MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015423	CAAC	2	8	827	834	50 %	0 %	0 %	50 %	330827327
2	NC_015423	CAGC	2	8	1742	1749	25 %	0 %	25 %	50 %	330827327
3	NC_015423	TCCG	2	8	2153	2160	0 %	25 %	25 %	50 %	330827327
4	NC_015423	AGCC	2	8	2299	2306	25 %	0 %	25 %	50 %	330827327
5	NC_015423	CCGG	2	8	3102	3109	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
6	NC_015423	ACGC	2	8	3349	3356	25 %	0 %	25 %	50 %	330827329
7	NC_015423	CAGC	2	8	3564	3571	25 %	0 %	25 %	50 %	330827329
8	NC_015423	GAAG	2	8	3639	3646	50 %	0 %	50 %	0 %	330827329
9	NC_015423	GGAA	2	8	3710	3717	50 %	0 %	50 %	0 %	330827329
10	NC_015423	TCCT	2	8	4462	4469	0 %	50 %	0 %	50 %	330827329
11	NC_015423	AAGC	2	8	4654	4661	50 %	0 %	25 %	25 %	330827329
12	NC_015423	CGGG	2	8	5055	5062	0 %	0 %	75 %	25 %	330827329
13	NC_015423	GAAG	2	8	5145	5152	50 %	0 %	50 %	0 %	330827329
14	NC_015423	GACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	25 %	50 %	330827330
15	NC_015423	GACC	2	8	6069	6076	25 %	0 %	25 %	50 %	330827330
16	NC_015423	GACG	2	8	6838	6845	25 %	0 %	50 %	25 %	330827331
17	NC_015423	GGGC	2	8	7796	7803	0 %	0 %	75 %	25 %	330827333
18	NC_015423	GCAG	2	8	9006	9013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015423	CGCT	2	8	9487	9494	0 %	25 %	25 %	50 %	330827335
20	NC_015423	GGAA	2	8	9568	9575	50 %	0 %	50 %	0 %	330827335
21	NC_015423	GCCA	2	8	9948	9955	25 %	0 %	25 %	50 %	330827336
22	NC_015423	GCTG	2	8	9984	9991	0 %	25 %	50 %	25 %	330827336
23	NC_015423	ATCC	2	8	10200	10207	25 %	25 %	0 %	50 %	330827336
24	NC_015423	CCAA	2	8	10386	10393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015423	GTTG	2	8	10873	10880	0 %	50 %	50 %	0 %	330827338
26	NC_015423	CCAC	2	8	10977	10984	25 %	0 %	0 %	75 %	330827338
27	NC_015423	CAAT	2	8	11090	11097	50 %	25 %	0 %	25 %	330827339
28	NC_015423	AACC	2	8	11737	11744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015423	ATGG	2	8	12158	12165	25 %	25 %	50 %	0 %	330827340
30	NC_015423	TGAG	2	8	12334	12341	25 %	25 %	50 %	0 %	330827340
31	NC_015423	CAAA	2	8	12351	12358	75 %	0 %	0 %	25 %	330827341
32	NC_015423	CGGG	2	8	12964	12971	0 %	0 %	75 %	25 %	330827341
33	NC_015423	GGCT	2	8	13007	13014	0 %	25 %	50 %	25 %	330827341
34	NC_015423	GCTG	2	8	13701	13708	0 %	25 %	50 %	25 %	330827342
35	NC_015423	GCTG	2	8	13713	13720	0 %	25 %	50 %	25 %	330827342
36	NC_015423	GAGC	2	8	14199	14206	25 %	0 %	50 %	25 %	330827342
37	NC_015423	CCTG	2	8	14331	14338	0 %	25 %	25 %	50 %	330827342
38	NC_015423	TCGC	2	8	14484	14491	0 %	25 %	25 %	50 %	330827343
39	NC_015423	CGCA	2	8	14545	14552	25 %	0 %	25 %	50 %	330827343
40	NC_015423	GGGA	2	8	14554	14561	25 %	0 %	75 %	0 %	330827343
41	NC_015423	GCTG	2	8	14943	14950	0 %	25 %	50 %	25 %	330827344
42	NC_015423	CCGG	2	8	14986	14993	0 %	0 %	50 %	50 %	330827344
43	NC_015423	CGGC	2	8	15039	15046	0 %	0 %	50 %	50 %	330827344
44	NC_015423	CGTC	2	8	15127	15134	0 %	25 %	25 %	50 %	330827344
45	NC_015423	AGCC	2	8	15342	15349	25 %	0 %	25 %	50 %	330827345
46	NC_015423	TTCC	2	8	15782	15789	0 %	50 %	0 %	50 %	330827345
47	NC_015423	CGTG	2	8	16088	16095	0 %	25 %	50 %	25 %	330827345
48	NC_015423	CGCA	2	8	16262	16269	25 %	0 %	25 %	50 %	330827345
49	NC_015423	GGCG	2	8	16733	16740	0 %	0 %	75 %	25 %	330827345
