MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	TA	3	6	30	35	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015427	AT	3	6	491	496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015427	TA	3	6	597	602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015427	TA	3	6	628	633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015427	AC	3	6	1070	1075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015427	TA	3	6	1887	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
7	NC_015427	AT	3	6	2111	2116	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
8	NC_015427	AT	3	6	2240	2245	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
9	NC_015427	TA	3	6	2443	2448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015427	AT	4	8	3124	3131	50 %	50 %	0 %	0 %	331270710
11	NC_015427	TA	3	6	3518	3523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015427	TA	4	8	3531	3538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015427	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015427	TG	3	6	3734	3739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015427	TA	3	6	3829	3834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015427	TA	3	6	3842	3847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015427	AT	4	8	3925	3932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015427	AT	3	6	3940	3945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015427	TA	3	6	4005	4010	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
20	NC_015427	TA	5	10	4323	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
21	NC_015427	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
22	NC_015427	TA	4	8	4571	4578	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
23	NC_015427	AT	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015427	AG	3	6	5661	5666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015427	AT	3	6	5799	5804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015427	TA	3	6	6228	6233	50 %	50 %	0 %	0 %	331270714
27	NC_015427	AT	3	6	6390	6395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015427	TA	3	6	7088	7093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015427	TA	3	6	7167	7172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015427	TA	3	6	7216	7221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015427	TA	3	6	7241	7246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015427	TA	3	6	7265	7270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015427	TA	3	6	7704	7709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015427	AT	3	6	7774	7779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015427	TA	3	6	8450	8455	50 %	50 %	0 %	0 %	331270715
36	NC_015427	AG	3	6	8983	8988	50 %	0 %	50 %	0 %	331270716
37	NC_015427	TA	3	6	9608	9613	50 %	50 %	0 %	0 %	331270718
38	NC_015427	TA	3	6	9671	9676	50 %	50 %	0 %	0 %	331270718
39	NC_015427	TA	3	6	9879	9884	50 %	50 %	0 %	0 %	331270719
40	NC_015427	AT	3	6	10072	10077	50 %	50 %	0 %	0 %	331270719
41	NC_015427	TA	3	6	10119	10124	50 %	50 %	0 %	0 %	331270719
42	NC_015427	AT	4	8	10352	10359	50 %	50 %	0 %	0 %	331270720
43	NC_015427	TA	3	6	10656	10661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015427	TA	3	6	11459	11464	50 %	50 %	0 %	0 %	331270721
45	NC_015427	TA	3	6	12343	12348	50 %	50 %	0 %	0 %	331270723
46	NC_015427	TA	3	6	13894	13899	50 %	50 %	0 %	0 %	331270723
47	NC_015427	TA	3	6	14783	14788	50 %	50 %	0 %	0 %	331270725
48	NC_015427	GT	3	6	15614	15619	0 %	50 %	50 %	0 %	331270725
49	NC_015427	TC	3	6	15623	15628	0 %	50 %	0 %	50 %	331270725
50	NC_015427	AT	3	6	15702	15707	50 %	50 %	0 %	0 %	331270725
51	NC_015427	TA	3	6	15759	15764	50 %	50 %	0 %	0 %	331270725
52	NC_015427	TA	4	8	16380	16387	50 %	50 %	0 %	0 %	331270726
53	NC_015427	AT	3	6	18835	18840	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
