MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	ATA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015427	TTA	2	6	477	482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015427	TAT	2	6	542	547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015427	TCC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015427	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015427	AGG	2	6	819	824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015427	CTT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015427	TAG	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015427	ACA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015427	ATT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015427	TAA	2	6	1250	1255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015427	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015427	TCC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015427	ATA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015427	GGT	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015427	TGT	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015427	CCT	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015427	ATT	2	6	3803	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015427	ATA	2	6	3814	3819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015427	TTA	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015427	TAA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015427	CAA	2	6	5785	5790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015427	TAG	3	9	6180	6188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015427	TCT	2	6	6375	6380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015427	ATT	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015427	TAT	2	6	6671	6676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015427	ATT	2	6	6750	6755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015427	TCT	2	6	6877	6882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015427	TTA	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015427	GCA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015427	GCC	2	6	6963	6968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015427	TAT	2	6	6978	6983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015427	CCA	2	6	7008	7013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015427	TAT	2	6	7150	7155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015427	GTT	2	6	7551	7556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015427	ATG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015427	ATT	2	6	7711	7716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015427	TAT	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015427	ATT	2	6	9121	9126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015427	AGG	2	6	9489	9494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015427	GTT	2	6	9495	9500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015427	CCT	2	6	10631	10636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015427	CCA	2	6	10678	10683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015427	CAA	2	6	11904	11909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015427	TAA	2	6	12218	12223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015427	ATT	2	6	14523	14528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015427	ATT	2	6	14539	14544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015427	TTA	2	6	14608	14613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015427	TAT	2	6	14660	14665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015427	ATC	2	6	16651	16656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015427	TCA	2	6	16664	16669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015427	CTT	2	6	16688	16693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015427	CCT	2	6	22113	22118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015427	TTC	2	6	22119	22124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015427	CCT	2	6	22363	22368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015427	ATC	2	6	22394	22399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015427	TCC	2	6	22670	22675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015427	AAT	2	6	23670	23675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015427	ATT	2	6	24501	24506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015427	TAA	2	6	24528	24533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015427	ATT	2	6	24552	24557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015427	AAT	2	6	24560	24565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015427	AAT	2	6	24593	24598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015427	ATC	2	6	24638	24643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015427	TTC	2	6	24665	24670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015427	ACT	2	6	27736	27741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015427	TTG	2	6	29386	29391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015427	TTG	2	6	29935	29940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015427	GAA	2	6	29962	29967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015427	ACC	2	6	30072	30077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015427	ATG	2	6	30109	30114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015427	GAA	2	6	30129	30134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015427	ATA	2	6	30159	30164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015427	ATG	2	6	30214	30219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015427	TTA	2	6	30302	30307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015427	GTT	2	6	30317	30322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015427	TCC	2	6	31296	31301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015427	CTT	2	6	31459	31464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015427	CTT	2	6	31708	31713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015427	TCA	2	6	31748	31753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015427	CCT	2	6	31805	31810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015427	ATT	2	6	31837	31842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015427	TGT	2	6	31845	31850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015427	ATT	2	6	31906	31911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015427	TTC	2	6	32713	32718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015427	ATT	2	6	32753	32758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015427	AGT	2	6	33915	33920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015427	TTA	2	6	33947	33952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015427	ATT	2	6	34018	34023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015427	CTA	2	6	37791	37796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015427	TCT	2	6	37807	37812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015427	GTT	2	6	37871	37876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015427	CCT	2	6	39563	39568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015427	TCG	2	6	39569	39574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.