MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	AATC	2	8	126	133	50 %	25 %	0 %	25 %	331270708
2	NC_015427	TAAA	2	8	244	251	75 %	25 %	0 %	0 %	331270708
3	NC_015427	TGAT	2	8	1647	1654	25 %	50 %	25 %	0 %	331270709
4	NC_015427	ATAA	2	8	1952	1959	75 %	25 %	0 %	0 %	331270709
5	NC_015427	CATT	2	8	2041	2048	25 %	50 %	0 %	25 %	331270709
6	NC_015427	TTTA	2	8	2597	2604	25 %	75 %	0 %	0 %	331270710
7	NC_015427	TTCA	2	8	2858	2865	25 %	50 %	0 %	25 %	331270710
8	NC_015427	TTAT	2	8	2967	2974	25 %	75 %	0 %	0 %	331270710
9	NC_015427	TCTA	2	8	3149	3156	25 %	50 %	0 %	25 %	331270710
10	NC_015427	TAAT	2	8	3280	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	331270710
11	NC_015427	TAAG	2	8	4123	4130	50 %	25 %	25 %	0 %	331270711
12	NC_015427	ATTC	2	8	4394	4401	25 %	50 %	0 %	25 %	331270711
13	NC_015427	AAAT	2	8	4414	4421	75 %	25 %	0 %	0 %	331270711
14	NC_015427	ATAG	2	8	4506	4513	50 %	25 %	25 %	0 %	331270711
15	NC_015427	AAAG	2	8	4782	4789	75 %	0 %	25 %	0 %	331270711
16	NC_015427	GATA	2	8	4899	4906	50 %	25 %	25 %	0 %	331270711
17	NC_015427	AAAG	2	8	5343	5350	75 %	0 %	25 %	0 %	331270712
18	NC_015427	ATAG	2	8	6019	6026	50 %	25 %	25 %	0 %	331270713
19	NC_015427	ATTT	2	8	8022	8029	25 %	75 %	0 %	0 %	331270715
20	NC_015427	TAAA	2	8	8115	8122	75 %	25 %	0 %	0 %	331270715
21	NC_015427	AAAG	2	8	8204	8211	75 %	0 %	25 %	0 %	331270715
22	NC_015427	TTGG	2	8	8313	8320	0 %	50 %	50 %	0 %	331270715
23	NC_015427	AATG	2	8	9189	9196	50 %	25 %	25 %	0 %	331270717
24	NC_015427	ATAA	2	8	9258	9265	75 %	25 %	0 %	0 %	331270717
25	NC_015427	AATA	2	8	9438	9445	75 %	25 %	0 %	0 %	331270717
26	NC_015427	GAAA	2	8	9970	9977	75 %	0 %	25 %	0 %	331270719
27	NC_015427	AACT	2	8	10505	10512	50 %	25 %	0 %	25 %	331270720
28	NC_015427	AAAT	2	8	10520	10527	75 %	25 %	0 %	0 %	331270720
29	NC_015427	ATAA	2	8	11172	11179	75 %	25 %	0 %	0 %	331270721
30	NC_015427	CATT	2	8	11190	11197	25 %	50 %	0 %	25 %	331270721
31	NC_015427	TCTA	2	8	11231	11238	25 %	50 %	0 %	25 %	331270721
32	NC_015427	AATC	2	8	11333	11340	50 %	25 %	0 %	25 %	331270721
33	NC_015427	CTTC	2	8	11400	11407	0 %	50 %	0 %	50 %	331270721
34	NC_015427	ATTT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	331270721
35	NC_015427	AAAT	2	8	11711	11718	75 %	25 %	0 %	0 %	331270721
36	NC_015427	CCAG	2	8	11750	11757	25 %	0 %	25 %	50 %	331270721
37	NC_015427	TGAT	2	8	12021	12028	25 %	50 %	25 %	0 %	331270722
38	NC_015427	ATTT	2	8	13120	13127	25 %	75 %	0 %	0 %	331270723
39	NC_015427	CTAT	2	8	13233	13240	25 %	50 %	0 %	25 %	331270723
40	NC_015427	ATCT	2	8	13399	13406	25 %	50 %	0 %	25 %	331270723
41	NC_015427	TAGA	2	8	13522	13529	50 %	25 %	25 %	0 %	331270723
