MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015423	AG	4	8	403	410	50 %	0 %	50 %	0 %	330827327
2	NC_015423	GC	3	6	967	972	0 %	0 %	50 %	50 %	330827327
3	NC_015423	AC	3	6	1696	1701	50 %	0 %	0 %	50 %	330827327
4	NC_015423	GC	3	6	1941	1946	0 %	0 %	50 %	50 %	330827327
5	NC_015423	CG	4	8	2317	2324	0 %	0 %	50 %	50 %	330827327
6	NC_015423	TC	3	6	3145	3150	0 %	50 %	0 %	50 %	330827329
7	NC_015423	GC	3	6	3629	3634	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
8	NC_015423	GC	3	6	3667	3672	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
9	NC_015423	GC	3	6	4047	4052	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
10	NC_015423	CG	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
11	NC_015423	CG	3	6	4970	4975	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
12	NC_015423	GC	3	6	5287	5292	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
13	NC_015423	TC	4	8	5367	5374	0 %	50 %	0 %	50 %	330827329
14	NC_015423	CG	3	6	5552	5557	0 %	0 %	50 %	50 %	330827329
15	NC_015423	CG	3	6	5764	5769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015423	CG	4	8	5788	5795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015423	TG	3	6	5847	5852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015423	GC	3	6	6181	6186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015423	CT	3	6	6421	6426	0 %	50 %	0 %	50 %	330827331
20	NC_015423	GC	3	6	6441	6446	0 %	0 %	50 %	50 %	330827331
21	NC_015423	CG	3	6	6844	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	330827331
22	NC_015423	AT	3	6	6951	6956	50 %	50 %	0 %	0 %	330827331
23	NC_015423	CT	3	6	7053	7058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015423	CG	3	6	9577	9582	0 %	0 %	50 %	50 %	330827335
25	NC_015423	CG	3	6	9624	9629	0 %	0 %	50 %	50 %	330827335
26	NC_015423	CG	3	6	9671	9676	0 %	0 %	50 %	50 %	330827335
27	NC_015423	TC	3	6	10050	10055	0 %	50 %	0 %	50 %	330827336
28	NC_015423	TC	4	8	10783	10790	0 %	50 %	0 %	50 %	330827338
29	NC_015423	CG	3	6	11134	11139	0 %	0 %	50 %	50 %	330827339
30	NC_015423	GC	3	6	12253	12258	0 %	0 %	50 %	50 %	330827340
31	NC_015423	GC	3	6	13354	13359	0 %	0 %	50 %	50 %	330827341
32	NC_015423	GC	3	6	14390	14395	0 %	0 %	50 %	50 %	330827342
33	NC_015423	GC	3	6	14452	14457	0 %	0 %	50 %	50 %	330827343
34	NC_015423	GC	3	6	14753	14758	0 %	0 %	50 %	50 %	330827344
35	NC_015423	GC	3	6	15836	15841	0 %	0 %	50 %	50 %	330827345
36	NC_015423	GC	3	6	16801	16806	0 %	0 %	50 %	50 %	330827345
37	NC_015423	GC	3	6	18135	18140	0 %	0 %	50 %	50 %	330827346
38	NC_015423	GT	3	6	18334	18339	0 %	50 %	50 %	0 %	330827347
39	NC_015423	GC	3	6	19005	19010	0 %	0 %	50 %	50 %	330827348
40	NC_015423	CG	3	6	19012	19017	0 %	0 %	50 %	50 %	330827348
41	NC_015423	CG	4	8	19442	19449	0 %	0 %	50 %	50 %	330827349
42	NC_015423	GC	3	6	20698	20703	0 %	0 %	50 %	50 %	330827350
43	NC_015423	CG	3	6	21110	21115	0 %	0 %	50 %	50 %	330827350
44	NC_015423	GC	3	6	22852	22857	0 %	0 %	50 %	50 %	330827352
45	NC_015423	CT	4	8	23712	23719	0 %	50 %	0 %	50 %	330827353
46	NC_015423	CG	4	8	23752	23759	0 %	0 %	50 %	50 %	330827353
47	NC_015423	CG	3	6	24720	24725	0 %	0 %	50 %	50 %	330827354
48	NC_015423	CG	3	6	25379	25384	0 %	0 %	50 %	50 %	330827355
49	NC_015423	GC	3	6	25508	25513	0 %	0 %	50 %	50 %	330827355
50	NC_015423	CG	4	8	26147	26154	0 %	0 %	50 %	50 %	330827355
51	NC_015423	CG	4	8	26534	26541	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
