MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	ACTT	2	8	31	38	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015426	TTAT	2	8	77	84	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015426	CAAA	2	8	312	319	75 %	0 %	0 %	25 %	331270762
4	NC_015426	TAAT	2	8	416	423	50 %	50 %	0 %	0 %	331270763
5	NC_015426	GAAA	2	8	754	761	75 %	0 %	25 %	0 %	331270764
6	NC_015426	AAAT	2	8	816	823	75 %	25 %	0 %	0 %	331270764
7	NC_015426	GCAA	2	8	1559	1566	50 %	0 %	25 %	25 %	331270764
8	NC_015426	TTTA	2	8	2010	2017	25 %	75 %	0 %	0 %	331270764
9	NC_015426	CCTT	2	8	2632	2639	0 %	50 %	0 %	50 %	331270765
10	NC_015426	TTAT	2	8	3015	3022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015426	CCTT	2	8	3262	3269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015426	ATTT	2	8	3396	3403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015426	TGTA	2	8	3576	3583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015426	ATTA	2	8	3959	3966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015426	CATA	2	8	3973	3980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015426	ATTA	2	8	3986	3993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015426	ATGA	2	8	5108	5115	50 %	25 %	25 %	0 %	331270767
18	NC_015426	AACT	2	8	5178	5185	50 %	25 %	0 %	25 %	331270767
19	NC_015426	ATTT	2	8	5346	5353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015426	TTAC	2	8	5392	5399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015426	TAAA	2	8	5757	5764	75 %	25 %	0 %	0 %	331270769
22	NC_015426	GAAA	2	8	6115	6122	75 %	0 %	25 %	0 %	331270769
23	NC_015426	ATTT	2	8	6130	6137	25 %	75 %	0 %	0 %	331270769
24	NC_015426	AGAA	2	8	6594	6601	75 %	0 %	25 %	0 %	331270769
25	NC_015426	AGTA	2	8	7425	7432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015426	ATAA	2	8	7470	7477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015426	TAGA	2	8	7609	7616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015426	AATA	2	8	7835	7842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015426	AATT	2	8	7895	7902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015426	TTAT	2	8	7963	7970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015426	TAGT	2	8	8492	8499	25 %	50 %	25 %	0 %	331270771
32	NC_015426	TTGT	2	8	8712	8719	0 %	75 %	25 %	0 %	331270771
33	NC_015426	AACC	2	8	8865	8872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015426	AAAG	2	8	8884	8891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015426	ATAG	2	8	9205	9212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015426	TAAT	2	8	9252	9259	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
37	NC_015426	TTTA	2	8	9277	9284	25 %	75 %	0 %	0 %	331270772
38	NC_015426	TATT	2	8	9564	9571	25 %	75 %	0 %	0 %	331270772
39	NC_015426	TTAT	2	8	9572	9579	25 %	75 %	0 %	0 %	331270772
40	NC_015426	TATC	2	8	10287	10294	25 %	50 %	0 %	25 %	331270773
41	NC_015426	TACT	2	8	10491	10498	25 %	50 %	0 %	25 %	331270773
42	NC_015426	ATTT	2	8	10701	10708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015426	TTTA	2	8	10757	10764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015426	ATAA	2	8	10796	10803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015426	AATA	2	8	10811	10818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015426	AAAT	2	8	11978	11985	75 %	25 %	0 %	0 %	331270774
47	NC_015426	TAAT	2	8	12092	12099	50 %	50 %	0 %	0 %	331270774
48	NC_015426	GAAA	2	8	12116	12123	75 %	0 %	25 %	0 %	331270774
