MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015423	GCGTGA	2	12	1927	1938	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330827327
2	NC_015423	GTGCGC	2	12	2720	2731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330827328
3	NC_015423	GCGGGT	2	12	8218	8229	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330827333
4	NC_015423	CACGGT	2	12	11872	11883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330827340
5	NC_015423	GCTGGA	2	12	17252	17263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330827345
6	NC_015423	CTGCAC	2	12	19592	19603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330827349
7	NC_015423	AGGCCC	2	12	20745	20756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330827350
8	NC_015423	CCGGCA	2	12	24225	24236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330827354
9	NC_015423	AAAGGG	2	12	29359	29370	50 %	0 %	50 %	0 %	330827356
10	NC_015423	ATGCGG	2	12	31120	31131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330827358
11	NC_015423	GCCCTG	2	12	31878	31889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330827361
12	NC_015423	TCCCTG	2	12	33244	33255	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330827364
13	NC_015423	GAGCGC	2	12	34431	34442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330827365
14	NC_015423	CTGTGC	2	12	37039	37050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827369
15	NC_015423	GAGCCG	2	12	37990	38001	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330827369
16	NC_015423	GGATCG	2	12	40521	40532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330827373
17	NC_015423	ATCCCG	2	12	42764	42775	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330827377
18	NC_015423	GCCCCT	2	12	42846	42857	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	330827377
19	NC_015423	TTTCCT	2	12	45389	45400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330827380
20	NC_015423	AGGACA	2	12	47101	47112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330827383
21	NC_015423	CAACCA	2	12	47119	47130	50 %	0 %	0 %	50 %	330827383
22	NC_015423	AGGACG	2	12	47956	47967	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330827383
23	NC_015423	CCGGCC	2	12	47985	47996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827383
24	NC_015423	CCTTGG	2	12	48732	48743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827384
25	NC_015423	CTGGCC	2	12	52514	52525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330827388
26	NC_015423	CCTCTA	2	12	53646	53657	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330827389
27	NC_015423	TGCGCG	2	12	68447	68458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330827403
28	NC_015423	TACCGC	2	12	68653	68664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330827403
29	NC_015423	GGCCCC	2	12	68784	68795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827403
30	NC_015423	TCGCTC	2	12	72679	72690	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330827410
31	NC_015423	TCGTTG	2	12	72911	72922	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330827411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.