42	NC_015427	ATTT	2	8	13655	13662	25 %	75 %	0 %	0 %	331270723
43	NC_015427	ATTA	2	8	13901	13908	50 %	50 %	0 %	0 %	331270723
44	NC_015427	ACCT	2	8	13917	13924	25 %	25 %	0 %	50 %	331270723
45	NC_015427	AATT	2	8	14100	14107	50 %	50 %	0 %	0 %	331270724
46	NC_015427	TTTG	2	8	15594	15601	0 %	75 %	25 %	0 %	331270725
47	NC_015427	TAAA	2	8	15805	15812	75 %	25 %	0 %	0 %	331270725
48	NC_015427	ACTA	2	8	15905	15912	50 %	25 %	0 %	25 %	331270725
49	NC_015427	TTAT	2	8	16304	16311	25 %	75 %	0 %	0 %	331270726
50	NC_015427	ATTT	2	8	16503	16510	25 %	75 %	0 %	0 %	331270726
51	NC_015427	TCCC	2	8	16566	16573	0 %	25 %	0 %	75 %	331270726
52	NC_015427	CTTG	2	8	16833	16840	0 %	50 %	25 %	25 %	331270727
53	NC_015427	ATCT	2	8	17110	17117	25 %	50 %	0 %	25 %	331270727
54	NC_015427	CTTT	2	8	17373	17380	0 %	75 %	0 %	25 %	331270727
55	NC_015427	CTTT	2	8	17427	17434	0 %	75 %	0 %	25 %	331270727
56	NC_015427	TTAA	2	8	17457	17464	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
57	NC_015427	CTTT	2	8	18108	18115	0 %	75 %	0 %	25 %	331270727
58	NC_015427	CTTT	2	8	18297	18304	0 %	75 %	0 %	25 %	331270727
59	NC_015427	TGTT	2	8	18366	18373	0 %	75 %	25 %	0 %	331270727
60	NC_015427	GTTT	2	8	18707	18714	0 %	75 %	25 %	0 %	331270727
61	NC_015427	TTTG	2	8	19082	19089	0 %	75 %	25 %	0 %	331270727
62	NC_015427	TTTC	2	8	19237	19244	0 %	75 %	0 %	25 %	331270727
63	NC_015427	ATTT	2	8	19493	19500	25 %	75 %	0 %	0 %	331270727
64	NC_015427	ATTT	2	8	19585	19592	25 %	75 %	0 %	0 %	331270727
65	NC_015427	TACT	2	8	19654	19661	25 %	50 %	0 %	25 %	331270727
66	NC_015427	CTAC	2	8	19884	19891	25 %	25 %	0 %	50 %	331270727
67	NC_015427	GCCA	2	8	20288	20295	25 %	0 %	25 %	50 %	331270727
68	NC_015427	GTAA	2	8	20634	20641	50 %	25 %	25 %	0 %	331270727
69	NC_015427	CTTT	2	8	20671	20678	0 %	75 %	0 %	25 %	331270727
70	NC_015427	TAAT	2	8	22644	22651	50 %	50 %	0 %	0 %	331270729
71	NC_015427	ATTT	2	8	22974	22981	25 %	75 %	0 %	0 %	331270730
72	NC_015427	ATTA	2	8	23260	23267	50 %	50 %	0 %	0 %	331270731
73	NC_015427	TTAT	2	8	23587	23594	25 %	75 %	0 %	0 %	331270731
74	NC_015427	ATTT	2	8	23683	23690	25 %	75 %	0 %	0 %	331270732
75	NC_015427	TTTC	2	8	23727	23734	0 %	75 %	0 %	25 %	331270732
76	NC_015427	ACTT	2	8	23893	23900	25 %	50 %	0 %	25 %	331270732
77	NC_015427	CCAA	2	8	25277	25284	50 %	0 %	0 %	50 %	331270734
78	NC_015427	TAAA	2	8	25337	25344	75 %	25 %	0 %	0 %	331270734
79	NC_015427	TTCT	2	8	25497	25504	0 %	75 %	0 %	25 %	331270734
80	NC_015427	CTAT	2	8	25522	25529	25 %	50 %	0 %	25 %	331270734
81	NC_015427	ATTT	2	8	26305	26312	25 %	75 %	0 %	0 %	331270735
82	NC_015427	ATAA	2	8	26440	26447	75 %	25 %	0 %	0 %	331270735
83	NC_015427	AAAT	2	8	26513	26520	75 %	25 %	0 %	0 %	331270735
