MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 89717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015422	AGC	2	6	183	188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
2	NC_015422	AGC	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
3	NC_015422	CTG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
4	NC_015422	CTG	2	6	341	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
5	NC_015422	GAG	2	6	482	487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822654
6	NC_015422	GCC	2	6	578	583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822654
7	NC_015422	CGG	2	6	634	639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822654
8	NC_015422	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822654
9	NC_015422	GCT	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
10	NC_015422	CGA	2	6	778	783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
11	NC_015422	CTG	3	9	812	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
12	NC_015422	CGA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
13	NC_015422	TTC	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822654
14	NC_015422	GGA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822654
15	NC_015422	TTC	2	6	869	874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822654
16	NC_015422	GCT	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
17	NC_015422	AAG	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
18	NC_015422	TGA	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822654
19	NC_015422	GCC	2	6	1006	1011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822654
20	NC_015422	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822654
21	NC_015422	GAG	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822654
22	NC_015422	CTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822654
23	NC_015422	CTG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
24	NC_015422	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
25	NC_015422	ACT	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822654
26	NC_015422	AAG	2	6	1310	1315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
27	NC_015422	AGA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822654
28	NC_015422	TGC	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822654
29	NC_015422	CAG	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
30	NC_015422	CAG	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822654
31	NC_015422	GAT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822654
32	NC_015422	TCG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
33	NC_015422	CAC	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822655
34	NC_015422	CAC	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822655
35	NC_015422	CCG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822655
36	NC_015422	GGC	2	6	1955	1960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822655
37	NC_015422	AGG	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822655
38	NC_015422	CTG	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
39	NC_015422	CTA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822655
40	NC_015422	TGG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822655
41	NC_015422	AGC	2	6	2198	2203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822655
42	NC_015422	AGG	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822655
43	NC_015422	CTG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
44	NC_015422	CAA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822655
45	NC_015422	ACC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822655
46	NC_015422	TCA	2	6	2421	2426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822655
47	NC_015422	CAT	2	6	2470	2475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822655
48	NC_015422	AGG	3	9	2553	2561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822655
49	NC_015422	CGG	2	6	2587	2592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822655
50	NC_015422	GTC	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
51	NC_015422	ACA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822655
52	NC_015422	CGT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822655
53	NC_015422	CGA	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
54	NC_015422	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
55	NC_015422	CAC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
56	NC_015422	GGT	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822656
57	NC_015422	CGA	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
58	NC_015422	CGA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
59	NC_015422	TCG	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
60	NC_015422	GAC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
61	NC_015422	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
62	NC_015422	GGC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
63	NC_015422	GGC	2	6	3276	3281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
64	NC_015422	GAA	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822656
65	NC_015422	GTG	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822656
66	NC_015422	GGT	2	6	3407	3412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822656
67	NC_015422	CAA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822656
68	NC_015422	CGA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
69	NC_015422	AGG	2	6	3610	3615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
70	NC_015422	TCA	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
71	NC_015422	GAA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822656
72	NC_015422	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
73	NC_015422	CGG	2	6	3731	3736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
74	NC_015422	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
75	NC_015422	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822656
76	NC_015422	CGG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
77	NC_015422	AAG	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822656
78	NC_015422	GCG	2	6	3937	3942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
79	NC_015422	TGC	2	6	3963	3968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
80	NC_015422	CAG	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
81	NC_015422	CAG	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
82	NC_015422	GGA	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
83	NC_015422	TCG	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
84	NC_015422	GGA	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
85	NC_015422	TCG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
86	NC_015422	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
87	NC_015422	CCG	2	6	4285	4290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
88	NC_015422	ATC	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
89	NC_015422	GCG	2	6	4471	4476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
90	NC_015422	CGA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
91	NC_015422	CGC	2	6	4490	4495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
92	NC_015422	ACC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
93	NC_015422	CAT	4	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
94	NC_015422	CTG	3	9	4563	4571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
95	NC_015422	CTT	2	6	4574	4579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822656
96	NC_015422	TCG	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
97	NC_015422	GCC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
98	NC_015422	CGC	3	9	4682	4690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
99	NC_015422	CTG	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
100	NC_015422	CGG	2	6	4742	4747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
101	NC_015422	CGA	2	6	4772	4777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
102	NC_015422	GGA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
103	NC_015422	GCG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
104	NC_015422	CCG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
105	NC_015422	GCC	2	6	5026	5031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
106	NC_015422	ACC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
107	NC_015422	AGC	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
108	NC_015422	TCA	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822656
109	NC_015422	CGA	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
110	NC_015422	CGC	2	6	5093	5098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
111	NC_015422	GCC	2	6	5109	5114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
112	NC_015422	AGG	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
113	NC_015422	GCG	2	6	5158	5163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822656
114	NC_015422	AGG	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822656
115	NC_015422	CAC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
116	NC_015422	AGC	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
117	NC_015422	ACC	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822656
118	NC_015422	GCC	2	6	5323	5328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822656
119	NC_015422	TGC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822656
120	NC_015422	CGA	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
