MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	TAAAT	2	10	1188	1197	60 %	40 %	0 %	0 %	331270764
2	NC_015426	CTTTT	2	10	3410	3419	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015426	AATTT	2	10	4973	4982	40 %	60 %	0 %	0 %	331270767
4	NC_015426	AATAT	2	10	5069	5078	60 %	40 %	0 %	0 %	331270767
5	NC_015426	TATAT	2	10	5246	5255	40 %	60 %	0 %	0 %	331270767
6	NC_015426	TAAAT	2	10	5719	5728	60 %	40 %	0 %	0 %	331270769
7	NC_015426	TTTTC	2	10	6242	6251	0 %	80 %	0 %	20 %	331270769
8	NC_015426	AAATT	2	10	6827	6836	60 %	40 %	0 %	0 %	331270769
9	NC_015426	TATTT	2	10	8375	8384	20 %	80 %	0 %	0 %	331270771
10	NC_015426	TATGT	2	10	9106	9115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015426	AAATA	2	10	9833	9842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015426	AGTAA	2	10	10418	10427	60 %	20 %	20 %	0 %	331270773
13	NC_015426	TTATT	2	10	11739	11748	20 %	80 %	0 %	0 %	331270774
14	NC_015426	ATATT	2	10	11772	11781	40 %	60 %	0 %	0 %	331270774
15	NC_015426	AAAGA	2	10	13122	13131	80 %	0 %	20 %	0 %	331270777
16	NC_015426	ATTAT	2	10	13831	13840	40 %	60 %	0 %	0 %	331270777
17	NC_015426	TGAAA	2	10	15425	15434	60 %	20 %	20 %	0 %	331270780
18	NC_015426	TTAAT	2	10	15661	15670	40 %	60 %	0 %	0 %	331270780
19	NC_015426	ATTTT	2	10	15819	15828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015426	ATTTA	2	10	15860	15869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015426	TAAAA	2	10	15978	15987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015426	ATGTA	2	10	16022	16031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015426	TTTAG	2	10	16740	16749	20 %	60 %	20 %	0 %	331270782
24	NC_015426	ATTAT	2	10	17977	17986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015426	GAATT	2	10	18288	18297	40 %	40 %	20 %	0 %	331270783
26	NC_015426	GTAGT	2	10	20281	20290	20 %	40 %	40 %	0 %	331270784
27	NC_015426	TTAAA	2	10	21910	21919	60 %	40 %	0 %	0 %	331270785
28	NC_015426	AACAT	2	10	22352	22361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015426	ATTTT	2	10	24435	24444	20 %	80 %	0 %	0 %	331270789
30	NC_015426	AAAAT	2	10	25435	25444	80 %	20 %	0 %	0 %	331270789
31	NC_015426	TTGTT	2	10	26038	26047	0 %	80 %	20 %	0 %	331270790
32	NC_015426	ACCCC	2	10	26359	26368	20 %	0 %	0 %	80 %	331270790
33	NC_015426	TGATA	2	10	27471	27480	40 %	40 %	20 %	0 %	331270791
34	NC_015426	AATTA	2	10	29667	29676	60 %	40 %	0 %	0 %	331270794
35	NC_015426	AAGAA	2	10	30298	30307	80 %	0 %	20 %	0 %	331270794
36	NC_015426	AAGTA	2	10	32486	32495	60 %	20 %	20 %	0 %	331270795
37	NC_015426	TAAAA	2	10	33614	33623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015426	TAAAT	2	10	36141	36150	60 %	40 %	0 %	0 %	331270801
39	NC_015426	TTTTC	2	10	36664	36673	0 %	80 %	0 %	20 %	331270801
40	NC_015426	AAATT	2	10	37249	37258	60 %	40 %	0 %	0 %	331270801
41	NC_015426	CTTTT	2	10	38393	38402	0 %	80 %	0 %	20 %	331270803
42	NC_015426	ATACA	2	10	38590	38599	60 %	20 %	0 %	20 %	331270803
43	NC_015426	TATCT	2	10	40632	40641	20 %	60 %	0 %	20 %	331270804
44	NC_015426	TTGAT	2	10	42199	42208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015426	TTCTT	2	10	42463	42472	0 %	80 %	0 %	20 %	331270806
46	NC_015426	ATCTA	2	10	43309	43318	40 %	40 %	0 %	20 %	331270807
47	NC_015426	TTGAT	2	10	44368	44377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015426	ACTTA	2	10	44414	44423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015426	TGGTT	2	10	45414	45423	0 %	60 %	40 %	0 %	331270809
50	NC_015426	TAATT	2	10	45489	45498	40 %	60 %	0 %	0 %	331270809
51	NC_015426	TCATA	2	10	45572	45581	40 %	40 %	0 %	20 %	331270809
