MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	AGATTA	2	12	2455	2466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270765
2	NC_015426	GATATA	2	12	3887	3898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015426	AAGTGA	2	12	5260	5271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015426	AGGTAA	2	12	6085	6096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270769
5	NC_015426	CCAAAG	2	12	6432	6443	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331270769
6	NC_015426	ATTTAA	2	12	6918	6929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015426	ATTTAA	2	12	6987	6998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015426	CAAATA	2	12	7787	7798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015426	TCTCTT	2	12	8930	8941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015426	GATTTT	2	12	9725	9736	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015426	TAGAAT	2	12	10108	10119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015426	TTTAAT	2	12	10717	10728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015426	TTTAAA	2	12	11010	11021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015426	GAAATG	2	12	20058	20069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270784
15	NC_015426	AAAGAT	2	12	20412	20423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331270784
16	NC_015426	TATAAA	2	12	21225	21236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270785
17	NC_015426	TAAAGT	2	12	22103	22114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015426	AAAATA	2	12	22194	22205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015426	ATTAAA	2	12	23992	24003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270788
20	NC_015426	CATTTC	2	12	28457	28468	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331270792
21	NC_015426	ATTTTT	2	12	28646	28657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270792
22	NC_015426	TTAATT	2	12	29477	29488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015426	CAAATA	2	12	30227	30238	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270794
24	NC_015426	GAACAA	3	18	32578	32595	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270795
25	NC_015426	TTATCT	2	12	35273	35284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270799
26	NC_015426	TCAAAT	2	12	35507	35518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015426	AGGTAA	2	12	36507	36518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270801
28	NC_015426	CCAAAG	2	12	36854	36865	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331270801
29	NC_015426	ATTTAA	2	12	37340	37351	50 %	50 %	0 %	0 %	331270801
30	NC_015426	GCTTTT	2	12	40834	40845	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	331270804
31	NC_015426	TTACAA	2	12	47070	47081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015426	TTTTCA	2	12	47526	47537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270813
33	NC_015426	TTTTAA	2	12	49890	49901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270816
34	NC_015426	TCATTT	2	12	51006	51017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270817
35	NC_015426	TTAAAT	2	12	53660	53671	50 %	50 %	0 %	0 %	331270820
36	NC_015426	CTTTGG	2	12	54146	54157	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331270820
37	NC_015426	TTTACC	2	12	54492	54503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331270820
38	NC_015426	CTTTAT	2	12	57529	57540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015426	TAGTAT	2	12	58391	58402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015426	AACTAA	2	12	58617	58628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270825
41	NC_015426	TTATTT	3	18	59487	59504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015426	ATATTC	2	12	62869	62880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270833
43	NC_015426	ATAATT	2	12	68961	68972	50 %	50 %	0 %	0 %	331270838
44	NC_015426	CTTGAG	2	12	73487	73498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331270843
45	NC_015426	TAATGT	2	12	74412	74423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015426	ATTTAA	2	12	76188	76199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015426	TATCTA	2	12	77888	77899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270848
48	NC_015426	CTATAT	2	12	79358	79369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270848
49	NC_015426	TGCTGA	2	12	79641	79652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331270848
50	NC_015426	AATCCT	2	12	84723	84734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015426	TTAACT	2	12	85738	85749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270856
52	NC_015426	TATTAA	2	12	86059	86070	50 %	50 %	0 %	0 %	331270856
53	NC_015426	TTTCTT	2	12	86129	86140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	331270856
54	NC_015426	TTAATT	2	12	86591	86602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270857
55	NC_015426	TAATTG	2	12	87929	87940	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270858
56	NC_015426	ATTTTA	2	12	90949	90960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015426	ATATTT	2	12	92821	92832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270860
58	NC_015426	TTAACT	2	12	95807	95818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270862
59	NC_015426	TAAAAA	2	12	97868	97879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.