MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015427	TA	3	6	1887	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
2	NC_015427	AT	3	6	2111	2116	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
3	NC_015427	AT	3	6	2240	2245	50 %	50 %	0 %	0 %	331270709
4	NC_015427	AT	4	8	3124	3131	50 %	50 %	0 %	0 %	331270710
5	NC_015427	TA	3	6	4005	4010	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
6	NC_015427	TA	5	10	4323	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
7	NC_015427	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
8	NC_015427	TA	4	8	4571	4578	50 %	50 %	0 %	0 %	331270711
9	NC_015427	TA	3	6	6228	6233	50 %	50 %	0 %	0 %	331270714
10	NC_015427	TA	3	6	8450	8455	50 %	50 %	0 %	0 %	331270715
11	NC_015427	AG	3	6	8983	8988	50 %	0 %	50 %	0 %	331270716
12	NC_015427	TA	3	6	9608	9613	50 %	50 %	0 %	0 %	331270718
13	NC_015427	TA	3	6	9671	9676	50 %	50 %	0 %	0 %	331270718
14	NC_015427	TA	3	6	9879	9884	50 %	50 %	0 %	0 %	331270719
15	NC_015427	AT	3	6	10072	10077	50 %	50 %	0 %	0 %	331270719
16	NC_015427	TA	3	6	10119	10124	50 %	50 %	0 %	0 %	331270719
17	NC_015427	AT	4	8	10352	10359	50 %	50 %	0 %	0 %	331270720
18	NC_015427	TA	3	6	11459	11464	50 %	50 %	0 %	0 %	331270721
19	NC_015427	TA	3	6	12343	12348	50 %	50 %	0 %	0 %	331270723
20	NC_015427	TA	3	6	13894	13899	50 %	50 %	0 %	0 %	331270723
21	NC_015427	TA	3	6	14783	14788	50 %	50 %	0 %	0 %	331270725
22	NC_015427	GT	3	6	15614	15619	0 %	50 %	50 %	0 %	331270725
23	NC_015427	TC	3	6	15623	15628	0 %	50 %	0 %	50 %	331270725
24	NC_015427	AT	3	6	15702	15707	50 %	50 %	0 %	0 %	331270725
25	NC_015427	TA	3	6	15759	15764	50 %	50 %	0 %	0 %	331270725
26	NC_015427	TA	4	8	16380	16387	50 %	50 %	0 %	0 %	331270726
27	NC_015427	AT	3	6	18835	18840	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
28	NC_015427	TC	3	6	19181	19186	0 %	50 %	0 %	50 %	331270727
29	NC_015427	CT	4	8	19312	19319	0 %	50 %	0 %	50 %	331270727
30	NC_015427	AT	3	6	21109	21114	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
31	NC_015427	TA	3	6	21379	21384	50 %	50 %	0 %	0 %	331270727
32	NC_015427	TA	3	6	22182	22187	50 %	50 %	0 %	0 %	331270728
33	NC_015427	AT	3	6	22265	22270	50 %	50 %	0 %	0 %	331270728
34	NC_015427	AT	4	8	22498	22505	50 %	50 %	0 %	0 %	331270729
35	NC_015427	TA	3	6	23436	23441	50 %	50 %	0 %	0 %	331270731
36	NC_015427	TA	3	6	23508	23513	50 %	50 %	0 %	0 %	331270731
37	NC_015427	CT	3	6	25628	25633	0 %	50 %	0 %	50 %	331270734
38	NC_015427	TA	4	8	26296	26303	50 %	50 %	0 %	0 %	331270735
39	NC_015427	AT	3	6	26356	26361	50 %	50 %	0 %	0 %	331270735
40	NC_015427	AT	3	6	26988	26993	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
41	NC_015427	TA	3	6	26998	27003	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
42	NC_015427	TA	3	6	27223	27228	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
43	NC_015427	TA	3	6	27483	27488	50 %	50 %	0 %	0 %	331270736
44	NC_015427	TA	3	6	27933	27938	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
45	NC_015427	TA	3	6	28890	28895	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
46	NC_015427	AT	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
47	NC_015427	TC	3	6	29229	29234	0 %	50 %	0 %	50 %	331270737
48	NC_015427	AT	3	6	29368	29373	50 %	50 %	0 %	0 %	331270737
49	NC_015427	GT	3	6	29641	29646	0 %	50 %	50 %	0 %	331270738
50	NC_015427	CT	3	6	30428	30433	0 %	50 %	0 %	50 %	331270739
51	NC_015427	TA	3	6	30665	30670	50 %	50 %	0 %	0 %	331270739
52	NC_015427	CT	3	6	31009	31014	0 %	50 %	0 %	50 %	331270740
53	NC_015427	AT	3	6	32040	32045	50 %	50 %	0 %	0 %	331270743
54	NC_015427	AT	3	6	32357	32362	50 %	50 %	0 %	0 %	331270743
55	NC_015427	AT	3	6	32401	32406	50 %	50 %	0 %	0 %	331270743
56	NC_015427	TA	4	8	32767	32774	50 %	50 %	0 %	0 %	331270744
57	NC_015427	AT	3	6	33131	33136	50 %	50 %	0 %	0 %	331270744
58	NC_015427	TA	3	6	33359	33364	50 %	50 %	0 %	0 %	331270746
59	NC_015427	TA	3	6	34353	34358	50 %	50 %	0 %	0 %	331270748
60	NC_015427	TA	3	6	34820	34825	50 %	50 %	0 %	0 %	331270749
61	NC_015427	CT	3	6	35562	35567	0 %	50 %	0 %	50 %	331270751
62	NC_015427	AT	3	6	35678	35683	50 %	50 %	0 %	0 %	331270752
63	NC_015427	AT	3	6	35854	35859	50 %	50 %	0 %	0 %	331270753
64	NC_015427	TC	3	6	36771	36776	0 %	50 %	0 %	50 %	331270755
65	NC_015427	AT	3	6	36869	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	331270755
66	NC_015427	TC	3	6	36910	36915	0 %	50 %	0 %	50 %	331270755
67	NC_015427	TA	3	6	37189	37194	50 %	50 %	0 %	0 %	331270756
68	NC_015427	AT	3	6	37302	37307	50 %	50 %	0 %	0 %	331270757
69	NC_015427	CA	4	8	37364	37371	50 %	0 %	0 %	50 %	331270757
70	NC_015427	TA	3	6	38008	38013	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
71	NC_015427	AT	3	6	38133	38138	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
72	NC_015427	TA	3	6	38398	38403	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
73	NC_015427	AT	3	6	38557	38562	50 %	50 %	0 %	0 %	331270758
74	NC_015427	CT	3	6	38634	38639	0 %	50 %	0 %	50 %	331270759
75	NC_015427	TC	3	6	39246	39251	0 %	50 %	0 %	50 %	331270759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.