MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 chromosome

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015425	AAATTA	2	12	52242	52253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015425	GTATAT	2	12	55035	55046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015425	AATAGA	2	12	55755	55766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015425	TAAATT	2	12	64162	64173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015425	TAAGAA	2	12	75082	75093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015425	TTATAT	2	12	75305	75316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015425	TAAATA	2	12	78573	78584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015425	AGGGGG	2	12	82913	82924	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015425	TTATAT	2	12	124046	124057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015425	ATTAAA	2	12	137494	137505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015425	TTGTAT	2	12	160810	160821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015425	AAATGA	2	12	189856	189867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015425	AGAAGC	2	12	196918	196929	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015425	TTATAA	2	12	197307	197318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015425	ATTAGT	2	12	197426	197437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015425	TAAGAC	2	12	198154	198165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015425	AATTTG	2	12	226341	226352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015425	TAAATA	2	12	238581	238592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015425	CAATCT	2	12	263899	263910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015425	AAATAA	2	12	301751	301762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015425	TCATAA	2	12	302604	302615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015425	ATATAA	2	12	315180	315191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015425	AAAATA	2	12	318022	318033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015425	TAGAAT	2	12	331729	331740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015425	ATTAAT	2	12	354125	354136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015425	ATATAA	2	12	355220	355231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015425	TATTAA	2	12	401547	401558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015425	TAATAT	2	12	403695	403706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015425	TTTACA	2	12	403815	403826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015425	TAATTT	2	12	409067	409078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015425	AACTTT	2	12	495498	495509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015425	TAAATT	2	12	567395	567406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015425	GAGTCA	2	12	578454	578465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015425	TTATAA	2	12	581117	581128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015425	TAAAAG	2	12	582361	582372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015425	TTATAT	2	12	608695	608706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015425	ATAATT	2	12	608945	608956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015425	TAAATT	2	12	631303	631314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015425	TTTTTA	2	12	632251	632262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015425	ATAAGT	2	12	637424	637435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015425	ATATAA	2	12	660649	660660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015425	ATAAAT	2	12	673245	673256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015425	TATAAA	2	12	675801	675812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015425	GGGGAG	2	12	690966	690977	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015425	TTAAAA	2	12	705822	705833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015425	TAAATA	2	12	708651	708662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015425	ATTAAA	2	12	717111	717122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015425	AAATTA	2	12	722383	722394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015425	ACTTTA	2	12	727813	727824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015425	TAGTTT	2	12	746575	746586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015425	ATTTAT	2	12	750828	750839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015425	TTAAAA	2	12	766581	766592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015425	ATTAAA	2	12	794769	794780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015425	TAATAT	2	12	817276	817287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015425	ATATTT	2	12	822273	822284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015425	ATAAAT	2	12	835758	835769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015425	AATTAA	2	12	842531	842542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015425	TAAAAA	2	12	863064	863075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015425	TAAAAA	2	12	877119	877130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015425	ATATTA	2	12	885285	885296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015425	TGTTTT	2	12	922396	922407	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015425	TATTAG	2	12	923716	923727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015425	ATTAGT	2	12	978802	978813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015425	TATTAA	2	12	997732	997743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015425	TATTTT	2	12	1007837	1007848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015425	AAATTT	2	12	1009740	1009751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015425	ATATTT	2	12	1010769	1010780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015425	TAAAAT	2	12	1013709	1013720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015425	ATTTAT	2	12	1013971	1013982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015425	TAAAAA	2	12	1014006	1014017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015425	TAAATT	2	12	1015694	1015705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015425	ATTAAT	2	12	1024377	1024388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015425	AAATTT	2	12	1035562	1035573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015425	TAAAAA	2	12	1037399	1037410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015425	TAAATA	2	12	1074612	1074623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015425	ATAATT	2	12	1074686	1074697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015425	TATTAG	2	12	1096957	1096968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015425	CTAATT	2	12	1179687	1179698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015425	ATTTTA	2	12	1189602	1189613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015425	TAAATT	2	12	1198886	1198897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015425	TTAGTA	2	12	1274466	1274477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015425	GAAATA	2	12	1290086	1290097	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015425	TGGGGA	2	12	1290519	1290530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015425	GCTATC	2	12	1354156	1354167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015425	TTTAAT	2	12	1355278	1355289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015425	TGTTAA	2	12	1355535	1355546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015425	TTTATT	2	12	1361566	1361577	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015425	TTAAAA	2	12	1361598	1361609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015425	TATAGG	2	12	1361646	1361657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015425	CAAGTA	2	12	1368006	1368017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015425	ATAATT	2	12	1382350	1382361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015425	TGTAAA	2	12	1386282	1386293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015425	ATAAGT	2	12	1386460	1386471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015425	ATTAGT	2	12	1397140	1397151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015425	TTTAAC	2	12	1397854	1397865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015425	AAATAT	2	12	1410656	1410667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015425	ATTTTG	2	12	1417737	1417748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015425	TTTTTA	2	12	1417983	1417994	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015425	TACAAA	2	12	1429115	1429126	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015425	AAAAAT	2	12	1455941	1455952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015425	TAAAAA	2	12	1468547	1468558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015425	TAAAAA	2	12	1472225	1472236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015425	ATAATT	2	12	1472442	1472453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015425	TTCCTT	2	12	1501173	1501184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015425	TCCCTC	2	12	1501187	1501198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015425	TTTAAA	2	12	1502358	1502369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015425	TTTTTA	2	12	1502469	1502480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015425	TATTAA	2	12	1506134	1506145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015425	TCATTT	2	12	1508919	1508930	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015425	ATAACT	3	18	1513549	1513566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015425	TTTTAA	2	12	1566229	1566240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015425	TAATTA	2	12	1612907	1612918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015425	TAATTA	2	12	1612928	1612939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015425	GTTTTT	2	12	1618853	1618864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015425	ATTTTT	2	12	1622542	1622553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015425	AAAATA	2	12	1664032	1664043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015425	GAATTG	2	12	1666272	1666283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015425	TAAAAA	2	12	1672072	1672083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015425	ATATAG	2	12	1676255	1676266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015425	CTTCAT	2	12	1681006	1681017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015425	TCATAA	2	12	1681116	1681127	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015425	TATTAA	2	12	1684756	1684767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015425	TATTGA	2	12	1728111	1728122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015425	AATTAA	2	12	1730040	1730051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015425	ATGTAA	2	12	1746429	1746440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015425	CTACAC	2	12	1746441	1746452	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015425	AATTTA	2	12	1770251	1770262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015425	TACAAA	2	12	1785408	1785419	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015425	ATTCAC	2	12	1790357	1790368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015425	ATTTTT	2	12	1800048	1800059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015425	TTCCTT	2	12	1828090	1828101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015425	ATTAAT	2	12	1837434	1837445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015425	TAGATT	2	12	1839916	1839927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.