MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 96228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015422	CGC	2	6	5	10	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015422	CGA	2	6	21	26	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015422	TCC	2	6	74	79	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015422	AGC	2	6	183	188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
5	NC_015422	AGC	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
6	NC_015422	CTG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
7	NC_015422	CTG	2	6	341	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
8	NC_015422	GAG	2	6	482	487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822654
9	NC_015422	GCC	2	6	578	583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822654
10	NC_015422	CGG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822654
11	NC_015422	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822654
12	NC_015422	GCT	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
13	NC_015422	CGA	2	6	778	783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
14	NC_015422	CTG	3	9	812	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
15	NC_015422	CGA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
16	NC_015422	TTC	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822654
17	NC_015422	GGA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822654
18	NC_015422	TTC	2	6	869	874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822654
19	NC_015422	GCT	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
20	NC_015422	AAG	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
21	NC_015422	TGA	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822654
22	NC_015422	GCC	2	6	1006	1011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822654
23	NC_015422	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822654
24	NC_015422	GAG	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822654
25	NC_015422	CTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822654
26	NC_015422	CTG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
27	NC_015422	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
28	NC_015422	ACT	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822654
29	NC_015422	AAG	2	6	1310	1315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
30	NC_015422	AGA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
31	NC_015422	TGC	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
32	NC_015422	CAG	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
33	NC_015422	CAG	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
34	NC_015422	GAT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822654
35	NC_015422	GCC	2	6	1607	1612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015422	ACC	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015422	GAC	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015422	TCG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
39	NC_015422	CAC	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822655
40	NC_015422	CAC	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822655
41	NC_015422	CCG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822655
42	NC_015422	GGC	2	6	1955	1960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822655
43	NC_015422	AGG	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822655
44	NC_015422	CTG	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
45	NC_015422	CTA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822655
46	NC_015422	TGG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822655
47	NC_015422	AGC	2	6	2198	2203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822655
48	NC_015422	AGG	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822655
49	NC_015422	CTG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
50	NC_015422	CAA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822655
51	NC_015422	ACC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822655
52	NC_015422	TCA	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822655
53	NC_015422	CAT	2	6	2470	2475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822655
54	NC_015422	AGG	3	9	2553	2561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822655
55	NC_015422	CGG	2	6	2587	2592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822655
56	NC_015422	GTC	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
57	NC_015422	ACA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822655
58	NC_015422	CGT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
59	NC_015422	AGA	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015422	CGA	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
61	NC_015422	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
62	NC_015422	CAC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
63	NC_015422	GGT	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822656
64	NC_015422	CGA	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
65	NC_015422	CGA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
66	NC_015422	TCG	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
67	NC_015422	GAC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
68	NC_015422	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
69	NC_015422	GGC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
70	NC_015422	GGC	2	6	3276	3281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
71	NC_015422	GAA	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822656
72	NC_015422	GTG	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822656
73	NC_015422	GGT	2	6	3407	3412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822656
74	NC_015422	CAA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822656
75	NC_015422	CGA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
76	NC_015422	AGG	2	6	3610	3615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
77	NC_015422	TCA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
78	NC_015422	GAA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822656
79	NC_015422	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
80	NC_015422	CGG	2	6	3731	3736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
81	NC_015422	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
82	NC_015422	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822656
83	NC_015422	CGG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
84	NC_015422	AAG	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822656
85	NC_015422	GCG	2	6	3937	3942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
86	NC_015422	TGC	2	6	3963	3968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
87	NC_015422	CAG	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
88	NC_015422	CAG	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
89	NC_015422	GGA	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
90	NC_015422	TCG	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
91	NC_015422	GGA	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
92	NC_015422	TCG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
93	NC_015422	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
94	NC_015422	CCG	2	6	4285	4290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
95	NC_015422	ATC	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
96	NC_015422	GCG	2	6	4471	4476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
97	NC_015422	CGA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
98	NC_015422	CGC	2	6	4490	4495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
99	NC_015422	ACC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
100	NC_015422	CAT	4	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
101	NC_015422	CTG	3	9	4563	4571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
102	NC_015422	CTT	2	6	4574	4579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822656
103	NC_015422	TCG	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
104	NC_015422	GCC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
105	NC_015422	CGC	3	9	4682	4690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
106	NC_015422	CTG	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