121	NC_015422	CGA	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822656
122	NC_015422	CGC	2	6	5529	5534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822657
123	NC_015422	GGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822657
124	NC_015422	GGC	2	6	5883	5888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822657
125	NC_015422	GTT	2	6	6009	6014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822657
126	NC_015422	CTA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822657
127	NC_015422	TGT	2	6	6319	6324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822658
128	NC_015422	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822658
129	NC_015422	AGC	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822658
130	NC_015422	TGA	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822658
131	NC_015422	CCA	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822658
132	NC_015422	TCC	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822658
133	NC_015422	TCA	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822658
134	NC_015422	CGT	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822658
135	NC_015422	GGC	2	6	6940	6945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822658
136	NC_015422	GCT	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822658
137	NC_015422	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822658
138	NC_015422	GGC	2	6	7075	7080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822658
139	NC_015422	AAC	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822658
140	NC_015422	CAG	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822658
141	NC_015422	AGT	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822659
142	NC_015422	CGG	2	6	7943	7948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822659
143	NC_015422	GCT	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822659
144	NC_015422	TGC	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822659
145	NC_015422	CCA	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822659
146	NC_015422	GTG	3	9	8360	8368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822659
147	NC_015422	ACG	2	6	8607	8612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822659
148	NC_015422	GCA	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822659
149	NC_015422	TCA	2	6	8654	8659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822659
150	NC_015422	TTC	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822659
151	NC_015422	CGG	2	6	8695	8700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822660
152	NC_015422	GTG	3	9	8809	8817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822660
153	NC_015422	CTT	2	6	8847	8852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822660
154	NC_015422	GCA	2	6	9355	9360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822661
155	NC_015422	TCC	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822661
156	NC_015422	TGT	2	6	9385	9390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822661
157	NC_015422	CGA	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822661
158	NC_015422	CCG	2	6	9475	9480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822661
159	NC_015422	AAG	2	6	9519	9524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822661
160	NC_015422	CAA	2	6	9529	9534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822661
161	NC_015422	TGA	3	9	9541	9549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822661
162	NC_015422	CGA	2	6	9562	9567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822661
163	NC_015422	AAC	2	6	9617	9622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822661
164	NC_015422	AGC	2	6	9645	9650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822661
165	NC_015422	CTG	2	6	9680	9685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822661
166	NC_015422	TCG	2	6	10485	10490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822662
167	NC_015422	CTG	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822662
168	NC_015422	GGC	2	6	10656	10661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822662
169	NC_015422	CGC	2	6	10753	10758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822662
170	NC_015422	GCG	2	6	10783	10788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822662
171	NC_015422	GCC	2	6	10800	10805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822662
172	NC_015422	CGC	2	6	10899	10904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822663
173	NC_015422	CAG	2	6	10943	10948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822663
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179	NC_015422	GTT	2	6	11342	11347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822663
180	NC_015422	GCG	2	6	11431	11436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822663
181	NC_015422	TCA	2	6	11647	11652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822663
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189	NC_015422	CGG	2	6	11951	11956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822663
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197	NC_015422	ACG	2	6	12333	12338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822664
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200	NC_015422	GCC	2	6	12454	12459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822664
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204	NC_015422	CGG	2	6	12688	12693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822664
205	NC_015422	CGC	2	6	12719	12724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822664
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212	NC_015422	CAG	2	6	13126	13131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822665
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214	NC_015422	GCT	2	6	13215	13220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822665
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218	NC_015422	CTG	2	6	13333	13338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822665
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222	NC_015422	GCA	3	9	13592	13600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822665
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225	NC_015422	GAT	3	9	13881	13889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822666
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229	NC_015422	TGG	2	6	14051	14056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822666
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238	NC_015422	CAG	2	6	14559	14564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822666
239	NC_015422	CAC	2	6	14589	14594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822666
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241	NC_015422	CGC	2	6	14705	14710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822666
242	NC_015422	CGA	2	6	14723	14728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822666
243	NC_015422	GCG	2	6	14761	14766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822666
244	NC_015422	CGC	2	6	14796	14801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822666
245	NC_015422	GCA	2	6	14831	14836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822666
246	NC_015422	CAG	2	6	14953	14958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822667
247	NC_015422	GCC	4	12	15007	15018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822667
248	NC_015422	GCA	2	6	15030	15035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822667
249	NC_015422	CGG	2	6	15120	15125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822667
250	NC_015422	GCA	2	6	15138	15143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822667
251	NC_015422	CGT	2	6	15186	15191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822667
252	NC_015422	CGC	2	6	15201	15206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822667
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254	NC_015422	GCC	2	6	15305	15310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822667
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383	NC_015422	GTA	2	6	21972	21977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822671
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482	NC_015422	GCC	2	6	26873	26878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822675
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489	NC_015422	GTC	2	6	27205	27210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822676
490	NC_015422	TGG	2	6	27249	27254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822676
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493	NC_015422	GCC	2	6	27349	27354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822676
494	NC_015422	CTG	2	6	27368	27373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822676
495	NC_015422	TGG	2	6	27423	27428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822676
496	NC_015422	CGG	2	6	27433	27438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822676
497	NC_015422	GGC	2	6	27503	27508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822676
498	NC_015422	ACC	2	6	27522	27527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822676
499	NC_015422	GGC	2	6	27567	27572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822676
500	NC_015422	CGA	2	6	27672	27677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822677

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