MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015420	TAAA	2	8	109	116	75 %	25 %	0 %	0 %	330818918
2	NC_015420	AAGT	2	8	784	791	50 %	25 %	25 %	0 %	330818918
3	NC_015420	AACG	2	8	1087	1094	50 %	0 %	25 %	25 %	330818918
4	NC_015420	TTCA	2	8	1275	1282	25 %	50 %	0 %	25 %	330818918
5	NC_015420	TTTC	2	8	1494	1501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015420	TCAA	2	8	2165	2172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015420	TGAA	2	8	2462	2469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015420	CGCT	2	8	2713	2720	0 %	25 %	25 %	50 %	330818919
9	NC_015420	GTTT	2	8	3538	3545	0 %	75 %	25 %	0 %	330818920
10	NC_015420	AGTT	2	8	4551	4558	25 %	50 %	25 %	0 %	330818922
11	NC_015420	GTTT	2	8	4595	4602	0 %	75 %	25 %	0 %	330818922
12	NC_015420	TAAT	2	8	6103	6110	50 %	50 %	0 %	0 %	330818922
13	NC_015420	TAAT	2	8	6124	6131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015420	TGGA	2	8	6225	6232	25 %	25 %	50 %	0 %	330818923
15	NC_015420	ATTG	2	8	6855	6862	25 %	50 %	25 %	0 %	330818923
16	NC_015420	GTAT	2	8	7016	7023	25 %	50 %	25 %	0 %	330818923
17	NC_015420	ATCA	2	8	7191	7198	50 %	25 %	0 %	25 %	330818923
18	NC_015420	CATC	2	8	7221	7228	25 %	25 %	0 %	50 %	330818923
19	NC_015420	ATGG	2	8	7720	7727	25 %	25 %	50 %	0 %	330818924
20	NC_015420	ATTT	2	8	7847	7854	25 %	75 %	0 %	0 %	330818925
21	NC_015420	AACA	2	8	8319	8326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015420	AATT	2	8	8591	8598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015420	TTTG	2	8	8723	8730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015420	TGAT	2	8	8881	8888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015420	ACAT	2	8	9195	9202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015420	CTTG	2	8	11020	11027	0 %	50 %	25 %	25 %	330818927
27	NC_015420	TTTA	2	8	11051	11058	25 %	75 %	0 %	0 %	330818927
28	NC_015420	TGAT	2	8	11118	11125	25 %	50 %	25 %	0 %	330818927
29	NC_015420	CAAT	2	8	11173	11180	50 %	25 %	0 %	25 %	330818927
30	NC_015420	TGGC	2	8	12054	12061	0 %	25 %	50 %	25 %	330818927
31	NC_015420	GTTC	2	8	12977	12984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015420	TAAC	2	8	13865	13872	50 %	25 %	0 %	25 %	330818928
33	NC_015420	CGTT	2	8	13948	13955	0 %	50 %	25 %	25 %	330818928
34	NC_015420	TTTA	2	8	14082	14089	25 %	75 %	0 %	0 %	330818928
35	NC_015420	CAAC	2	8	14582	14589	50 %	0 %	0 %	50 %	330818928
36	NC_015420	TTGC	2	8	14631	14638	0 %	50 %	25 %	25 %	330818928
37	NC_015420	TGCG	2	8	14724	14731	0 %	25 %	50 %	25 %	330818928
38	NC_015420	TTCT	2	8	14817	14824	0 %	75 %	0 %	25 %	330818928
39	NC_015420	TCTT	2	8	14896	14903	0 %	75 %	0 %	25 %	330818928
40	NC_015420	GTTC	2	8	16114	16121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015420	TTAA	2	8	16332	16339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015420	ATTT	2	8	16831	16838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015420	TAAC	2	8	17232	17239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015420	ATTG	2	8	17732	17739	25 %	50 %	25 %	0 %	330818931
45	NC_015420	GCTG	2	8	17761	17768	0 %	25 %	50 %	25 %	330818931
46	NC_015420	TGGC	2	8	17789	17796	0 %	25 %	50 %	25 %	330818931
47	NC_015420	TTGG	2	8	18045	18052	0 %	50 %	50 %	0 %	330818931
48	NC_015420	TGAT	2	8	18237	18244	25 %	50 %	25 %	0 %	330818931
49	NC_015420	TTGG	2	8	18255	18262	0 %	50 %	50 %	0 %	330818931
