MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 chromosome

Total Repeats: 1699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015425	TGAAGA	2	12	6035	6046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331268196
2	NC_015425	TAGAAA	2	12	6502	6513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268196
3	NC_015425	TGTTAT	2	12	6939	6950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331268197
4	NC_015425	TATAGA	2	12	7795	7806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268198
5	NC_015425	GAATTG	2	12	9644	9655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268200
6	NC_015425	CAAAAT	2	12	16222	16233	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331268209
7	NC_015425	AAAAGG	2	12	16303	16314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331268210
8	NC_015425	AGAAAA	2	12	17195	17206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268211
9	NC_015425	TATCAA	2	12	18123	18134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331268211
10	NC_015425	AATAGA	2	12	18226	18237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268211
11	NC_015425	AAAGGT	2	12	24056	24067	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331268216
12	NC_015425	AGGAAT	2	12	26409	26420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331268218
13	NC_015425	TCCAAA	2	12	27398	27409	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	331268221
14	NC_015425	AAAATA	2	12	34706	34717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331268227
15	NC_015425	TTTTTG	2	12	37365	37376	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	331268229
16	NC_015425	TTCCTG	2	12	37612	37623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	331268229
17	NC_015425	TTTTTC	2	12	38135	38146	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	331268229
18	NC_015425	ATCTAA	2	12	38886	38897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331268230
19	NC_015425	AAAGTT	2	12	44891	44902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268236
20	NC_015425	TAGAAA	2	12	47067	47078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268239
21	NC_015425	AGATTT	2	12	51027	51038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268243
22	NC_015425	AAATTA	2	12	52242	52253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015425	AATAGC	2	12	53404	53415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331268246
24	NC_015425	GTATAT	2	12	55035	55046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015425	AATAGA	2	12	55755	55766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015425	TAGGAA	2	12	60115	60126	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331268251
27	NC_015425	GCACAA	2	12	61091	61102	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331268252
28	NC_015425	TAAATT	2	12	64162	64173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015425	AGGTGT	2	12	65706	65717	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	331268257
30	NC_015425	ATTAGT	2	12	66253	66264	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268257
31	NC_015425	TTAATC	2	12	66344	66355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331268258
32	NC_015425	TCCATG	2	12	67423	67434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	331268259
33	NC_015425	TAAAAA	2	12	71413	71424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331268263
34	NC_015425	TAAGAA	2	12	75082	75093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015425	TTATAT	2	12	75305	75316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015425	CTCATT	2	12	75860	75871	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331268268
37	NC_015425	TAAATA	2	12	78573	78584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015425	ATTTAG	2	12	80785	80796	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268272
39	NC_015425	ACAAAG	2	12	80837	80848	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331268272
40	NC_015425	TTGATA	2	12	81490	81501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268272
41	NC_015425	AGGGGG	2	12	82913	82924	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015425	TAACAG	2	12	84411	84422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331268275
43	NC_015425	TTTAGC	2	12	84553	84564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331268275
44	NC_015425	AGAAAA	2	12	85703	85714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268276
45	NC_015425	TTATAG	2	12	86551	86562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268276
46	NC_015425	TAGATT	2	12	87067	87078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268277
47	NC_015425	ATGATA	2	12	88030	88041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268277
48	NC_015425	AATAGA	2	12	89865	89876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268278
49	NC_015425	TTTAAT	2	12	91678	91689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268279
50	NC_015425	TTAATA	2	12	93774	93785	50 %	50 %	0 %	0 %	331268281
51	NC_015425	ATTTTT	2	12	93942	93953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331268282
52	NC_015425	AGATTA	2	12	96306	96317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268285
53	NC_015425	TTTAAT	2	12	100480	100491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268289
54	NC_015425	TATTGG	2	12	100638	100649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331268290
55	NC_015425	AATTAA	2	12	103556	103567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268292
56	NC_015425	ATTTAG	2	12	108384	108395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268296
57	NC_015425	TTAGAA	2	12	113960	113971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268301
58	NC_015425	TGCCCA	2	12	115852	115863	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	331268303
59	NC_015425	TAAAGT	2	12	116943	116954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268305
60	NC_015425	AGAAAA	2	12	119640	119651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268307
61	NC_015425	ATTAAA	2	12	120884	120895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268308
62	NC_015425	GTTTAT	2	12	121216	121227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331268308
63	NC_015425	ATCAGG	2	12	122829	122840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268311
64	NC_015425	ATCAGG	2	12	123198	123209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268312
65	NC_015425	TTATAT	2	12	124046	124057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015425	ACAGGA	2	12	124303	124314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	331268314
67	NC_015425	AAAATA	2	12	128226	128237	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331268316
68	NC_015425	GTTAAA	2	12	130929	130940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268318
69	NC_015425	AAAAGA	2	12	131175	131186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268319
70	NC_015425	GTTTAA	2	12	134942	134953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268322
71	NC_015425	ATCTAT	2	12	135126	135137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331268322
72	NC_015425	TATCTT	2	12	135880	135891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331268324
73	NC_015425	ATTAAA	2	12	137494	137505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015425	AAAATG	2	12	143873	143884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268331
75	NC_015425	GCTGAA	2	12	144841	144852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268332
76	NC_015425	ATTTAC	2	12	148815	148826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331268335
77	NC_015425	AAGAAA	2	12	148960	148971	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268336