52	NC_015423	GC	3	6	26641	26646	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
53	NC_015423	GC	5	10	27504	27513	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
54	NC_015423	GC	3	6	28002	28007	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
55	NC_015423	CG	3	6	28288	28293	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
56	NC_015423	CG	3	6	28505	28510	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
57	NC_015423	CG	3	6	28757	28762	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
58	NC_015423	GC	3	6	29480	29485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015423	GA	3	6	29666	29671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015423	CG	3	6	30183	30188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015423	GC	3	6	30367	30372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015423	GC	3	6	30602	30607	0 %	0 %	50 %	50 %	330827358
63	NC_015423	GC	3	6	30616	30621	0 %	0 %	50 %	50 %	330827358
64	NC_015423	CG	4	8	31409	31416	0 %	0 %	50 %	50 %	330827359
65	NC_015423	CG	4	8	31601	31608	0 %	0 %	50 %	50 %	330827360
66	NC_015423	GC	3	6	31803	31808	0 %	0 %	50 %	50 %	330827360
67	NC_015423	CT	3	6	32121	32126	0 %	50 %	0 %	50 %	330827361
68	NC_015423	GC	3	6	32301	32306	0 %	0 %	50 %	50 %	330827361
69	NC_015423	TC	3	6	32358	32363	0 %	50 %	0 %	50 %	330827361
70	NC_015423	CG	4	8	33036	33043	0 %	0 %	50 %	50 %	330827363
71	NC_015423	CG	3	6	33808	33813	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
72	NC_015423	CG	4	8	33905	33912	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
73	NC_015423	GC	3	6	33927	33932	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
74	NC_015423	CG	3	6	33991	33996	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
75	NC_015423	GC	3	6	34362	34367	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
76	NC_015423	CG	4	8	34465	34472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015423	GC	3	6	34633	34638	0 %	0 %	50 %	50 %	330827366
78	NC_015423	GC	3	6	34853	34858	0 %	0 %	50 %	50 %	330827366
79	NC_015423	GC	3	6	35409	35414	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
80	NC_015423	CG	3	6	35483	35488	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
81	NC_015423	GC	3	6	35808	35813	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
82	NC_015423	GC	3	6	35949	35954	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
83	NC_015423	CG	3	6	36321	36326	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
84	NC_015423	GC	3	6	36417	36422	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
85	NC_015423	CG	3	6	36894	36899	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
86	NC_015423	CG	4	8	38207	38214	0 %	0 %	50 %	50 %	330827370
87	NC_015423	AC	3	6	38815	38820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015423	GC	3	6	39027	39032	0 %	0 %	50 %	50 %	330827371
89	NC_015423	CG	3	6	39203	39208	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
90	NC_015423	GC	3	6	39352	39357	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
91	NC_015423	GC	3	6	39441	39446	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
92	NC_015423	GC	3	6	39483	39488	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
93	NC_015423	GC	3	6	40000	40005	0 %	0 %	50 %	50 %	330827372
94	NC_015423	CG	3	6	40263	40268	0 %	0 %	50 %	50 %	330827373
95	NC_015423	GC	3	6	41510	41515	0 %	0 %	50 %	50 %	330827374