50	NC_015420	GTAT	2	8	18437	18444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015420	TTTA	2	8	18802	18809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015420	TTTA	2	8	18819	18826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015420	TTTA	2	8	18903	18910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015420	TTTA	2	8	18920	18927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015420	TAAA	2	8	18932	18939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015420	AAAC	2	8	19133	19140	75 %	0 %	0 %	25 %	330818932
57	NC_015420	TGAT	2	8	19567	19574	25 %	50 %	25 %	0 %	330818932
58	NC_015420	TCAA	2	8	20003	20010	50 %	25 %	0 %	25 %	330818933
59	NC_015420	AAAG	2	8	20061	20068	75 %	0 %	25 %	0 %	330818933
60	NC_015420	ATTA	2	8	20369	20376	50 %	50 %	0 %	0 %	330818934
61	NC_015420	ATGG	2	8	20494	20501	25 %	25 %	50 %	0 %	330818934
62	NC_015420	AGCC	2	8	20889	20896	25 %	0 %	25 %	50 %	330818934
63	NC_015420	TTGG	2	8	21241	21248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015420	ATTA	2	8	21303	21310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015420	ATCT	2	8	21447	21454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015420	TTGT	2	8	21460	21467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015420	AAAT	2	8	21614	21621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015420	GTTG	2	8	21931	21938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015420	AAGC	2	8	22197	22204	50 %	0 %	25 %	25 %	330818935
70	NC_015420	TGGC	2	8	22942	22949	0 %	25 %	50 %	25 %	330818935
71	NC_015420	TTTA	2	8	23100	23107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015420	GAAT	2	8	23167	23174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015420	TTCC	2	8	23929	23936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015420	AGGA	2	8	24266	24273	50 %	0 %	50 %	0 %	330818937
75	NC_015420	CATT	2	8	24496	24503	25 %	50 %	0 %	25 %	330818937
76	NC_015420	ATTT	2	8	24818	24825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015420	AAAT	2	8	24847	24854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015420	TTAG	2	8	25216	25223	25 %	50 %	25 %	0 %	330818938
79	NC_015420	TCGA	2	8	25287	25294	25 %	25 %	25 %	25 %	330818938
80	NC_015420	GATT	2	8	25417	25424	25 %	50 %	25 %	0 %	330818938
81	NC_015420	TTCG	2	8	25796	25803	0 %	50 %	25 %	25 %	330818938
82	NC_015420	GTTT	2	8	27259	27266	0 %	75 %	25 %	0 %	330818940
83	NC_015420	ACCA	2	8	27508	27515	50 %	0 %	0 %	50 %	330818940
84	NC_015420	ACTT	2	8	27526	27533	25 %	50 %	0 %	25 %	330818940
85	NC_015420	GATA	2	8	28636	28643	50 %	25 %	25 %	0 %	330818941
86	NC_015420	TTAA	2	8	29116	29123	50 %	50 %	0 %	0 %	330818942
87	NC_015420	TCTG	2	8	29428	29435	0 %	50 %	25 %	25 %	330818942
88	NC_015420	ACAT	2	8	29536	29543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015420	CATG	2	8	29640	29647	25 %	25 %	25 %	25 %	330818943
90	NC_015420	GAAA	2	8	29650	29657	75 %	0 %	25 %	0 %	330818943
91	NC_015420	ATGA	2	8	30629	30636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015420	ATGA	2	8	30823	30830	50 %	25 %	25 %	0 %	330818944
93	NC_015420	TCAA	2	8	31330	31337	50 %	25 %	0 %	25 %	330818944
94	NC_015420	TTCG	2	8	31490	31497	0 %	50 %	25 %	25 %	330818944
95	NC_015420	TCCA	2	8	32042	32049	25 %	25 %	0 %	50 %	330818944
96	NC_015420	AACG	2	8	32729	32736	50 %	0 %	25 %	25 %	330818946