49	NC_015426	TTAT	2	8	12485	12492	25 %	75 %	0 %	0 %	331270774
50	NC_015426	TTTA	2	8	12877	12884	25 %	75 %	0 %	0 %	331270776
51	NC_015426	TATG	2	8	12901	12908	25 %	50 %	25 %	0 %	331270776
52	NC_015426	AAAG	2	8	13107	13114	75 %	0 %	25 %	0 %	331270777
53	NC_015426	TGAT	2	8	14179	14186	25 %	50 %	25 %	0 %	331270777
54	NC_015426	AATT	2	8	14268	14275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015426	TTAT	2	8	14364	14371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015426	GTTT	2	8	14950	14957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015426	TAAT	2	8	15388	15395	50 %	50 %	0 %	0 %	331270780
58	NC_015426	AATG	2	8	15531	15538	50 %	25 %	25 %	0 %	331270780
59	NC_015426	ATAA	2	8	15873	15880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015426	TATT	2	8	15910	15917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015426	AAAT	2	8	15946	15953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015426	ATTT	2	8	15962	15969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015426	AAAT	2	8	16129	16136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015426	AGAA	2	8	16881	16888	75 %	0 %	25 %	0 %	331270782
65	NC_015426	AAAG	2	8	17373	17380	75 %	0 %	25 %	0 %	331270782
66	NC_015426	TACA	2	8	17437	17444	50 %	25 %	0 %	25 %	331270782
67	NC_015426	ATCT	2	8	18513	18520	25 %	50 %	0 %	25 %	331270783
68	NC_015426	AGTT	2	8	18546	18553	25 %	50 %	25 %	0 %	331270783
69	NC_015426	AATC	2	8	20217	20224	50 %	25 %	0 %	25 %	331270784
70	NC_015426	GAAG	2	8	20331	20338	50 %	0 %	50 %	0 %	331270784
71	NC_015426	CGTA	2	8	20977	20984	25 %	25 %	25 %	25 %	331270785
72	NC_015426	AATT	2	8	21042	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	331270785
73	NC_015426	TACA	2	8	21252	21259	50 %	25 %	0 %	25 %	331270785
74	NC_015426	CAAT	2	8	21833	21840	50 %	25 %	0 %	25 %	331270785
75	NC_015426	TAAA	2	8	22255	22262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015426	ATTT	2	8	22266	22273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015426	TATT	2	8	22333	22340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015426	ATGT	2	8	22431	22438	25 %	50 %	25 %	0 %	331270786
79	NC_015426	ATTT	2	8	22806	22813	25 %	75 %	0 %	0 %	331270786
80	NC_015426	AAGA	2	8	23077	23084	75 %	0 %	25 %	0 %	331270786
81	NC_015426	TCCC	2	8	24052	24059	0 %	25 %	0 %	75 %	331270788
82	NC_015426	TAAA	2	8	24583	24590	75 %	25 %	0 %	0 %	331270789
83	NC_015426	TAAA	2	8	25448	25455	75 %	25 %	0 %	0 %	331270789
84	NC_015426	TAGT	2	8	25511	25518	25 %	50 %	25 %	0 %	331270790
85	NC_015426	TATT	2	8	25553	25560	25 %	75 %	0 %	0 %	331270790
86	NC_015426	TCAA	2	8	25726	25733	50 %	25 %	0 %	25 %	331270790
87	NC_015426	TTGA	2	8	26339	26346	25 %	50 %	25 %	0 %	331270790
88	NC_015426	CCAT	2	8	26441	26448	25 %	25 %	0 %	50 %	331270790
89	NC_015426	TAAT	2	8	26491	26498	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
90	NC_015426	AATT	2	8	26510	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
91	NC_015426	AATT	2	8	26859	26866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015426	AAAT	2	8	26899	26906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015426	TGGA	2	8	27078	27085	25 %	25 %	50 %	0 %	331270791
94	NC_015426	ATTA	2	8	27606	27613	50 %	50 %	0 %	0 %	331270791
95	NC_015426	TTTA	2	8	27674	27681	25 %	75 %	0 %	0 %	331270791
96	NC_015426	TAAA	2	8	27810	27817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015426	ATTT	2	8	27837	27844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015426	TACA	2	8	27867	27874	50 %	25 %	0 %	25 %	331270792
