MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015422	GACCAG	2	12	97967	97978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015422	TTGTAA	2	12	131522	131533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015422	GCAAAA	2	12	131592	131603	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015422	TGATAG	2	12	137037	137048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015422	TTGTGG	2	12	144831	144842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015422	TGGAAA	2	12	165416	165427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015422	GCCACG	2	12	224295	224306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015422	GAACTC	2	12	228133	228144	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015422	CTGGCG	2	12	232769	232780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015422	GCCGGG	2	12	234410	234421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015422	CCTCGG	2	12	245406	245417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015422	CGTGGC	2	12	257886	257897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015422	TGCGAG	2	12	258300	258311	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015422	CTCCCT	2	12	323690	323701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015422	TGTTTT	2	12	323965	323976	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015422	CTTTCC	2	12	397908	397919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015422	CGTGGC	2	12	404675	404686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015422	CCTCGT	2	12	406443	406454	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015422	CGGGCT	2	12	406959	406970	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015422	GGCGAT	2	12	408261	408272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015422	CGGCCG	2	12	408353	408364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015422	GCCTTG	2	12	442505	442516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015422	TCCACG	2	12	454662	454673	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015422	CGCGGG	2	12	482333	482344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015422	GCTTGT	2	12	598114	598125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015422	GGAGGG	2	12	657930	657941	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015422	CAGGCC	2	12	670435	670446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015422	CTTTTT	2	12	674856	674867	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015422	GGCGGG	2	12	691312	691323	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015422	GGTTAG	2	12	702943	702954	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015422	GCCACG	2	12	703276	703287	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015422	GGCCTG	2	12	741985	741996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015422	GGGGGA	2	12	746763	746774	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015422	GCAATT	2	12	905204	905215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015422	GGGATG	2	12	919295	919306	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015422	GGTTAG	2	12	923757	923768	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015422	GTGCCA	2	12	971559	971570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015422	TCGTAT	2	12	988657	988668	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015422	ACCAGC	2	12	1004721	1004732	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015422	CGATGG	2	12	1006339	1006350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015422	TGAACA	2	12	1008582	1008593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015422	CCGCGG	2	12	1057899	1057910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015422	GGCTCG	2	12	1133298	1133309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015422	GGCCCT	2	12	1267866	1267877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015422	CCGGCC	2	12	1323368	1323379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015422	GGGCGA	2	12	1394851	1394862	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015422	ATATTC	2	12	1394887	1394898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015422	GTCCTG	2	12	1401059	1401070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015422	GCAGCC	2	12	1402999	1403010	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015422	GCAGGT	2	12	1467473	1467484	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015422	TGGTTC	2	12	1500339	1500350	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015422	GCGGCC	2	12	1512901	1512912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015422	GCCCGG	2	12	1548979	1548990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015422	CTTTTT	2	12	1605434	1605445	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015422	CGTGAA	2	12	1616556	1616567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015422	CGCAGC	2	12	1616779	1616790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015422	CCGCAC	2	12	1624598	1624609	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015422	GGCAGT	2	12	1630232	1630243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015422	TCGTCA	2	12	1649959	1649970	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015422	TCAGCG	2	12	1649977	1649988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015422	ACTATA	2	12	1653078	1653089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015422	TTTTAG	2	12	1679104	1679115	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015422	TGGCAG	2	12	1688879	1688890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015422	CCTGCC	2	12	1698443	1698454	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015422	GGCGCG	3	18	1737909	1737926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015422	CAACCG	2	12	1746868	1746879	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015422	CACAAC	2	12	1758420	1758431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015422	ATCAGG	2	12	1818940	1818951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015422	ACGCAC	2	12	1823276	1823287	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015422	CACCAG	2	12	1834822	1834833	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015422	TGCAGT	2	12	1837926	1837937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015422	GCCGAT	2	12	1844237	1844248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015422	GGCGTT	2	12	1935374	1935385	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015422	GATGAA	2	12	1937079	1937090	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015422	CCAGCC	2	12	1938001	1938012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015422	ACAAGG	2	12	1984405	1984416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015422	GTCCGG	2	12	1985049	1985060	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015422	GGCCAA	2	12	1985809	1985820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015422	GGTTAG	2	12	1988574	1988585	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015422	CGGTGC	2	12	1992409	1992420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015422	ACAGCG	2	12	2053546	2053557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015422	CGCGTG	2	12	2105794	2105805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015422	CAAGGC	2	12	2160512	2160523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015422	CGGACG	2	12	2160661	2160672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015422	CCTTCT	2	12	2166918	2166929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015422	GCACCG	2	12	2178697	2178708	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015422	CCTGCA	2	12	2189048	2189059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015422	