97	NC_015420	TGGT	2	8	33930	33937	0 %	50 %	50 %	0 %	330818947
98	NC_015420	AATT	2	8	34234	34241	50 %	50 %	0 %	0 %	330818947
99	NC_015420	GACC	2	8	34279	34286	25 %	0 %	25 %	50 %	330818947
100	NC_015420	TTCC	2	8	34294	34301	0 %	50 %	0 %	50 %	330818947
101	NC_015420	AATG	2	8	35085	35092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015420	ACAG	2	8	35129	35136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015420	AATT	2	8	36287	36294	50 %	50 %	0 %	0 %	330818948
104	NC_015420	AAAC	2	8	37155	37162	75 %	0 %	0 %	25 %	330818949
105	NC_015420	AATA	2	8	37213	37220	75 %	25 %	0 %	0 %	330818949
106	NC_015420	ACAA	2	8	37286	37293	75 %	0 %	0 %	25 %	330818949
107	NC_015420	AAAT	2	8	37365	37372	75 %	25 %	0 %	0 %	330818949
108	NC_015420	GCCT	2	8	37553	37560	0 %	25 %	25 %	50 %	330818949
109	NC_015420	TTCA	2	8	37990	37997	25 %	50 %	0 %	25 %	330818949
110	NC_015420	AAAG	2	8	38305	38312	75 %	0 %	25 %	0 %	330818949
111	NC_015420	CAAC	2	8	39514	39521	50 %	0 %	0 %	50 %	330818950
112	NC_015420	CGTA	2	8	39867	39874	25 %	25 %	25 %	25 %	330818951
113	NC_015420	TCTG	2	8	40685	40692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015420	CATT	2	8	40873	40880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015420	TCGC	2	8	41301	41308	0 %	25 %	25 %	50 %	330818952
116	NC_015420	AATT	2	8	41715	41722	50 %	50 %	0 %	0 %	330818952
117	NC_015420	ATGA	2	8	42034	42041	50 %	25 %	25 %	0 %	330818953
118	NC_015420	CGTT	2	8	42223	42230	0 %	50 %	25 %	25 %	330818953
119	NC_015420	ACTT	2	8	42526	42533	25 %	50 %	0 %	25 %	330818953
120	NC_015420	TCTT	2	8	43411	43418	0 %	75 %	0 %	25 %	330818954
121	NC_015420	ATAA	2	8	44568	44575	75 %	25 %	0 %	0 %	330818955
122	NC_015420	ATAA	2	8	44679	44686	75 %	25 %	0 %	0 %	330818955
123	NC_015420	CATA	2	8	44934	44941	50 %	25 %	0 %	25 %	330818955
124	NC_015420	TGCT	2	8	45019	45026	0 %	50 %	25 %	25 %	330818955
125	NC_015420	AATT	2	8	45239	45246	50 %	50 %	0 %	0 %	330818955
126	NC_015420	TAAC	2	8	45631	45638	50 %	25 %	0 %	25 %	330818956
127	NC_015420	TAAA	2	8	46180	46187	75 %	25 %	0 %	0 %	330818956
128	NC_015420	GAAT	2	8	46335	46342	50 %	25 %	25 %	0 %	330818956
129	NC_015420	AATT	2	8	46343	46350	50 %	50 %	0 %	0 %	330818956
130	NC_015420	TTGT	2	8	47218	47225	0 %	75 %	25 %	0 %	330818957
131	NC_015420	CAAA	2	8	47583	47590	75 %	0 %	0 %	25 %	330818958
132	NC_015420	TTAA	2	8	47930	47937	50 %	50 %	0 %	0 %	330818958
133	NC_015420	TAAA	2	8	47976	47983	75 %	25 %	0 %	0 %	330818958
134	NC_015420	AATT	2	8	48091	48098	50 %	50 %	0 %	0 %	330818958
135	NC_015420	TTTC	2	8	48403	48410	0 %	75 %	0 %	25 %	330818959
136	NC_015420	TCTT	2	8	48699	48706	0 %	75 %	0 %	25 %	330818959
137	NC_015420	ATTA	2	8	49171	49178	50 %	50 %	0 %	0 %	330818960
138	NC_015420	AATT	2	8	49321	49328	50 %	50 %	0 %	0 %	330818960
139	NC_015420	ATCA	2	8	49864	49871	50 %	25 %	0 %	25 %	330818960
140	NC_015420	AATT	2	8	50186	50193	50 %	50 %	0 %	0 %	330818961
141	NC_015420	AATA	2	8	50390	50397	75 %	25 %	0 %	0 %	330818961
142	NC_015420	ACCA	2	8	50855	50862	50 %	0 %	0 %	50 %	330818962
143	NC_015420	TTAA	2	8	51168	51175	50 %	50 %	0 %	0 %	330818962
144	NC_015420	AATC	2	8	52053	52060	50 %	25 %	0 %	25 %	330818963
145	NC_015420	ATTT	2	8	52587	52594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015420	AATA	2	8	52595	52602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.