MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	CTTTT	2	10	3410	3419	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015426	TATGT	2	10	9106	9115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015426	AAATA	2	10	9833	9842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015426	ATTTT	2	10	15819	15828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015426	ATTTA	2	10	15860	15869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015426	TAAAA	2	10	15978	15987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015426	ATGTA	2	10	16022	16031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015426	ATTAT	2	10	17977	17986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015426	AACAT	2	10	22352	22361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015426	TAAAA	2	10	33614	33623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015426	TTGAT	2	10	42199	42208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015426	TTGAT	2	10	44368	44377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015426	ACTTA	2	10	44414	44423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015426	TTTCT	2	10	45794	45803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015426	CTTTT	2	10	46373	46382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015426	ATGTA	2	10	46958	46967	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015426	ACATA	2	10	50443	50452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015426	ATATT	2	10	62979	62988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015426	ATATA	2	10	65051	65060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015426	ATATT	2	10	66086	66095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015426	TTTAA	2	10	66229	66238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015426	ATATT	2	10	70087	70096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015426	AGAAA	2	10	74292	74301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015426	ATTTC	2	10	75855	75864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015426	ATTAT	2	10	80477	80486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015426	TTATA	2	10	89256	89265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015426	TAATA	2	10	92967	92976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015426	TTTTA	2	10	96411	96420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015426	AATAA	2	10	96452	96461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015426	TAATT	2	10	97757	97766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015426	GTATA	2	10	98064	98073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.