107	NC_015422	CGG	2	6	4742	4747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
108	NC_015422	CGA	2	6	4772	4777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
109	NC_015422	GGA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
110	NC_015422	GCG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
111	NC_015422	CCG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
112	NC_015422	GCC	2	6	5026	5031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
113	NC_015422	ACC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
114	NC_015422	AGC	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
115	NC_015422	TCA	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
116	NC_015422	CGA	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
117	NC_015422	CGC	2	6	5093	5098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
118	NC_015422	GCC	2	6	5109	5114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
119	NC_015422	AGG	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
120	NC_015422	GCG	2	6	5158	5163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
121	NC_015422	AGG	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
122	NC_015422	CAC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
123	NC_015422	AGC	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
124	NC_015422	ACC	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
125	NC_015422	GCC	2	6	5323	5328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
126	NC_015422	TGC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
127	NC_015422	CGA	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
128	NC_015422	CGA	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
129	NC_015422	GCC	2	6	5516	5521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015422	CGC	2	6	5529	5534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822657
131	NC_015422	GGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822657
132	NC_015422	GGC	2	6	5883	5888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822657
133	NC_015422	GTT	2	6	6009	6014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822657
134	NC_015422	CTA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822657
135	NC_015422	TGT	2	6	6319	6324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822658
136	NC_015422	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822658
137	NC_015422	AGC	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822658
138	NC_015422	TGA	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822658
139	NC_015422	CCA	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822658
140	NC_015422	TCC	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822658
141	NC_015422	TCA	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822658
142	NC_015422	CGT	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822658
143	NC_015422	GGC	2	6	6940	6945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822658
144	NC_015422	GCT	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822658
145	NC_015422	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822658
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148	NC_015422	CAG	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822658
149	NC_015422	TGA	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015422	TGC	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015422	AGC	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015422	CAC	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_015422	GCT	2	6	7437	7442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015422	GCC	2	6	7508	7513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_015422	TGC	2	6	7524	7529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015422	AGG	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015422	AGT	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822659
158	NC_015422	CGG	2	6	7943	7948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822659
159	NC_015422	GCT	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822659
160	NC_015422	TGC	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822659
161	NC_015422	CCA	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822659
162	NC_015422	GTG	3	9	8360	8368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822659
163	NC_015422	ACG	2	6	8607	8612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822659
164	NC_015422	GCA	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822659
165	NC_015422	TCA	2	6	8654	8659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822659
166	NC_015422	TTC	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822659
167	NC_015422	CGG	2	6	8695	8700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822660
168	NC_015422	GTG	3	9	8809	8817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822660
169	NC_015422	CTT	2	6	8847	8852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822660
170	NC_015422	TCT	2	6	9013	9018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015422	CCT	2	6	9031	9036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_015422	CAC	2	6	9054	9059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_015422	GCC	2	6	9068	9073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_015422	CCA	2	6	9117	9122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_015422	GCA	2	6	9355	9360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822661
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250	NC_015422	GGC	2	6	13575	13580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822665
251	NC_015422	GCA	3	9	13592	13600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822665
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253	NC_015422	GCT	2	6	13862	13867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822666
254	NC_015422	GAT	3	9	13881	13889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822666
255	NC_015422	GCA	2	6	13925	13930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822666
256	NC_015422	CTT	2	6	13965	13970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822666
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258	NC_015422	TGG	2	6	14051	14056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822666
259	NC_015422	TGC	2	6	14153	14158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822666
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382	NC_015422	ATG	2	6	20752	20757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822670
383	NC_015422	AGC	2	6	20761	20766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822670
384	NC_015422	TCG	2	6	20767	20772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822670
385	NC_015422	CGT	2	6	20774	20779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822670
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387	NC_015422	GCG	2	6	20798	20803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822670
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391	NC_015422	CTC	2	6	20943	20948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822670
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399	NC_015422	ACG	2	6	21136	21141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822670
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402	NC_015422	CCA	2	6	21299	21304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822670
403	NC_015422	CGC	2	6	21314	21319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822670
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414	NC_015422	GCG	2	6	21747	21752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822671
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421	NC_015422	GCC	2	6	22149	22154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822672
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495	NC_015422	GCG	2	6	25404	25409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822674
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498	NC_015422	CGC	2	6	25546	25551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822674
499	NC_015422	TCG	2	6	25587	25592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822674
500	NC_015422	TGC	2	6	25614	25619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822674

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