MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC03

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015421	TAG	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015421	AGG	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015421	CTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015421	TGT	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015421	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015421	TAT	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015421	GTG	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015421	CAG	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015421	TAT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015421	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015421	TAT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015421	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015421	ATA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015421	TAA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015421	GCA	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015421	TTA	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015421	GAA	2	6	6766	6771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015421	TAA	2	6	6790	6795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015421	ACT	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015421	ACT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015421	AGT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015421	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015421	CTA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015421	CAG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015421	TTA	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015421	GTG	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015421	TGT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015421	TAA	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015421	AAG	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015421	ATA	2	6	8429	8434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015421	TCC	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015421	AAT	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015421	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015421	CAG	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015421	TTC	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015421	AAG	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015421	GTT	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015421	TGC	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015421	TGG	2	6	9162	9167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015421	AAC	2	6	9272	9277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015421	CTT	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015421	TGA	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015421	TTG	2	6	10708	10713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.