TGGCGG	2	12	2189446	2189457	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015422	TGGCGC	2	12	2228845	2228856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015422	CCGCGC	2	12	2246951	2246962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015422	CTAACC	2	12	2255607	2255618	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015422	CGCTGG	2	12	2260277	2260288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015422	CGCCCG	2	12	2291621	2291632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015422	TCGCAG	2	12	2301001	2301012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015422	GAAGTT	2	12	2301327	2301338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015422	GGTTAG	2	12	2303942	2303953	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015422	CAGGCC	2	12	2313882	2313893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015422	GGCCTG	2	12	2342612	2342623	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015422	CTGGCC	2	12	2344586	2344597	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015422	GCAAAA	2	12	2416864	2416875	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015422	AGCACC	2	12	2430828	2430839	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015422	AAGCCG	2	12	2434996	2435007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015422	CGATGG	4	24	2475203	2475226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015422	GGGTGG	2	12	2491649	2491660	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015422	CGGTGC	2	12	2532665	2532676	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015422	GCATGC	2	12	2544176	2544187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015422	GGTCAT	2	12	2563267	2563278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015422	GTCGTT	2	12	2573714	2573725	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015422	AGGCGC	2	12	2654375	2654386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015422	CGCGGG	2	12	2674098	2674109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015422	GCCTGC	2	12	2674372	2674383	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015422	GTTTTT	2	12	2724655	2724666	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015422	GCCAAA	2	12	2795456	2795467	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015422	GTATTT	2	12	2820209	2820220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015422	CCGCTG	2	12	2824558	2824569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015422	GATCTT	2	12	2865267	2865278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015422	GCTGGC	2	12	2876889	2876900	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015422	TAGCGG	2	12	2897643	2897654	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015422	GCCACG	2	12	2914738	2914749	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015422	AGCCCT	2	12	2956797	2956808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015422	GGCGCA	2	12	2969327	2969338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015422	GCCGCG	2	12	3070109	3070120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015422	GGTTAG	2	12	3097283	3097294	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015422	CTGGGC	2	12	3142808	3142819	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015422	CCTTCT	2	12	3193924	3193935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015422	GCCACG	2	12	3197902	3197913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015422	GAGCGC	2	12	3215785	3215796	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015422	GCACGC	2	12	3314500	3314511	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015422	AAGGGG	2	12	3366197	3366208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015422	CGGGCG	3	18	3368835	3368852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015422	GATCCG	2	12	3373081	3373092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015422	GGGAGG	2	12	3379400	3379411	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015422	GGCCCG	2	12	3388376	3388387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015422	CCGACA	2	12	3409661	3409672	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015422	ACGTCA	2	12	3419899	3419910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015422	GCCCTC	2	12	3441949	3441960	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015422	AGATCC	2	12	3468809	3468820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015422	CGTCAC	2	12	3528309	3528320	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015422	CATTGC	2	12	3533692	3533703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015422	GAAACC	2	12	3588632	3588643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015422	GGCCGC	2	12	3614979	3614990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015422	CTGGCC	2	12	3615046	3615057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015422	CTGCGG	2	12	3615891	3615902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015422	GGCCGC	2	12	3616299	3616310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015422	GCAAGC	2	12	3622592	3622603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015422	CCTGCC	2	12	3634750	3634761	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_015422	GCCACG	2	12	3667325	3667336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015422	GATTGC	2	12	3671544	3671555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_015422	GGTTAG	2	12	3674385	3674396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015422	GGTCCA	2	12	3706139	3706150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015422	CCCCGC	2	12	3744050	3744061	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
152	NC_015422	ATGCGG	2	12	3794362	3794373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015422	TATTCG	2	12	3807601	3807612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015422	CTGGCT	2	12	3819289	3819300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015422	TTCCGG	2	12	3849493	3849504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015422	CCCGGC	2	12	3914348	3914359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_015422	GCGCAC	2	12	3926527	3926538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_015422	CGGGAG	2	12	3943257	3943268	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015422	GCAGCG	2	12	3943313	3943324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015422	CTTCGC	2	12	3974953	3974964	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
161	NC_015422	GCCCGC	2	12	3989970	3989981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_015422	CTCGGC	2	12	4001782	4001793	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
163	NC_015422	TGGCCT	2	12	4001829	4001840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015422	CGTGGC	2	12	4009279	4009290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_015422	GGCCTT	2	12	4034863	4034874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_015422	GCGGCC	2	12	4041368	4041379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_015422	CGCGGG	2	12	4060410	4060421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015422	ACAACC	2	12	4090421	4090432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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175	NC_015422	GCCACG	2	12	4132291	4132302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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218	NC_015422	GCCCGC	2	12	4976307	4976318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
219	NC_015422	CGTCCA	2	12	4989281	4989292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
220	NC_015422	AACGGC	2	12	4992421	4992432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.