50	NC_015423	TGGG	2	8	16917	16924	0 %	25 %	75 %	0 %	330827345
51	NC_015423	GCCG	2	8	17609	17616	0 %	0 %	50 %	50 %	330827345
52	NC_015423	GCCG	2	8	17913	17920	0 %	0 %	50 %	50 %	330827346
53	NC_015423	GCCG	2	8	17931	17938	0 %	0 %	50 %	50 %	330827346
54	NC_015423	TGGC	2	8	18535	18542	0 %	25 %	50 %	25 %	330827347
55	NC_015423	CCTG	2	8	18804	18811	0 %	25 %	25 %	50 %	330827348
56	NC_015423	GGCT	2	8	19994	20001	0 %	25 %	50 %	25 %	330827349
57	NC_015423	GATG	2	8	20761	20768	25 %	25 %	50 %	0 %	330827350
58	NC_015423	GCCG	2	8	20797	20804	0 %	0 %	50 %	50 %	330827350
59	NC_015423	CCCT	2	8	21039	21046	0 %	25 %	0 %	75 %	330827350
60	NC_015423	GACC	2	8	21534	21541	25 %	0 %	25 %	50 %	330827351
61	NC_015423	TGGC	2	8	22092	22099	0 %	25 %	50 %	25 %	330827351
62	NC_015423	CTAC	2	8	24947	24954	25 %	25 %	0 %	50 %	330827355
63	NC_015423	GCAA	2	8	25385	25392	50 %	0 %	25 %	25 %	330827355
64	NC_015423	CCGA	2	8	25783	25790	25 %	0 %	25 %	50 %	330827355
65	NC_015423	CTCG	2	8	26271	26278	0 %	25 %	25 %	50 %	330827355
66	NC_015423	GCAA	2	8	27714	27721	50 %	0 %	25 %	25 %	330827356
67	NC_015423	TCGG	2	8	27835	27842	0 %	25 %	50 %	25 %	330827356
68	NC_015423	GCCG	2	8	27945	27952	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
69	NC_015423	GGGT	2	8	28106	28113	0 %	25 %	75 %	0 %	330827356
70	NC_015423	CGTG	2	8	28634	28641	0 %	25 %	50 %	25 %	330827356
71	NC_015423	CCAA	2	8	28789	28796	50 %	0 %	0 %	50 %	330827356
72	NC_015423	GGGC	2	8	29181	29188	0 %	0 %	75 %	25 %	330827356
73	NC_015423	CGGC	2	8	29630	29637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015423	GGCA	2	8	30170	30177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015423	GGCG	2	8	31436	31443	0 %	0 %	75 %	25 %	330827360
76	NC_015423	CTCC	2	8	31941	31948	0 %	25 %	0 %	75 %	330827361
77	NC_015423	CGGC	2	8	31957	31964	0 %	0 %	50 %	50 %	330827361
78	NC_015423	GGCC	2	8	32019	32026	0 %	0 %	50 %	50 %	330827361
79	NC_015423	AATC	2	8	32533	32540	50 %	25 %	0 %	25 %	330827362
80	NC_015423	CAAA	2	8	32851	32858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015423	GATG	2	8	32904	32911	25 %	25 %	50 %	0 %	330827363
82	NC_015423	GCCA	2	8	33364	33371	25 %	0 %	25 %	50 %	330827364
83	NC_015423	GAGC	2	8	33374	33381	25 %	0 %	50 %	25 %	330827364
84	NC_015423	GCAC	2	8	33403	33410	25 %	0 %	25 %	50 %	330827365
85	NC_015423	GCGG	2	8	33962	33969	0 %	0 %	75 %	25 %	330827365
86	NC_015423	CGGC	2	8	34112	34119	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
87	NC_015423	GCTT	2	8	34713	34720	0 %	50 %	25 %	25 %	330827366
88	NC_015423	CCAA	2	8	35858	35865	50 %	0 %	0 %	50 %	330827368
89	NC_015423	ACGC	2	8	35959	35966	25 %	0 %	25 %	50 %	330827368
90	NC_015423	GAAG	2	8	36786	36793	50 %	0 %	50 %	0 %	330827368
91	NC_015423	CATT	2	8	36972	36979	25 %	50 %	0 %	25 %	330827369
92	NC_015423	CACC	2	8	37764	37771	25 %	0 %	0 %	75 %	330827369
93	NC_015423	ATTG	2	8	38061	38068	25 %	50 %	25 %	0 %	330827369
94	NC_015423	AAGC	2	8	38073	38080	50 %	0 %	25 %	25 %	330827369
95	NC_015423	GTGG	2	8	38094	38101	0 %	25 %	75 %	0 %	330827369
96	NC_015423	GGAC	2	8	38615	38622	25 %	0 %	50 %	25 %	330827370
97	NC_015423	CATC	2	8	39318	39325	25 %	25 %	0 %	50 %	330827372