78	NC_015425	AGTAGG	2	12	150558	150569	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	331268337
79	NC_015425	TTAACA	2	12	153083	153094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331268338
80	NC_015425	TTGTAT	2	12	160810	160821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015425	AAAAAT	2	12	161069	161080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331268346
82	NC_015425	TAAAGT	3	18	161553	161570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268347
83	NC_015425	ATAGTT	2	12	164920	164931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331268349
84	NC_015425	AAAATT	2	12	166999	167010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268350
85	NC_015425	TAGTGT	2	12	167389	167400	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331268351
86	NC_015425	AGAAAA	2	12	169408	169419	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268352
87	NC_015425	GCAATG	2	12	170976	170987	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268354
88	NC_015425	AGATAA	2	12	171269	171280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268354
89	NC_015425	GGAGAA	2	12	172687	172698	50 %	0 %	50 %	0 %	331268355
90	NC_015425	TAGATA	2	12	175307	175318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268358
91	NC_015425	AGAGAC	2	12	177919	177930	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	331268359
92	NC_015425	GGGATA	2	12	178411	178422	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	331268360
93	NC_015425	AATATC	2	12	186940	186951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331268362
94	NC_015425	ATTTTG	2	12	187014	187025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331268362
95	NC_015425	TTAATA	2	12	187650	187661	50 %	50 %	0 %	0 %	331268362
96	NC_015425	TATGTC	2	12	187975	187986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331268362
97	NC_015425	AAATGA	2	12	189856	189867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015425	ATATGA	2	12	191318	191329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268364
99	NC_015425	AATTAA	2	12	191626	191637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268364
100	NC_015425	TGGAAT	2	12	191810	191821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268365
101	NC_015425	TTTAAA	2	12	193019	193030	50 %	50 %	0 %	0 %	331268367
102	NC_015425	AGAAGC	2	12	196918	196929	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015425	TTATAA	2	12	197307	197318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015425	ATTAGT	2	12	197426	197437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015425	TAAGAC	2	12	198154	198165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015425	ATCCAG	2	12	200137	200148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	331268374
107	NC_015425	CTAAAT	2	12	201141	201152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331268376
108	NC_015425	ATATAA	2	12	205533	205544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268380
109	NC_015425	TATATT	2	12	214963	214974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268388
110	NC_015425	AGAGCA	2	12	216396	216407	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	331268389
111	NC_015425	GCTTGT	2	12	216954	216965	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331268390
112	NC_015425	CCAAAA	2	12	221404	221415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268395
113	NC_015425	TATAGA	2	12	224894	224905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268400
114	NC_015425	AGAAGC	2	12	225884	225895	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	331268402
115	NC_015425	AATTTG	2	12	226341	226352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015425	CAGTTG	2	12	227186	227197	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331268404
117	NC_015425	GCAGGA	2	12	227209	227220	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	331268404
118	NC_015425	GGATTA	2	12	227311	227322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268404
119	NC_015425	GTTAGA	2	12	231407	231418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268405
120	NC_015425	AAAAGA	2	12	233089	233100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331268406
121	NC_015425	CTGGAA	2	12	234906	234917	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268406
122	NC_015425	CAAGAA	2	12	236668	236679	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331268410
123	NC_015425	AGCATT	2	12	237429	237440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331268410
124	NC_015425	TAAATA	2	12	238581	238592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_015425	ATTTTA	2	12	439444	439455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268608
241	NC_015425	TAACTA	2	12	439922	439933	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331268608
242	NC_015425	ATAAAA	2	12	444699	444710	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331268611
243	NC_015425	ATCAGG	2	12	446041	446052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268611
244	NC_015425	ATAGCT	2	12	448289	448300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331268613
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247	NC_015425	TTATAA	2	12	452849	452860	50 %	50 %	0 %	0 %	331268617
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255	NC_015425	AATTTA	2	12	476564	476575	50 %	50 %	0 %	0 %	331268633
256	NC_015425	TGTAGT	2	12	476880	476891	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331268633
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259	NC_015425	TATAAA	2	12	479620	479631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268638
260	NC_015425	TAAATA	2	12	482740	482751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268642
261	NC_015425	GCTAAT	2	12	483512	483523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331268642
262	NC_015425	ATAAAG	2	12	485544	485555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331268644
263	NC_015425	TTAATA	2	12	487088	487099	50 %	50 %	0 %	0 %	331268646
264	NC_015425	TATAGA	2	12	491721	491732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331268649
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269	NC_015425	ATTTTT	2	12	496173	496184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331268654
270	NC_015425	TTAAAT	2	12	496768	496779	50 %	50 %	0 %	0 %	331268654
271	NC_015425	TATAAA	2	12	496911	496922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268654
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305	NC_015425	ATTTAA	2	12	570441	570452	50 %	50 %	0 %	0 %	331268715
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333	NC_015425	GACAAA	2	12	609675	609686	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331268753
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348	NC_015425	AATTTA	2	12	638679	638690	50 %	50 %	0 %	0 %	331268778
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475	NC_015425	TATTTA	2	12	782414	782425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268897
476	NC_015425	TAGAAG	2	12	784677	784688	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331268899
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478	NC_015425	AGATGC	2	12	787895	787906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268902
479	NC_015425	GCAGTA	2	12	791489	791500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331268905
480	NC_015425	ATGTAG	2	12	791678	791689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268905
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483	NC_015425	ATTAAA	2	12	798160	798171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268911
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