MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas veronii B565 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015424	TTTTTG	2	12	6339	6350	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015424	ATAATT	2	12	83476	83487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015424	CCGCTG	2	12	90260	90271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015424	TCCCTC	2	12	250921	250932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015424	TAATTA	2	12	296659	296670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015424	TTGATA	2	12	299154	299165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015424	AGGGCA	2	12	322183	322194	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015424	AGGCAA	2	12	444102	444113	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015424	CAAAAA	2	12	444160	444171	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015424	ATAGCG	2	12	452054	452065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015424	AGTCTC	2	12	453060	453071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015424	ATTTAT	2	12	463249	463260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015424	TTGCTT	2	12	530556	530567	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015424	TAAAAT	2	12	575466	575477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015424	CCGGTT	2	12	643865	643876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015424	CGGAAG	2	12	730942	730953	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015424	CAAAAA	2	12	743623	743634	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015424	CAGGCT	2	12	764750	764761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015424	CAAAAG	2	12	764782	764793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015424	GGGCGC	2	12	802922	802933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015424	CTGGCG	2	12	856183	856194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015424	TATGGT	2	12	942164	942175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015424	CGGGAG	2	12	1039552	1039563	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015424	TGAAAC	2	12	1109793	1109804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015424	CCCCGC	2	12	1166559	1166570	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_015424	TTGGTG	2	12	1178183	1178194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015424	GATATG	2	12	1185047	1185058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015424	TGGCCG	2	12	1185264	1185275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015424	ATTTTC	2	12	1203435	1203446	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015424	CGATGG	2	12	1280637	1280648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015424	AAGGGG	2	12	1304975	1304986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015424	TGGACA	2	12	1315446	1315457	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015424	TGGCAG	2	12	1357980	1357991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015424	TGAAAA	2	12	1373026	1373037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015424	TGCACA	2	12	1384511	1384522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015424	ATCTGA	2	12	1398757	1398768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015424	CGGGGT	2	12	1412953	1412964	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015424	TGCCGC	2	12	1464985	1464996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015424	CCAAGG	2	12	1486661	1486672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015424	GGGAGG	2	12	1506904	1506915	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015424	GGATAG	2	12	1552579	1552590	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015424	CGGGGG	2	12	1588565	1588576	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015424	TGGGGA	2	12	1629249	1629260	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015424	TGGGGA	2	12	1629390	1629401	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015424	CCAAGC	2	12	1655960	1655971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015424	GAGATA	2	12	1672864	1672875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015424	TTAGTG	2	12	1719905	1719916	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015424	CAAGCG	2	12	1732066	1732077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015424	CGATGG	2	12	1792750	1792761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015424	TTTCAT	2	12	1814091	1814102	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015424	TCTGCC	3	18	1845472	1845489	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015424	CGTGAC	2	12	1885689	1885700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015424	TGAAAA	2	12	1973433	1973444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015424	TGCACA	2	12	1984998	1985009	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015424	GCCGAT	2	12	1986506	1986517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015424	ATCTGA	2	12	2002646	2002657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015424	GATCCC	2	12	2027244	2027255	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015424	GTTATT	2	12	2034521	2034532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015424	TCAGGC	2	12	2116993	2117004	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015424	CCTATG	2	12	2205072	2205083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015424	ATATCA	2	12	2206260	2206271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015424	TTCAGA	2	12	2225978	2225989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015424	AAGCAC	2	12	2267502	2267513	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015424	CCCTCA	2	12	2275886	2275897	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015424	GCAACT	2	12	2325863	2325874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015424	CAGTTC	2	12	2330196	2330207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015424	CTCTGC	2	12	2331046	2331057	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015424	GCCCCA	2	12	2335602	2335613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015424	AATTGG	2	12	2351572	2351583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015424	GCCCCT	2	12	2363915	2363926	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015424	ATGCGG	2	12	2398424	2398435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015424	GAACAT	2	12	2398482	2398493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015424	TCGAAC	2	12	2411916	2411927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015424	AAGGAG	2	12	2425011	2425022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015424	TTTACG	2	12	2454585	2454596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015424	CCTCCC	2	12	2481237	2481248	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
77	NC_015424	GGAAAG	2	12	2517585	2517596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015424	TTTACG	2	12	2547259	2547270	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015424	GCAAAC	2	12	2628732	2628743	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015424	GAGCCA	2	12	2628760	2628771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015424	TAATGA	2	12	2630764	2630775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015424	ACGCTT	2	12	2688485	2688496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015424	CCCCTG	2	12	2785426	2785437	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015424	GCGATA	2	12	2842366	2842377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015424	ATACAA	2	12	2845423	2845434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015424	GTCATG	2	12	2874083	2874094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015424	GGCAAC	2	12	2916506	2916517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015424	TGATAA	2	12	2960356	2960367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015424	CGGTGG	2	12	2966733	2966744	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015424	GCTTCA	2	12	3011766	3011777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015424	GACAAT	2	12	3041911	3041922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015424	TGATCT	2	12	3047682	3047693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015424	CTGATG	2	12	3078540	3078551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015424	CATAGC	2	12	3110514	3110525	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015424	CCATCG	2	12	3118334	3118345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015424	GTAGGA	2	12	3123651	3123662	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015424	ATTTTT	2	12	3164124	3164135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015424	TTACCT	2	12	3211867	3211878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015424	GCCTTT	2	12	3244508	3244519	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015424	GCTGAA	2	12	3348239	3348250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015424	ATGAAC	2	12	3353117	3353128	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015424	AAGGCA	2	12	3392693	3392704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015424	ACGCCA	3	18	3412536	3412553	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015424	AATAGA	2	12	3414806	3414817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015424	AAACGC	2	12	3434260	3434271	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015424	GAAAAA	2	12	3513039	3513050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015424	TGTACT	2	12	3528604	3528615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015424	CTCCCT	2	12	3529205	3529216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015424	CAACCT	2	12	3529850	3529861	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015424	ATCCCG	2	12	3709439	3709450	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015424	TTCATC	2	12	3731258	3731269	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015424	TTGGTA	2	12	3803103	3803114	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015424	ACCTTG	2	12	3844399	3844410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015424	TCCCTC	2	12	3851570	3851581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015424	AGGGAT	2	12	3877630	3877641	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015424	TTTCAA	2	12	3920116	3920127	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015424	GCGTTA	2	12	3936330	3936341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015424	AGCATG	3	18	3964682	3964699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015424	TCTCCT	2	12	4011998	4012009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015424	TGCTGT	2	12	4044777	4044788	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015424	AGAGGG	2	12	4070750	4070761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015424	AGAGCA	2	12	4076774	4076785	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015424	TGTTTA	2	12	4088159	4088170	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015424	CAGCCT	2	12	4146445	4146456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015424	CATGTC	2	12	4161836	4161847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015424	CACCGC	2	12	4168210	4168221	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015424	CAAAAA	2	12	4189604	4189615	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015424	CCTTTC	2	12	4231088	4231099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015424	GAAAGT	2	12	4274996	4275007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015424	CAAAAG	2	12	4298494	4298505	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015424	TCCCCC	2	12	4307834	4307845	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
132	NC_015424	CTTTTC	2	12	4347248	4347259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015424	AAGGAA	2	12	4391064	4391075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015424	AAATAA	2	12	4406103	4406114	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015424	GCGCTT	2	12	4549206	4549217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.