99	NC_015426	ATTC	2	8	27941	27948	25 %	50 %	0 %	25 %	331270792
100	NC_015426	TTTG	2	8	28304	28311	0 %	75 %	25 %	0 %	331270792
101	NC_015426	GAAA	2	8	29205	29212	75 %	0 %	25 %	0 %	331270793
102	NC_015426	TGGT	2	8	29772	29779	0 %	50 %	50 %	0 %	331270794
103	NC_015426	TTCA	2	8	30147	30154	25 %	50 %	0 %	25 %	331270794
104	NC_015426	CAAA	2	8	30754	30761	75 %	0 %	0 %	25 %	331270794
105	NC_015426	TAAA	2	8	30838	30845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015426	AAAT	2	8	30990	30997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015426	AATG	2	8	31700	31707	50 %	25 %	25 %	0 %	331270795
108	NC_015426	TAAA	2	8	32053	32060	75 %	25 %	0 %	0 %	331270795
109	NC_015426	ATCA	2	8	32095	32102	50 %	25 %	0 %	25 %	331270795
110	NC_015426	GAAA	2	8	32616	32623	75 %	0 %	25 %	0 %	331270795
111	NC_015426	ACAA	2	8	33106	33113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015426	TTAT	2	8	33199	33206	25 %	75 %	0 %	0 %	331270796
113	NC_015426	ATAA	2	8	33570	33577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015426	CTTT	2	8	33593	33600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015426	AAAG	2	8	33777	33784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015426	ATTC	2	8	34090	34097	25 %	50 %	0 %	25 %	331270797
117	NC_015426	TGGT	2	8	34144	34151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015426	AGAT	2	8	34248	34255	50 %	25 %	25 %	0 %	331270798
119	NC_015426	CATC	2	8	35212	35219	25 %	25 %	0 %	50 %	331270799
120	NC_015426	TCTA	2	8	35251	35258	25 %	50 %	0 %	25 %	331270799
121	NC_015426	AATA	2	8	35311	35318	75 %	25 %	0 %	0 %	331270799
122	NC_015426	TTTA	2	8	35625	35632	25 %	75 %	0 %	0 %	331270800
123	NC_015426	TAAA	2	8	36179	36186	75 %	25 %	0 %	0 %	331270801
124	NC_015426	GAAA	2	8	36537	36544	75 %	0 %	25 %	0 %	331270801
125	NC_015426	AGAA	2	8	37016	37023	75 %	0 %	25 %	0 %	331270801
126	NC_015426	AGTA	2	8	37850	37857	50 %	25 %	25 %	0 %	331270802
127	NC_015426	ATAA	2	8	37895	37902	75 %	25 %	0 %	0 %	331270802
128	NC_015426	TAGA	2	8	38034	38041	50 %	25 %	25 %	0 %	331270802
129	NC_015426	ATCA	2	8	38459	38466	50 %	25 %	0 %	25 %	331270803
130	NC_015426	ATTT	2	8	39137	39144	25 %	75 %	0 %	0 %	331270803
131	NC_015426	TTTA	2	8	39179	39186	25 %	75 %	0 %	0 %	331270803
132	NC_015426	TAAA	2	8	39449	39456	75 %	25 %	0 %	0 %	331270803
133	NC_015426	ATTA	2	8	39497	39504	50 %	50 %	0 %	0 %	331270803
134	NC_015426	ATCT	2	8	40689	40696	25 %	50 %	0 %	25 %	331270804
135	NC_015426	AAAC	2	8	40762	40769	75 %	0 %	0 %	25 %	331270804
136	NC_015426	TCAT	2	8	40936	40943	25 %	50 %	0 %	25 %	331270804
137	NC_015426	GATA	2	8	41223	41230	50 %	25 %	25 %	0 %	331270804
138	NC_015426	TACT	2	8	41585	41592	25 %	50 %	0 %	25 %	331270805
139	NC_015426	AACT	2	8	42441	42448	50 %	25 %	0 %	25 %	331270806
140	NC_015426	TCTT	2	8	42487	42494	0 %	75 %	0 %	25 %	331270806
141	NC_015426	TATT	2	8	42708	42715	25 %	75 %	0 %	0 %	331270806
142	NC_015426	TACA	2	8	42780	42787	50 %	25 %	0 %	25 %	331270806
143	NC_015426	CTTC	3	12	43136	43147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015426	CATC	2	8	43432	43439	25 %	25 %	0 %	50 %	331270807
145	NC_015426	TGAT	2	8	43482	43489	25 %	50 %	25 %	0 %	331270807
146	NC_015426	TTTA	2	8	43620	43627	25 %	75 %	0 %	0 %	331270807
147	NC_015426	CAAG	2	8	43888	43895	50 %	0 %	25 %	25 %	331270807
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.