MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015420	AAATG	2	10	71	80	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015420	TTCTT	2	10	2338	2347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015420	AAATT	2	10	2632	2641	60 %	40 %	0 %	0 %	330818919
4	NC_015420	GGCGT	2	10	3675	3684	0 %	20 %	60 %	20 %	330818920
5	NC_015420	AAAAG	2	10	3842	3851	80 %	0 %	20 %	0 %	330818920
6	NC_015420	TATAC	2	10	3956	3965	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015420	TTAGC	2	10	4475	4484	20 %	40 %	20 %	20 %	330818922
8	NC_015420	AAATC	2	10	10345	10354	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015420	CTTTG	2	10	10731	10740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015420	AGGTA	2	10	11000	11009	40 %	20 %	40 %	0 %	330818927
11	NC_015420	ATCCG	2	10	14488	14497	20 %	20 %	20 %	40 %	330818928
12	NC_015420	TTTGG	2	10	17012	17021	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015420	CTTCA	2	10	17573	17582	20 %	40 %	0 %	40 %	330818931
14	NC_015420	GAAAA	2	10	20121	20130	80 %	0 %	20 %	0 %	330818933
15	NC_015420	ATTCA	2	10	23452	23461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015420	TGGCC	2	10	23786	23795	0 %	20 %	40 %	40 %	330818936
17	NC_015420	TGTTT	2	10	23885	23894	0 %	80 %	20 %	0 %	330818936
18	NC_015420	TATAG	2	10	28743	28752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015420	AAAAG	2	10	30468	30477	80 %	0 %	20 %	0 %	330818943
20	NC_015420	TAGAA	2	10	32818	32827	60 %	20 %	20 %	0 %	330818946
21	NC_015420	TTATT	2	10	33499	33508	20 %	80 %	0 %	0 %	330818946
22	NC_015420	CAGAT	2	10	34161	34170	40 %	20 %	20 %	20 %	330818947
23	NC_015420	ATTAT	2	10	34422	34431	40 %	60 %	0 %	0 %	330818947
24	NC_015420	CATGC	2	10	36750	36759	20 %	20 %	20 %	40 %	330818948
25	NC_015420	TATTT	2	10	37918	37927	20 %	80 %	0 %	0 %	330818949
26	NC_015420	AAATA	2	10	38078	38087	80 %	20 %	0 %	0 %	330818949
27	NC_015420	GTAAA	2	10	38547	38556	60 %	20 %	20 %	0 %	330818949
28	NC_015420	TTGAT	2	10	39393	39402	20 %	60 %	20 %	0 %	330818950
29	NC_015420	TTTGC	2	10	40166	40175	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015420	TTGAC	2	10	40849	40858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015420	GCATG	2	10	41250	41259	20 %	20 %	40 %	20 %	330818952
32	NC_015420	CATTT	2	10	43237	43246	20 %	60 %	0 %	20 %	330818954
33	NC_015420	ATTAT	2	10	43312	43321	40 %	60 %	0 %	0 %	330818954
34	NC_015420	AAATA	2	10	49579	49588	80 %	20 %	0 %	0 %	330818960
35	NC_015420	TTTGA	2	10	50691	50700	20 %	60 %	20 %	0 %	330818962

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.