52	NC_015426	TTTCT	2	10	45794	45803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015426	CTTTT	2	10	46373	46382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015426	TGTTC	2	10	46902	46911	0 %	60 %	20 %	20 %	331270812
55	NC_015426	ATGTA	2	10	46958	46967	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015426	AAAAT	2	10	49489	49498	80 %	20 %	0 %	0 %	331270815
57	NC_015426	ATAAA	2	10	49780	49789	80 %	20 %	0 %	0 %	331270816
58	NC_015426	ACATA	2	10	50443	50452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015426	TAATT	2	10	53752	53761	40 %	60 %	0 %	0 %	331270820
60	NC_015426	AGAAA	2	10	54337	54346	80 %	0 %	20 %	0 %	331270820
61	NC_015426	ATTTA	2	10	54861	54870	40 %	60 %	0 %	0 %	331270820
62	NC_015426	ATATT	2	10	56040	56049	40 %	60 %	0 %	0 %	331270822
63	NC_015426	ATATT	2	10	62979	62988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015426	CATAT	2	10	63617	63626	40 %	40 %	0 %	20 %	331270834
65	NC_015426	ATATA	2	10	65051	65060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015426	ATTTA	2	10	65406	65415	40 %	60 %	0 %	0 %	331270836
67	NC_015426	GTATT	2	10	65728	65737	20 %	60 %	20 %	0 %	331270836
68	NC_015426	ATATT	2	10	66086	66095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015426	TTTAA	2	10	66229	66238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015426	ATATG	2	10	67395	67404	40 %	40 %	20 %	0 %	331270837
71	NC_015426	AAAAG	2	10	68454	68463	80 %	0 %	20 %	0 %	331270838
72	NC_015426	GATAA	2	10	69009	69018	60 %	20 %	20 %	0 %	331270838
73	NC_015426	TATTG	2	10	69508	69517	20 %	60 %	20 %	0 %	331270839
74	NC_015426	ATATT	2	10	70087	70096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015426	TATAA	2	10	71415	71424	60 %	40 %	0 %	0 %	331270840
76	NC_015426	ATTAT	2	10	72389	72398	40 %	60 %	0 %	0 %	331270841
77	NC_015426	ATATA	2	10	73826	73835	60 %	40 %	0 %	0 %	331270844
78	NC_015426	AGAAA	2	10	74292	74301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015426	TATAT	2	10	75045	75054	40 %	60 %	0 %	0 %	331270845
80	NC_015426	ATTTC	2	10	75855	75864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015426	TCATA	2	10	80426	80435	40 %	40 %	0 %	20 %	331270849
82	NC_015426	ATTAT	2	10	80477	80486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015426	TCATA	2	10	81838	81847	40 %	40 %	0 %	20 %	331270850
84	NC_015426	CTTTT	2	10	83877	83886	0 %	80 %	0 %	20 %	331270852
85	NC_015426	GTTAT	2	10	84174	84183	20 %	60 %	20 %	0 %	331270853
86	NC_015426	TTAAT	2	10	84304	84313	40 %	60 %	0 %	0 %	331270854
87	NC_015426	CATAT	2	10	84385	84394	40 %	40 %	0 %	20 %	331270854
88	NC_015426	TTATC	2	10	85035	85044	20 %	60 %	0 %	20 %	331270855
89	NC_015426	TGTAA	2	10	85559	85568	40 %	40 %	20 %	0 %	331270856
90	NC_015426	TTATA	2	10	89256	89265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015426	ATTTC	2	10	90033	90042	20 %	60 %	0 %	20 %	331270859
92	NC_015426	TTTAC	2	10	91057	91066	20 %	60 %	0 %	20 %	331270860
93	NC_015426	TAATA	2	10	92967	92976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015426	AAAAT	2	10	93565	93574	80 %	20 %	0 %	0 %	331270861
95	NC_015426	ATTAT	2	10	94478	94487	40 %	60 %	0 %	0 %	331270862
96	NC_015426	ATTTT	2	10	94574	94583	20 %	80 %	0 %	0 %	331270862
97	NC_015426	ATAAA	2	10	94955	94964	80 %	20 %	0 %	0 %	331270862
98	NC_015426	TCTTT	2	10	95323	95332	0 %	80 %	0 %	20 %	331270862
99	NC_015426	CATAC	2	10	95628	95637	40 %	20 %	0 %	40 %	331270862
100	NC_015426	TGCTT	2	10	95896	95905	0 %	60 %	20 %	20 %	331270862
101	NC_015426	TTTTA	2	10	96411	96420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015426	AATAA	2	10	96452	96461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015426	TAATT	2	10	97757	97766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015426	GTATA	2	10	98064	98073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.