54	NC_015427	TC	3	6	19181	19186	0 %	50 %	0 %	50 %	331270727
55	NC_015427	CT	4	8	19312	19319	0 %	50 %	0 %	50 %	331270727
56	NC_015427	AT	3	6	21109	21114	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
57	NC_015427	TA	3	6	21379	21384	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
58	NC_015427	TA	3	6	22182	22187	50 %	50 %	0 %	0 %	331270728
59	NC_015427	AT	3	6	22265	22270	50 %	50 %	0 %	0 %	331270728
60	NC_015427	TA	3	6	22319	22324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015427	AT	4	8	22498	22505	50 %	50 %	0 %	0 %	331270729
62	NC_015427	TA	3	6	23436	23441	50 %	50 %	0 %	0 %	331270731
63	NC_015427	TA	3	6	23508	23513	50 %	50 %	0 %	0 %	331270731
64	NC_015427	AT	3	6	24625	24630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015427	CT	3	6	25628	25633	0 %	50 %	0 %	50 %	331270734
66	NC_015427	TA	4	8	26296	26303	50 %	50 %	0 %	0 %	331270735
67	NC_015427	AT	3	6	26356	26361	50 %	50 %	0 %	0 %	331270735
68	NC_015427	AT	3	6	26988	26993	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
69	NC_015427	TA	3	6	26998	27003	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
70	NC_015427	TA	3	6	27223	27228	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
71	NC_015427	TA	3	6	27483	27488	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
72	NC_015427	TA	3	6	27933	27938	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
73	NC_015427	TA	3	6	28890	28895	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
74	NC_015427	AT	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
75	NC_015427	TC	3	6	29229	29234	0 %	50 %	0 %	50 %	331270737
76	NC_015427	AT	3	6	29368	29373	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
77	NC_015427	GT	3	6	29641	29646	0 %	50 %	50 %	0 %	331270738
78	NC_015427	CA	3	6	30220	30225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015427	CT	3	6	30428	30433	0 %	50 %	0 %	50 %	331270739
80	NC_015427	TA	3	6	30665	30670	50 %	50 %	0 %	0 %	331270739
81	NC_015427	CT	3	6	31009	31014	0 %	50 %	0 %	50 %	331270740
82	NC_015427	AT	3	6	32040	32045	50 %	50 %	0 %	0 %	331270743
83	NC_015427	AT	3	6	32357	32362	50 %	50 %	0 %	0 %	331270743
84	NC_015427	AT	3	6	32401	32406	50 %	50 %	0 %	0 %	331270743
85	NC_015427	TA	4	8	32767	32774	50 %	50 %	0 %	0 %	331270744
86	NC_015427	AT	3	6	33131	33136	50 %	50 %	0 %	0 %	331270744
87	NC_015427	TA	3	6	33359	33364	50 %	50 %	0 %	0 %	331270746
88	NC_015427	TA	3	6	33880	33885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015427	TA	3	6	34353	34358	50 %	50 %	0 %	0 %	331270748
90	NC_015427	TA	3	6	34820	34825	50 %	50 %	0 %	0 %	331270749
91	NC_015427	CT	3	6	35562	35567	0 %	50 %	0 %	50 %	331270751
92	NC_015427	AT	3	6	35678	35683	50 %	50 %	0 %	0 %	331270752
93	NC_015427	AT	3	6	35854	35859	50 %	50 %	0 %	0 %	331270753
94	NC_015427	TA	3	6	36248	36253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015427	TC	3	6	36771	36776	0 %	50 %	0 %	50 %	331270755
96	NC_015427	AT	3	6	36869	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	331270755
97	NC_015427	TC	3	6	36910	36915	0 %	50 %	0 %	50 %	331270755
98	NC_015427	TA	3	6	37086	37091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015427	TA	3	6	37189	37194	50 %	50 %	0 %	0 %	331270756
100	NC_015427	AT	3	6	37302	37307	50 %	50 %	0 %	0 %	331270757
101	NC_015427	CA	4	8	37364	37371	50 %	0 %	0 %	50 %	331270757
102	NC_015427	TA	3	6	38008	38013	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
103	NC_015427	AT	3	6	38133	38138	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
104	NC_015427	TA	3	6	38398	38403	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
105	NC_015427	AT	3	6	38557	38562	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
106	NC_015427	CT	3	6	38634	38639	0 %	50 %	0 %	50 %	331270759
107	NC_015427	TC	3	6	39246	39251	0 %	50 %	0 %	50 %	331270759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.