MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015420	TTTC	2	8	1494	1501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015420	TCAA	2	8	2165	2172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015420	TGAA	2	8	2462	2469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015420	TAAT	2	8	6124	6131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015420	AACA	2	8	8319	8326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015420	AATT	2	8	8591	8598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015420	TTTG	2	8	8723	8730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015420	TGAT	2	8	8881	8888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015420	ACAT	2	8	9195	9202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015420	GTTC	2	8	12977	12984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015420	GTTC	2	8	16114	16121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015420	TTAA	2	8	16332	16339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015420	ATTT	2	8	16831	16838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015420	TAAC	2	8	17232	17239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015420	GTAT	2	8	18437	18444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015420	TTTA	2	8	18802	18809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015420	TTTA	2	8	18819	18826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015420	TTTA	2	8	18903	18910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015420	TTTA	2	8	18920	18927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015420	TAAA	2	8	18932	18939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015420	TTGG	2	8	21241	21248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015420	ATTA	2	8	21303	21310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015420	ATCT	2	8	21447	21454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015420	TTGT	2	8	21460	21467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015420	AAAT	2	8	21614	21621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015420	GTTG	2	8	21931	21938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015420	TTTA	2	8	23100	23107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015420	GAAT	2	8	23167	23174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015420	TTCC	2	8	23929	23936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015420	ATTT	2	8	24818	24825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015420	AAAT	2	8	24847	24854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015420	ACAT	2	8	29536	29543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015420	ATGA	2	8	30629	30636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015420	AATG	2	8	35085	35092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015420	ACAG	2	8	35129	35136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015420	TCTG	2	8	40685	40692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015420	CATT	2	8	40873	40880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015420	ATTT	2	8	52587	52594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015420	AATA	2	8	52595	52602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.