84	NC_015427	TATT	2	8	26576	26583	25 %	75 %	0 %	0 %	331270735
85	NC_015427	TTTA	2	8	26674	26681	25 %	75 %	0 %	0 %	331270736
86	NC_015427	ATTT	2	8	26851	26858	25 %	75 %	0 %	0 %	331270736
87	NC_015427	CTTT	2	8	27329	27336	0 %	75 %	0 %	25 %	331270736
88	NC_015427	ATTA	2	8	27361	27368	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
89	NC_015427	TTGA	2	8	27523	27530	25 %	50 %	25 %	0 %	331270736
90	NC_015427	CCAT	2	8	27689	27696	25 %	25 %	0 %	50 %	331270736
91	NC_015427	TTGT	2	8	27797	27804	0 %	75 %	25 %	0 %	331270737
92	NC_015427	TATC	2	8	29252	29259	25 %	50 %	0 %	25 %	331270737
93	NC_015427	TTTC	2	8	29296	29303	0 %	75 %	0 %	25 %	331270737
94	NC_015427	TTCA	2	8	29878	29885	25 %	50 %	0 %	25 %	331270738
95	NC_015427	TTTC	2	8	30487	30494	0 %	75 %	0 %	25 %	331270739
96	NC_015427	ATTC	2	8	30583	30590	25 %	50 %	0 %	25 %	331270739
97	NC_015427	CTTT	2	8	30619	30626	0 %	75 %	0 %	25 %	331270739
98	NC_015427	TTTC	2	8	30937	30944	0 %	75 %	0 %	25 %	331270739
99	NC_015427	ATTT	2	8	31100	31107	25 %	75 %	0 %	0 %	331270740
100	NC_015427	TCTT	2	8	31375	31382	0 %	75 %	0 %	25 %	331270741
101	NC_015427	TTTC	2	8	31585	31592	0 %	75 %	0 %	25 %	331270742
102	NC_015427	TCTT	2	8	32134	32141	0 %	75 %	0 %	25 %	331270743
103	NC_015427	TTCT	2	8	32294	32301	0 %	75 %	0 %	25 %	331270743
104	NC_015427	ATTT	3	12	32308	32319	25 %	75 %	0 %	0 %	331270743
105	NC_015427	ATTT	2	8	32825	32832	25 %	75 %	0 %	0 %	331270744
106	NC_015427	TGTA	2	8	32870	32877	25 %	50 %	25 %	0 %	331270744
107	NC_015427	CTTT	2	8	32955	32962	0 %	75 %	0 %	25 %	331270744
108	NC_015427	CTTT	2	8	33110	33117	0 %	75 %	0 %	25 %	331270744
109	NC_015427	ATTT	2	8	33215	33222	25 %	75 %	0 %	0 %	331270745
110	NC_015427	TTAT	2	8	33482	33489	25 %	75 %	0 %	0 %	331270747
111	NC_015427	TCAC	2	8	33759	33766	25 %	25 %	0 %	50 %	331270747
112	NC_015427	TCCA	2	8	34088	34095	25 %	25 %	0 %	50 %	331270748
113	NC_015427	ATAA	2	8	34292	34299	75 %	25 %	0 %	0 %	331270748
114	NC_015427	TAAA	2	8	34458	34465	75 %	25 %	0 %	0 %	331270748
115	NC_015427	ACTT	2	8	34862	34869	25 %	50 %	0 %	25 %	331270750
116	NC_015427	CTAT	2	8	35207	35214	25 %	50 %	0 %	25 %	331270750
117	NC_015427	TTTA	2	8	35573	35580	25 %	75 %	0 %	0 %	331270751
118	NC_015427	TTTC	2	8	36142	36149	0 %	75 %	0 %	25 %	331270754
119	NC_015427	TAAT	2	8	36335	36342	50 %	50 %	0 %	0 %	331270755
120	NC_015427	TTTA	2	8	37117	37124	25 %	75 %	0 %	0 %	331270756
121	NC_015427	TTTC	2	8	37754	37761	0 %	75 %	0 %	25 %	331270757
122	NC_015427	ATTA	2	8	38194	38201	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
123	NC_015427	TGTT	2	8	39537	39544	0 %	75 %	25 %	0 %	331270760

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.