MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	AGATTA	2	12	2455	2466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270765
2	NC_015426	AGGTAA	2	12	6085	6096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270769
3	NC_015426	CCAAAG	2	12	6432	6443	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331270769
4	NC_015426	GAAATG	2	12	20058	20069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270784
5	NC_015426	AAAGAT	2	12	20412	20423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331270784
6	NC_015426	TATAAA	2	12	21225	21236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270785
7	NC_015426	ATTAAA	2	12	23992	24003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270788
8	NC_015426	CATTTC	2	12	28457	28468	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331270792
9	NC_015426	ATTTTT	2	12	28646	28657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270792
10	NC_015426	CAAATA	2	12	30227	30238	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270794
11	NC_015426	GAACAA	3	18	32578	32595	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270795
12	NC_015426	TTATCT	2	12	35273	35284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270799
13	NC_015426	AGGTAA	2	12	36507	36518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270801
14	NC_015426	CCAAAG	2	12	36854	36865	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331270801
15	NC_015426	ATTTAA	2	12	37340	37351	50 %	50 %	0 %	0 %	331270801
16	NC_015426	GCTTTT	2	12	40834	40845	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	331270804
17	NC_015426	TTTTCA	2	12	47526	47537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270813
18	NC_015426	TTTTAA	2	12	49890	49901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270816
19	NC_015426	TCATTT	2	12	51006	51017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270817
20	NC_015426	TTAAAT	2	12	53660	53671	50 %	50 %	0 %	0 %	331270820
21	NC_015426	CTTTGG	2	12	54146	54157	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331270820
22	NC_015426	TTTACC	2	12	54492	54503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331270820
23	NC_015426	AACTAA	2	12	58617	58628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270825
24	NC_015426	ATATTC	2	12	62869	62880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270833
25	NC_015426	ATAATT	2	12	68961	68972	50 %	50 %	0 %	0 %	331270838
26	NC_015426	CTTGAG	2	12	73487	73498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331270843
27	NC_015426	TATCTA	2	12	77888	77899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270848
28	NC_015426	CTATAT	2	12	79358	79369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270848
29	NC_015426	TGCTGA	2	12	79641	79652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331270848
30	NC_015426	TTAACT	2	12	85738	85749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270856
31	NC_015426	TATTAA	2	12	86059	86070	50 %	50 %	0 %	0 %	331270856
32	NC_015426	TTTCTT	2	12	86129	86140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	331270856
33	NC_015426	TTAATT	2	12	86591	86602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270857
34	NC_015426	TAATTG	2	12	87929	87940	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270858
35	NC_015426	ATATTT	2	12	92821	92832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270860
36	NC_015426	TTAACT	2	12	95807	95818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270862

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.