MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	AT	3	6	83	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015426	TA	3	6	96	101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015426	AT	3	6	257	262	50 %	50 %	0 %	0 %	331270762
4	NC_015426	AT	3	6	848	853	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
5	NC_015426	AT	4	8	994	1001	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
6	NC_015426	TA	3	6	1349	1354	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
7	NC_015426	TG	3	6	1532	1537	0 %	50 %	50 %	0 %	331270764
8	NC_015426	AT	4	8	1625	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
9	NC_015426	AT	4	8	1720	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
10	NC_015426	TA	4	8	2051	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
11	NC_015426	TA	3	6	2080	2085	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
12	NC_015426	AT	3	6	2112	2117	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
13	NC_015426	AT	3	6	2120	2125	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
14	NC_015426	AT	4	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
15	NC_015426	TG	3	6	2321	2326	0 %	50 %	50 %	0 %	331270765
16	NC_015426	AT	3	6	2364	2369	50 %	50 %	0 %	0 %	331270765
17	NC_015426	TA	3	6	2488	2493	50 %	50 %	0 %	0 %	331270765
18	NC_015426	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	331270765
19	NC_015426	AT	3	6	3198	3203	50 %	50 %	0 %	0 %	331270766
20	NC_015426	AT	3	6	3709	3714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015426	AT	3	6	3852	3857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015426	TA	3	6	4186	4191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015426	AT	4	8	4296	4303	50 %	50 %	0 %	0 %	331270767
24	NC_015426	AT	3	6	4341	4346	50 %	50 %	0 %	0 %	331270767
25	NC_015426	TA	3	6	5302	5307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015426	AT	3	6	5328	5333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015426	TC	3	6	6215	6220	0 %	50 %	0 %	50 %	331270769
28	NC_015426	AT	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	331270769
29	NC_015426	TA	3	6	6939	6944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015426	AT	3	6	7969	7974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015426	TA	3	6	7982	7987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015426	AT	3	6	8162	8167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015426	AT	3	6	9046	9051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015426	AT	3	6	9142	9147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015426	TA	3	6	9385	9390	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
36	NC_015426	TA	4	8	9406	9413	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
37	NC_015426	TA	3	6	9581	9586	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
38	NC_015426	TA	6	12	9776	9787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015426	AT	4	8	9801	9808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015426	GA	4	8	9882	9889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015426	TA	4	8	10686	10693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015426	AT	4	8	10766	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015426	TA	4	8	10788	10795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015426	AT	4	8	11161	11168	50 %	50 %	0 %	0 %	331270774
45	NC_015426	AG	3	6	11521	11526	50 %	0 %	50 %	0 %	331270774
46	NC_015426	TA	3	6	11657	11662	50 %	50 %	0 %	0 %	331270774
47	NC_015426	GA	3	6	12056	12061	50 %	0 %	50 %	0 %	331270774
48	NC_015426	AG	3	6	12467	12472	50 %	0 %	50 %	0 %	331270774
49	NC_015426	AT	3	6	12794	12799	50 %	50 %	0 %	0 %	331270775
50	NC_015426	GT	3	6	12870	12875	0 %	50 %	50 %	0 %	331270776
51	NC_015426	AT	3	6	12945	12950	50 %	50 %	0 %	0 %	331270776
52	NC_015426	AT	3	6	13136	13141	50 %	50 %	0 %	0 %	331270777
53	NC_015426	TA	3	6	14189	14194	50 %	50 %	0 %	0 %	331270777
54	NC_015426	TA	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015426	TA	3	6	15235	15240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015426	TA	3	6	15273	15278	50 %	50 %	0 %	0 %	331270780
57	NC_015426	AT	5	10	15482	15491	50 %	50 %	0 %	0 %	331270780
58	NC_015426	TA	4	8	15888	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015426	TA	3	6	15918	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015426	TA	3	6	15940	15945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015426	TA	4	8	15989	15996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015426	TA	3	6	16011	16016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015426	AC	3	6	16074	16079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015426	AT	4	8	16121	16128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015426	GT	3	6	16156	16161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015426	TA	3	6	16212	16217	50 %	50 %	0 %	0 %	331270781
67	NC_015426	AT	3	6	16471	16476	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
68	NC_015426	TA	3	6	16554	16559	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
69	NC_015426	TA	4	8	16937	16944	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
70	NC_015426	AT	3	6	17008	17013	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
71	NC_015426	TA	3	6	17245	17250	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
72	NC_015426	AT	3	6	17572	17577	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
