MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015423	GGTGT	2	10	768	777	0 %	40 %	60 %	0 %	330827327
2	NC_015423	AAGGA	2	10	856	865	60 %	0 %	40 %	0 %	330827327
3	NC_015423	GCACT	2	10	2893	2902	20 %	20 %	20 %	40 %	330827329
4	NC_015423	GCAAG	2	10	5334	5343	40 %	0 %	40 %	20 %	330827329
5	NC_015423	CAAGA	2	10	5623	5632	60 %	0 %	20 %	20 %	330827329
6	NC_015423	AGGGC	2	10	6783	6792	20 %	0 %	60 %	20 %	330827331
7	NC_015423	CCGGC	2	10	9799	9808	0 %	0 %	40 %	60 %	330827335
8	NC_015423	GACGG	2	10	12293	12302	20 %	0 %	60 %	20 %	330827340
9	NC_015423	CAGCA	2	10	12445	12454	40 %	0 %	20 %	40 %	330827341
10	NC_015423	CACCG	2	10	12482	12491	20 %	0 %	20 %	60 %	330827341
11	NC_015423	GCGTG	2	10	12513	12522	0 %	20 %	60 %	20 %	330827341
12	NC_015423	CCGGG	2	10	12733	12742	0 %	0 %	60 %	40 %	330827341
13	NC_015423	CGGCG	2	10	12820	12829	0 %	0 %	60 %	40 %	330827341
14	NC_015423	ACCCG	2	10	17080	17089	20 %	0 %	20 %	60 %	330827345
15	NC_015423	CCAAC	2	10	17888	17897	40 %	0 %	0 %	60 %	330827346
16	NC_015423	TTTCG	2	10	18671	18680	0 %	60 %	20 %	20 %	330827347
17	NC_015423	CGGCG	2	10	19645	19654	0 %	0 %	60 %	40 %	330827349
18	NC_015423	CCGAT	2	10	19795	19804	20 %	20 %	20 %	40 %	330827349
19	NC_015423	AGCCA	2	10	20825	20834	40 %	0 %	20 %	40 %	330827350
20	NC_015423	GATCG	2	10	22694	22703	20 %	20 %	40 %	20 %	330827352
21	NC_015423	TGCGA	2	10	24156	24165	20 %	20 %	40 %	20 %	330827354
22	NC_015423	GCGCG	2	10	26058	26067	0 %	0 %	60 %	40 %	330827355
23	NC_015423	ACATC	2	10	27976	27985	40 %	20 %	0 %	40 %	330827356
24	NC_015423	CCGCT	2	10	29014	29023	0 %	20 %	20 %	60 %	330827356
25	NC_015423	TGCGC	2	10	32551	32560	0 %	20 %	40 %	40 %	330827362
26	NC_015423	GGCGG	2	10	32602	32611	0 %	0 %	80 %	20 %	330827362
27	NC_015423	AATCC	2	10	33677	33686	40 %	20 %	0 %	40 %	330827365
28	NC_015423	CCGGG	2	10	34055	34064	0 %	0 %	60 %	40 %	330827365
29	NC_015423	CCAAG	2	10	34924	34933	40 %	0 %	20 %	40 %	330827366
30	NC_015423	CGGCC	2	10	39775	39784	0 %	0 %	40 %	60 %	330827372
31	NC_015423	GCGCA	2	10	40096	40105	20 %	0 %	40 %	40 %	330827372
32	NC_015423	CATCA	2	10	40756	40765	40 %	20 %	0 %	40 %	330827373
33	NC_015423	TCCGC	2	10	42617	42626	0 %	20 %	20 %	60 %	330827376
34	NC_015423	CCTTG	2	10	42795	42804	0 %	40 %	20 %	40 %	330827377
35	NC_015423	TGGGG	2	10	42826	42835	0 %	20 %	80 %	0 %	330827377
36	NC_015423	TGCAT	2	10	43145	43154	20 %	40 %	20 %	20 %	330827377
37	NC_015423	CCCCG	2	10	43912	43921	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_015423	GCCGA	2	10	44545	44554	20 %	0 %	40 %	40 %	330827379
39	NC_015423	CCGCG	2	10	46187	46196	0 %	0 %	40 %	60 %	330827381
40	NC_015423	CGCTG	2	10	46577	46586	0 %	20 %	40 %	40 %	330827382
41	NC_015423	TGGAA	2	10	46837	46846	40 %	20 %	40 %	0 %	330827382
42	NC_015423	CCGCG	2	10	47375	47384	0 %	0 %	40 %	60 %	330827383
43	NC_015423	GGCGA	2	10	49733	49742	20 %	0 %	60 %	20 %	330827387
44	NC_015423	ACCTG	2	10	49782	49791	20 %	20 %	20 %	40 %	330827387
45	NC_015423	CTGAC	2	10	50638	50647	20 %	20 %	20 %	40 %	330827387
46	NC_015423	AAGCG	2	10	52156	52165	40 %	0 %	40 %	20 %	330827388
47	NC_015423	GGGCT	2	10	52396	52405	0 %	20 %	60 %	20 %	330827388
48	NC_015423	CAGAC	2	10	53838	53847	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015423	TGCGC	2	10	54501	54510	0 %	20 %	40 %	40 %	330827391
50	NC_015423	GCCGC	2	10	54630	54639	0 %	0 %	40 %	60 %	330827391
51	NC_015423	AGCAC	2	10	59221	59230	40 %	0 %	20 %	40 %	330827394
52	NC_015423	TGACC	2	10	59791	59800	20 %	20 %	20 %	40 %	330827394
53	NC_015423	CAACC	2	10	60500	60509	40 %	0 %	0 %	60 %	330827394
54	NC_015423	CGCTG	2	10	61052	61061	0 %	20 %	40 %	40 %	330827395
55	NC_015423	CTGGC	2	10	61171	61180	0 %	20 %	40 %	40 %	330827395
56	NC_015423	GGCGC	2	10	61749	61758	0 %	0 %	60 %	40 %	330827395
57	NC_015423	CTGCG	2	10	62673	62682	0 %	20 %	40 %	40 %	330827397
58	NC_015423	GGCCG	2	10	62730	62739	0 %	0 %	60 %	40 %	330827397
59	NC_015423	GTCCT	2	10	62922	62931	0 %	40 %	20 %	40 %	330827397
60	NC_015423	CCCCG	2	10	63872	63881	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
61	NC_015423	CCAAG	2	10	64652	64661	40 %	0 %	20 %	40 %	330827399
62	NC_015423	AGGGC	2	10	66591	66600	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015423	CCCCG	2	10	67197	67206	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_015423	CAGAC	2	10	67371	67380	40 %	0 %	20 %	40 %	330827403
65	NC_015423	CAGCG	2	10	67710	67719	20 %	0 %	40 %	40 %	330827403
66	NC_015423	GCCGT	2	10	67835	67844	0 %	20 %	40 %	40 %	330827403
67	NC_015423	CGCGC	2	10	68181	68190	0 %	0 %	40 %	60 %	330827403
68	NC_015423	CCGCG	2	10	68841	68850	0 %	0 %	40 %	60 %	330827403
69	NC_015423	GCCGC	2	10	69607	69616	0 %	0 %	40 %	60 %	330827404
70	NC_015423	AGGGC	2	10	70684	70693	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015423	CGCTG	2	10	71148	71157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015423	CATGA	2	10	71205	71214	40 %	20 %	20 %	20 %	330827407
73	NC_015423	CCGCT	2	10	73464	73473	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_015423	TCCGC	2	10	73790	73799	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.