MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015420	CT	3	6	1396	1401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015420	AT	3	6	1411	1416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015420	AC	3	6	1484	1489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015420	CG	3	6	2998	3003	0 %	0 %	50 %	50 %	330818919
5	NC_015420	TC	3	6	4121	4126	0 %	50 %	0 %	50 %	330818921
6	NC_015420	AT	3	6	4337	4342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015420	TA	3	6	12424	12429	50 %	50 %	0 %	0 %	330818927
8	NC_015420	TG	3	6	14274	14279	0 %	50 %	50 %	0 %	330818928
9	NC_015420	AG	3	6	16612	16617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015420	GC	3	6	16880	16885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015420	GT	3	6	18492	18497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015420	TG	3	6	18581	18586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015420	GT	3	6	18711	18716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015420	AT	3	6	18873	18878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015420	TA	3	6	19119	19124	50 %	50 %	0 %	0 %	330818932
16	NC_015420	TG	3	6	21971	21976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015420	TC	3	6	22780	22785	0 %	50 %	0 %	50 %	330818935
18	NC_015420	AG	4	8	22814	22821	50 %	0 %	50 %	0 %	330818935
19	NC_015420	TA	3	6	23870	23875	50 %	50 %	0 %	0 %	330818936
20	NC_015420	GA	3	6	23941	23946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015420	CT	3	6	23965	23970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015420	TC	3	6	24250	24255	0 %	50 %	0 %	50 %	330818937
23	NC_015420	TC	4	8	24519	24526	0 %	50 %	0 %	50 %	330818937
24	NC_015420	AT	3	6	26108	26113	50 %	50 %	0 %	0 %	330818939
25	NC_015420	TA	3	6	26272	26277	50 %	50 %	0 %	0 %	330818939
26	NC_015420	AT	3	6	26363	26368	50 %	50 %	0 %	0 %	330818939
27	NC_015420	AT	3	6	27641	27646	50 %	50 %	0 %	0 %	330818940
28	NC_015420	GA	3	6	28507	28512	50 %	0 %	50 %	0 %	330818941
29	NC_015420	GT	3	6	29456	29461	0 %	50 %	50 %	0 %	330818942
30	NC_015420	TA	3	6	29565	29570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015420	GA	4	8	30755	30762	50 %	0 %	50 %	0 %	330818944
32	NC_015420	AT	3	6	31607	31612	50 %	50 %	0 %	0 %	330818944
33	NC_015420	AT	3	6	32083	32088	50 %	50 %	0 %	0 %	330818944
34	NC_015420	AT	3	6	32256	32261	50 %	50 %	0 %	0 %	330818945
35	NC_015420	TA	3	6	34353	34358	50 %	50 %	0 %	0 %	330818947
36	NC_015420	TG	3	6	34652	34657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015420	AT	3	6	37207	37212	50 %	50 %	0 %	0 %	330818949
38	NC_015420	AT	3	6	37301	37306	50 %	50 %	0 %	0 %	330818949
39	NC_015420	CT	3	6	38361	38366	0 %	50 %	0 %	50 %	330818949
40	NC_015420	GC	3	6	39818	39823	0 %	0 %	50 %	50 %	330818951
41	NC_015420	AT	3	6	43481	43486	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
42	NC_015420	TA	3	6	43575	43580	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
43	NC_015420	AT	3	6	43651	43656	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
44	NC_015420	AT	3	6	43739	43744	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
45	NC_015420	AT	4	8	44467	44474	50 %	50 %	0 %	0 %	330818955
46	NC_015420	GA	3	6	44749	44754	50 %	0 %	50 %	0 %	330818955
47	NC_015420	TA	3	6	45040	45045	50 %	50 %	0 %	0 %	330818955
48	NC_015420	TA	3	6	45610	45615	50 %	50 %	0 %	0 %	330818956
49	NC_015420	AT	3	6	46792	46797	50 %	50 %	0 %	0 %	330818957
50	NC_015420	TA	3	6	47321	47326	50 %	50 %	0 %	0 %	330818957
51	NC_015420	AT	3	6	47643	47648	50 %	50 %	0 %	0 %	330818958
52	NC_015420	AT	3	6	49301	49306	50 %	50 %	0 %	0 %	330818960
53	NC_015420	TA	4	8	51551	51558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015420	TA	3	6	52615	52620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.