MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC03

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015421	TAG	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015421	TTC	2	6	548	553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370667
3	NC_015421	TGA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
4	NC_015421	AGC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
5	NC_015421	ACT	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
6	NC_015421	GAC	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
7	NC_015421	AGA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
8	NC_015421	CTT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370667
9	NC_015421	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
10	NC_015421	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370667
11	NC_015421	GCG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370667
12	NC_015421	ATC	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
13	NC_015421	GAC	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
14	NC_015421	GAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
15	NC_015421	TGA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370667
16	NC_015421	AAG	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370667
17	NC_015421	ACT	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
18	NC_015421	TCA	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370667
19	NC_015421	AGC	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370667
20	NC_015421	AGG	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015421	ATT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370668
22	NC_015421	TAT	2	6	2025	2030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370668
23	NC_015421	CAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370669
24	NC_015421	TCT	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370669
25	NC_015421	TAT	2	6	2414	2419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370669
26	NC_015421	CTG	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370669
27	NC_015421	ACG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370669
28	NC_015421	TGG	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370669
29	NC_015421	ACC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370669
30	NC_015421	CTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015421	TGT	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015421	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015421	TAT	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015421	GTG	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015421	CAG	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015421	TAT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015421	GCG	2	6	3399	3404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330370670
38	NC_015421	TGA	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370670
39	NC_015421	AAT	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370670
40	NC_015421	TTG	2	6	3553	3558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370670
41	NC_015421	ATC	2	6	3604	3609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370670
42	NC_015421	TTG	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370670
43	NC_015421	CCT	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330370671
44	NC_015421	GTT	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370671
45	NC_015421	TTG	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370671
46	NC_015421	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015421	AAG	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370672
48	NC_015421	TTG	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370672
49	NC_015421	GAT	3	9	4574	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370672
50	NC_015421	TAT	2	6	4677	4682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370673
51	NC_015421	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370673
52	NC_015421	AGC	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370673
53	NC_015421	CAA	3	9	4720	4728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370673
54	NC_015421	ACC	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370673
55	NC_015421	TGG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370673
56	NC_015421	AGA	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370673
57	NC_015421	TAT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015421	TGG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370674
59	NC_015421	CTG	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370674
60	NC_015421	TCT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370674
61	NC_015421	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015421	GTC	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370675
63	NC_015421	GCA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370675
64	NC_015421	AAC	2	6	6014	6019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370675
65	NC_015421	CAA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330370675
66	NC_015421	TTC	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370675
67	NC_015421	TGA	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330370675
68	NC_015421	AGC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370675
69	NC_015421	CAT	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370675
70	NC_015421	ATA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015421	TAA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015421	GCA	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015421	TTA	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015421	GAA	2	6	6766	6771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015421	TAA	2	6	6790	6795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015421	ACT	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015421	ACT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015421	AGT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015421	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015421	CTA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015421	CAG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015421	TTA	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015421	GTG	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015421	TGT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015421	TAA	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015421	AAG	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015421	TGG	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370676
88	NC_015421	ACC	2	6	7773	7778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370676
89	NC_015421	CGT	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330370676
90	NC_015421	CAG	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330370676
91	NC_015421	ATA	2	6	8002	8007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370676
92	NC_015421	AGA	2	6	8209	8214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370676
93	NC_015421	TTG	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370676
94	NC_015421	ATA	2	6	8429	8434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015421	CTT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370677
96	NC_015421	AAT	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330370677
97	NC_015421	TGG	2	6	8647	8652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370677
98	NC_015421	CAC	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370677
99	NC_015421	ACC	2	6	8755	8760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370677
100	NC_015421	TCC	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015421	AAT	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015421	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015421	CAG	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015421	TTC	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015421	AAG	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015421	GTT	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015421	TGC	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015421	TGG	2	6	9162	9167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015421	AAC	2	6	9272	9277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015421	TTA	2	6	9335	9340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370678
111	NC_015421	GGA	2	6	9496	9501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330370678
112	NC_015421	CCA	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370678
113	NC_015421	ATC	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370678
114	NC_015421	TGG	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330370679
115	NC_015421	ATT	2	6	9894	9899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370679
116	NC_015421	ATC	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370679
117	NC_015421	CTT	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015421	TGA	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015421	TAC	2	6	10059	10064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330370680
120	NC_015421	CCA	2	6	10073	10078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330370680
121	NC_015421	TAT	2	6	10081	10086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370680
122	NC_015421	TAT	3	9	10117	10125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370680
123	NC_015421	ATT	2	6	10187	10192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330370680
124	NC_015421	AGA	2	6	10241	10246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330370680
125	NC_015421	TTG	2	6	10322	10327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
126	NC_015421	TGT	2	6	10341	10346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
127	NC_015421	TTG	2	6	10358	10363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
128	NC_015421	GTT	2	6	10378	10383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330370680
129	NC_015421	TTC	2	6	10595	10600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330370680
130	NC_015421	TTG	2	6	10708	10713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.