73	NC_015426	AT	3	6	17707	17712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015426	TA	4	8	17855	17862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015426	TA	3	6	17870	17875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015426	AT	3	6	18345	18350	50 %	50 %	0 %	0 %	331270783
77	NC_015426	TA	3	6	18434	18439	50 %	50 %	0 %	0 %	331270783
78	NC_015426	AC	4	8	19297	19304	50 %	0 %	0 %	50 %	331270784
79	NC_015426	TA	3	6	19599	19604	50 %	50 %	0 %	0 %	331270784
80	NC_015426	AC	3	6	20548	20553	50 %	0 %	0 %	50 %	331270784
81	NC_015426	AT	3	6	20716	20721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015426	AT	4	8	20853	20860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015426	TA	3	6	20866	20871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015426	TA	3	6	21084	21089	50 %	50 %	0 %	0 %	331270785
85	NC_015426	AT	4	8	22115	22122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015426	TA	3	6	22125	22130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015426	AT	3	6	22227	22232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015426	TA	4	8	22497	22504	50 %	50 %	0 %	0 %	331270786
89	NC_015426	AT	3	6	23183	23188	50 %	50 %	0 %	0 %	331270786
90	NC_015426	TA	3	6	23301	23306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015426	AT	3	6	23347	23352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015426	AT	3	6	23497	23502	50 %	50 %	0 %	0 %	331270787
93	NC_015426	AT	3	6	23865	23870	50 %	50 %	0 %	0 %	331270788
94	NC_015426	TA	3	6	24105	24110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015426	CT	3	6	24137	24142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015426	TA	3	6	24149	24154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015426	AT	3	6	24220	24225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015426	GA	3	6	24601	24606	50 %	0 %	50 %	0 %	331270789
99	NC_015426	TA	3	6	24916	24921	50 %	50 %	0 %	0 %	331270789
100	NC_015426	TA	3	6	25326	25331	50 %	50 %	0 %	0 %	331270789
101	NC_015426	TA	3	6	25871	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
102	NC_015426	TA	3	6	25904	25909	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
103	NC_015426	TA	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
104	NC_015426	TA	5	10	26057	26066	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
105	NC_015426	CT	3	6	26522	26527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015426	TA	3	6	26761	26766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015426	AT	3	6	26820	26825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015426	AT	4	8	26841	26848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015426	TG	3	6	26873	26878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015426	GA	3	6	27292	27297	50 %	0 %	50 %	0 %	331270791
111	NC_015426	TA	3	6	27634	27639	50 %	50 %	0 %	0 %	331270791
112	NC_015426	AT	3	6	27700	27705	50 %	50 %	0 %	0 %	331270791
113	NC_015426	AT	4	8	27824	27831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015426	AT	4	8	29124	29131	50 %	50 %	0 %	0 %	331270792
115	NC_015426	TA	3	6	29162	29167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015426	TA	3	6	30079	30084	50 %	50 %	0 %	0 %	331270794
117	NC_015426	AT	3	6	30270	30275	50 %	50 %	0 %	0 %	331270794
118	NC_015426	TA	3	6	30503	30508	50 %	50 %	0 %	0 %	331270794
119	NC_015426	TA	3	6	31834	31839	50 %	50 %	0 %	0 %	331270795
120	NC_015426	TA	3	6	32110	32115	50 %	50 %	0 %	0 %	331270795
121	NC_015426	AT	4	8	32656	32663	50 %	50 %	0 %	0 %	331270795
122	NC_015426	AT	3	6	33310	33315	50 %	50 %	0 %	0 %	331270796
123	NC_015426	TA	3	6	33514	33519	50 %	50 %	0 %	0 %	331270796
124	NC_015426	TA	3	6	33693	33698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015426	TA	3	6	33731	33736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015426	TA	3	6	33866	33871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015426	AT	3	6	33931	33936	50 %	50 %	0 %	0 %	331270797
128	NC_015426	TA	3	6	34072	34077	50 %	50 %	0 %	0 %	331270797
129	NC_015426	AT	4	8	34380	34387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015426	AT	3	6	34502	34507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015426	TA	3	6	34738	34743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015426	TA	3	6	34771	34776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015426	TA	3	6	35115	35120	50 %	50 %	0 %	0 %	331270799
134	NC_015426	TA	3	6	35658	35663	50 %	50 %	0 %	0 %	331270800
135	NC_015426	AT	3	6	35725	35730	50 %	50 %	0 %	0 %	331270800
136	NC_015426	CA	3	6	35864	35869	50 %	0 %	0 %	50 %	331270800
137	NC_015426	TC	3	6	36637	36642	0 %	50 %	0 %	50 %	331270801
138	NC_015426	AT	3	6	37152	37157	50 %	50 %	0 %	0 %	331270801
139	NC_015426	TA	3	6	37361	37366	50 %	50 %	0 %	0 %	331270801
140	NC_015426	AT	3	6	38798	38803	50 %	50 %	0 %	0 %	331270803
141	NC_015426	TA	3	6	39433	39438	50 %	50 %	0 %	0 %	331270803
142	NC_015426	AT	3	6	40500	40505	50 %	50 %	0 %	0 %	331270804
143	NC_015426	GC	3	6	40722	40727	0 %	0 %	50 %	50 %	331270804
144	NC_015426	TA	3	6	41271	41276	50 %	50 %	0 %	0 %	331270804
145	NC_015426	AT	3	6	41482	41487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015426	TA	3	6	41653	41658	50 %	50 %	0 %	0 %	331270805
147	NC_015426	AT	3	6	42015	42020	50 %	50 %	0 %	0 %	331270805
148	NC_015426	TC	3	6	42040	42045	0 %	50 %	0 %	50 %	331270805
149	NC_015426	TC	3	6	42245	42250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.