96	NC_015423	CG	3	6	42363	42368	0 %	0 %	50 %	50 %	330827376
97	NC_015423	GC	3	6	42440	42445	0 %	0 %	50 %	50 %	330827376
98	NC_015423	GC	4	8	42715	42722	0 %	0 %	50 %	50 %	330827377
99	NC_015423	CT	3	6	42856	42861	0 %	50 %	0 %	50 %	330827377
100	NC_015423	GC	3	6	43074	43079	0 %	0 %	50 %	50 %	330827377
101	NC_015423	GC	3	6	43460	43465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015423	CG	4	8	43504	43511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015423	CG	3	6	43571	43576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015423	CG	3	6	44408	44413	0 %	0 %	50 %	50 %	330827379
105	NC_015423	TC	4	8	44698	44705	0 %	50 %	0 %	50 %	330827379
106	NC_015423	GC	3	6	44820	44825	0 %	0 %	50 %	50 %	330827380
107	NC_015423	GC	4	8	45336	45343	0 %	0 %	50 %	50 %	330827380
108	NC_015423	CG	3	6	45403	45408	0 %	0 %	50 %	50 %	330827380
109	NC_015423	GC	3	6	45431	45436	0 %	0 %	50 %	50 %	330827380
110	NC_015423	CG	3	6	46648	46653	0 %	0 %	50 %	50 %	330827382
111	NC_015423	GC	3	6	46821	46826	0 %	0 %	50 %	50 %	330827382
112	NC_015423	GC	3	6	47223	47228	0 %	0 %	50 %	50 %	330827383
113	NC_015423	CT	3	6	47724	47729	0 %	50 %	0 %	50 %	330827383
114	NC_015423	CG	3	6	47758	47763	0 %	0 %	50 %	50 %	330827383
115	NC_015423	CG	4	8	48448	48455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015423	GC	4	8	48566	48573	0 %	0 %	50 %	50 %	330827384
117	NC_015423	GT	3	6	49096	49101	0 %	50 %	50 %	0 %	330827385
118	NC_015423	GC	3	6	49217	49222	0 %	0 %	50 %	50 %	330827385
119	NC_015423	GC	3	6	49397	49402	0 %	0 %	50 %	50 %	330827386
120	NC_015423	GC	3	6	49411	49416	0 %	0 %	50 %	50 %	330827386
121	NC_015423	GC	3	6	50240	50245	0 %	0 %	50 %	50 %	330827387
122	NC_015423	CG	5	10	51137	51146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015423	GC	3	6	51287	51292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015423	GC	3	6	51490	51495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015423	GC	3	6	51497	51502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015423	GC	3	6	52309	52314	0 %	0 %	50 %	50 %	330827388
127	NC_015423	GC	3	6	52730	52735	0 %	0 %	50 %	50 %	330827388
128	NC_015423	GC	3	6	52765	52770	0 %	0 %	50 %	50 %	330827388
129	NC_015423	GC	3	6	53054	53059	0 %	0 %	50 %	50 %	330827388
130	NC_015423	GC	3	6	53341	53346	0 %	0 %	50 %	50 %	330827389
131	NC_015423	CG	4	8	53690	53697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015423	GC	4	8	54167	54174	0 %	0 %	50 %	50 %	330827391
133	NC_015423	GC	4	8	54182	54189	0 %	0 %	50 %	50 %	330827391
134	NC_015423	GC	3	6	54291	54296	0 %	0 %	50 %	50 %	330827391
135	NC_015423	CG	3	6	55314	55319	0 %	0 %	50 %	50 %	330827392
136	NC_015423	GC	3	6	55336	55341	0 %	0 %	50 %	50 %	330827392
137	NC_015423	CG	4	8	55555	55562	0 %	0 %	50 %	50 %	330827392
138	NC_015423	GC	4	8	56160	56167	0 %	0 %	50 %	50 %	330827393
139	NC_015423	GC	3	6	56204	56209	0 %	0 %	50 %	50 %	330827393
140	NC_015423	CG	3	6	56768	56773	0 %	0 %	50 %	50 %	330827393
141	NC_015423	GC	3	6	56882	56887	0 %	0 %	50 %	50 %	330827393
142	NC_015423	GC	3	6	57011	57016	0 %	0 %	50 %	50 %	330827393
143	NC_015423	CG	3	6	57072	57077	0 %	0 %	50 %	50 %	330827393
144	NC_015423	AG	3	6	58518	58523	50 %	0 %	50 %	0 %	330827394
145	NC_015423	GC	3	6	59087	59092	0 %	0 %	50 %	50 %	330827394
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147	NC_015423	CG	3	6	59767	59772	0 %	0 %	50 %	50 %	330827394
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.