 %	0 %	331270710
9	NC_015427	TAATA	2	10	3695	3704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015427	TTATA	2	10	3948	3957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015427	AAGAT	2	10	4192	4201	60 %	20 %	20 %	0 %	331270711
12	NC_015427	TCAAT	2	10	5252	5261	40 %	40 %	0 %	20 %	331270712
13	NC_015427	GATAA	2	10	7795	7804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015427	TATCT	2	10	7908	7917	20 %	60 %	0 %	20 %	331270715
15	NC_015427	AATTT	2	10	7953	7962	40 %	60 %	0 %	0 %	331270715
16	NC_015427	ATTAG	2	10	8600	8609	40 %	40 %	20 %	0 %	331270715
17	NC_015427	ATTTA	2	10	9814	9823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015427	AAATA	2	10	10302	10311	80 %	20 %	0 %	0 %	331270720
19	NC_015427	TTATC	2	10	10732	10741	20 %	60 %	0 %	20 %	331270721
20	NC_015427	CATAT	2	10	11408	11417	40 %	40 %	0 %	20 %	331270721
21	NC_015427	ATAAA	2	10	11890	11899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015427	TATCT	2	10	11922	11931	20 %	60 %	0 %	20 %	331270722
23	NC_015427	TGTCC	2	10	13363	13372	0 %	40 %	20 %	40 %	331270723
24	NC_015427	GTTCT	2	10	13877	13886	0 %	60 %	20 %	20 %	331270723
25	NC_015427	TTCTT	2	10	15425	15434	0 %	80 %	0 %	20 %	331270725
26	NC_015427	TAAAT	2	10	15779	15788	60 %	40 %	0 %	0 %	331270725
27	NC_015427	TAAAT	2	10	16091	16100	60 %	40 %	0 %	0 %	331270725
28	NC_015427	TTATT	2	10	16167	16176	20 %	80 %	0 %	0 %	331270726
29	NC_015427	ATTTA	2	10	20333	20342	40 %	60 %	0 %	0 %	331270727
30	NC_015427	TATTT	2	10	24165	24174	20 %	80 %	0 %	0 %	331270733
31	NC_015427	ATTTT	2	10	25798	25807	20 %	80 %	0 %	0 %	331270734
32	NC_015427	ATTTT	2	10	25877	25886	20 %	80 %	0 %	0 %	331270735
33	NC_015427	TGTTT	2	10	27703	27712	0 %	80 %	20 %	0 %	331270736
34	NC_015427	GTCTG	2	10	30187	30196	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015427	TTTCT	2	10	30291	30300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015427	GTATA	2	10	30520	30529	40 %	40 %	20 %	0 %	331270739
37	NC_015427	ATCTT	2	10	31051	31060	20 %	60 %	0 %	20 %	331270740
38	NC_015427	AATAT	2	10	31811	31820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015427	TTCAT	2	10	32016	32025	20 %	60 %	0 %	20 %	331270743
40	NC_015427	TTTTC	2	10	32341	32350	0 %	80 %	0 %	20 %	331270743
41	NC_015427	CCTCA	2	10	32545	32554	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_015427	CTGCT	2	10	33434	33443	0 %	40 %	20 %	40 %	331270746
43	NC_015427	CATTT	2	10	35706	35715	20 %	60 %	0 %	20 %	331270752
44	NC_015427	TTGTT	2	10	35796	35805	0 %	80 %	20 %	0 %	331270752
45	NC_015427	TAATT	2	10	37020	37029	40 %	60 %	0 %	0 %	331270755

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.