MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015420	ATA	3	9	13	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015420	ATT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015420	ATA	2	6	92	97	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015420	CCT	2	6	1292	1297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015420	ATC	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015420	CTG	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015420	TTG	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015420	GAT	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015420	ATG	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015420	TCA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015420	GTT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015420	AAT	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015420	TAA	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015420	ATT	2	6	2263	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015420	TTG	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015420	CCT	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015420	GTG	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015420	ATG	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015420	ATT	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015420	TAA	2	6	3217	3222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015420	GAT	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015420	AGG	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015420	GGA	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015420	ATT	2	6	8486	8491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015420	CTT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015420	ATT	2	6	8617	8622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015420	CAA	2	6	8907	8912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015420	TCT	2	6	8941	8946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015420	AAT	2	6	9104	9109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015420	GCC	2	6	9226	9231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015420	GAC	2	6	9258	9263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015420	GTT	2	6	9412	9417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015420	TTC	2	6	9476	9481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015420	TGT	2	6	9519	9524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015420	TTG	3	9	9545	9553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015420	TTA	2	6	9570	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015420	CTT	2	6	9625	9630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015420	TTG	2	6	9675	9680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015420	CCA	2	6	9933	9938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015420	AAT	2	6	10036	10041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015420	TGA	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015420	GGT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015420	CTT	2	6	10226	10231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015420	AAT	2	6	10232	10237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015420	ATG	2	6	10373	10378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015420	GTT	2	6	10753	10758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015420	TGT	2	6	15162	15167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015420	CTG	2	6	15262	15267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015420	ATT	2	6	15363	15368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015420	GGT	2	6	15609	15614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015420	ATA	2	6	16097	16102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015420	CAC	2	6	16162	16167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015420	TTA	2	6	16182	16187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015420	TTG	2	6	16229	16234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015420	TCG	2	6	16276	16281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015420	GGT	2	6	16341	16346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015420	CAT	2	6	16474	16479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015420	TAT	2	6	16531	16536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015420	CAT	2	6	16605	16610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015420	GCA	2	6	16874	16879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015420	AAT	2	6	17080	17085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015420	CAT	2	6	17251	17256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015420	ACA	2	6	17271	17276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015420	ATC	2	6	18399	18404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015420	TCA	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015420	TGT	2	6	18475	18480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015420	AAG	2	6	18565	18570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015420	ATA	2	6	18783	18788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015420	ATA	2	6	18884	18889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015420	GAT	2	6	19035	19040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015420	CTA	2	6	21255	21260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015420	ATA	2	6	21329	21334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015420	ATT	2	6	21365	21370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015420	TAA	2	6	21635	21640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015420	GGC	2	6	21671	21676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015420	CAG	2	6	21784	21789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015420	ATC	2	6	21941	21946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015420	CAT	2	6	23066	23071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015420	ATG	2	6	23204	23209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015420	TGG	2	6	23462	23467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015420	GCT	2	6	23487	23492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015420	GTT	2	6	23520	23525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015420	ATA	2	6	23578	23583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015420	TGG	2	6	23627	23632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015420	TAA	2	6	24020	24025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015420	TTC	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015420	ATA	2	6	24150	24155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015420	AAG	2	6	24193	24198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015420	CCT	2	6	24620	24625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015420	AAC	2	6	24661	24666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015420	ATT	2	6	24855	24860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015420	CAT	2	6	25858	25863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015420	AAT	3	9	26001	26009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015420	TAA	2	6	26716	26721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015420	GTC	2	6	26727	26732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015420	GAC	2	6	26748	26753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015420	TAA	2	6	28823	28828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015420	TAA	2	6	29512	29517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015420	TGG	2	6	30612	30617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015420	ATG	3	9	30650	30658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015420	TTA	2	6	30709	30714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015420	TCC	2	6	32092	32097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015420	TCT	2	6	32551	32556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015420	TAA	2	6	32571	32576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015420	GTT	2	6	32578	32583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015420	GTT	2	6	33539	33544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015420	GTG	2	6	33776	33781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015420	TTA	2	6	34701	34706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015420	TGA	2	6	34784	34789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015420	TGG	2	6	34796	34801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015420	TAG	2	6	34804	34809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015420	ATG	3	9	34885	34893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015420	AAG	2	6	35016	35021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015420	ATA	2	6	35098	35103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015420	CCA	2	6	35284	35289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015420	GGT	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015420	TGT	2	6	35335	35340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015420	GAA	2	6	35365	35370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015420	CAC	2	6	35420	35425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015420	AGC	2	6	35671	35676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015420	AGA	2	6	35710	35715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015420	GGT	2	6	35718	35723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015420	CGT	2	6	35750	35755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015420	AGA	2	6	35773	35778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015420	GAA	2	6	35921	35926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015420	AGA	2	6	35941	35946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015420	CGA	2	6	36064	36069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015420	GTG	2	6	36102	36107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015420	AAT	2	6	38692	38697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015420	CAA	2	6	38719	38724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015420	TTG	2	6	38737	38742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015420	TTA	2	6	38751	38756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015420	TTA	2	6	38772	38777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015420	TCT	2	6	38788	38793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015420	CTT	2	6	38824	38829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015420	TCC	2	6	39893	39898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015420	CAA	2	6	39929	39934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015420	TAC	2	6	39958	39963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015420	TAC	2	6	39983	39988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015420	ACT	2	6	40030	40035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015420	CCA	2	6	40048	40053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015420	ACA	2	6	40117	40122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015420	TAA	2	6	40232	40237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015420	CAT	2	6	40393	40398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015420	AAC	2	6	40436	40441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015420	GAG	2	6	40478	40483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015420	CTC	2	6	40642	40647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015420	ATC	2	6	40818	40823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015420	AAG	2	6	40965	40970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015420	ACC	2	6	41888	41893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_015420	AGG	2	6	42020	42025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015420	TTC	2	6	52526	52531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015420	ATT	2	6	52633	52638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015420	CTA	2	6	52644	52649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.