98	NC_015423	CGGC	2	8	39720	39727	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
99	NC_015423	GCTC	2	8	39825	39832	0 %	25 %	25 %	50 %	330827372
100	NC_015423	GCCG	2	8	40141	40148	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
101	NC_015423	TTCC	2	8	40843	40850	0 %	50 %	0 %	50 %	330827373
102	NC_015423	CGGC	2	8	41057	41064	0 %	0 %	50 %	50 %	330827374
103	NC_015423	CGGC	2	8	41537	41544	0 %	0 %	50 %	50 %	330827374
104	NC_015423	AAGG	2	8	41620	41627	50 %	0 %	50 %	0 %	330827374
105	NC_015423	CTGG	2	8	42107	42114	0 %	25 %	50 %	25 %	330827375
106	NC_015423	GCCT	2	8	42209	42216	0 %	25 %	25 %	50 %	330827376
107	NC_015423	CTTC	2	8	42733	42740	0 %	50 %	0 %	50 %	330827377
108	NC_015423	TTCC	2	8	43017	43024	0 %	50 %	0 %	50 %	330827377
109	NC_015423	TGGC	2	8	43155	43162	0 %	25 %	50 %	25 %	330827377
110	NC_015423	GCTG	2	8	43221	43228	0 %	25 %	50 %	25 %	330827377
111	NC_015423	CCGG	2	8	43628	43635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015423	GTGC	2	8	44261	44268	0 %	25 %	50 %	25 %	330827378
113	NC_015423	GCCG	2	8	44298	44305	0 %	0 %	50 %	50 %	330827378
114	NC_015423	CGGC	2	8	44872	44879	0 %	0 %	50 %	50 %	330827380
115	NC_015423	TGCC	2	8	45354	45361	0 %	25 %	25 %	50 %	330827380
116	NC_015423	CCGC	2	8	45933	45940	0 %	0 %	25 %	75 %	330827381
117	NC_015423	ACGA	2	8	46307	46314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015423	GCCG	2	8	47198	47205	0 %	0 %	50 %	50 %	330827383
119	NC_015423	GCTG	2	8	47387	47394	0 %	25 %	50 %	25 %	330827383
120	NC_015423	GAGC	2	8	48072	48079	25 %	0 %	50 %	25 %	330827383
121	NC_015423	AGCA	2	8	48626	48633	50 %	0 %	25 %	25 %	330827384
122	NC_015423	GGCG	2	8	49151	49158	0 %	0 %	75 %	25 %	330827385
123	NC_015423	TGGA	2	8	49347	49354	25 %	25 %	50 %	0 %	330827386
124	NC_015423	AATG	2	8	49679	49686	50 %	25 %	25 %	0 %	330827387
125	NC_015423	ACAG	2	8	49699	49706	50 %	0 %	25 %	25 %	330827387
126	NC_015423	AACG	2	8	50148	50155	50 %	0 %	25 %	25 %	330827387
127	NC_015423	ACGA	2	8	50161	50168	50 %	0 %	25 %	25 %	330827387
128	NC_015423	CGGC	2	8	51216	51223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015423	CGGG	2	8	51327	51334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015423	CGCC	2	8	51450	51457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_015423	GCCG	2	8	51473	51480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015423	AGGG	2	8	51548	51555	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015423	GCCA	2	8	51733	51740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015423	TGCC	2	8	51775	51782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015423	GACC	2	8	52576	52583	25 %	0 %	25 %	50 %	330827388
136	NC_015423	GGCT	2	8	53326	53333	0 %	25 %	50 %	25 %	330827389
137	NC_015423	GCTG	2	8	53503	53510	0 %	25 %	50 %	25 %	330827389
138	NC_015423	CGCT	2	8	53636	53643	0 %	25 %	25 %	50 %	330827389
139	NC_015423	CGCT	2	8	54215	54222	0 %	25 %	25 %	50 %	330827391
140	NC_015423	ACCA	2	8	54238	54245	50 %	0 %	0 %	50 %	330827391
141	NC_015423	CTTC	2	8	55072	55079	0 %	50 %	0 %	50 %	330827392
142	NC_015423	CGGC	2	8	55197	55204	0 %	0 %	50 %	50 %	330827392
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199	NC_015423	CCTG	2	8	75228	75235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.