MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p5BKT015925

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015419	TAT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015419	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015419	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015419	AGG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015419	AAT	2	6	536	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015419	AAG	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015419	CTA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015419	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015419	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015419	TAT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015419	ACA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015419	TGT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015419	TCT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015419	TTG	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015419	CCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015419	AAT	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015419	TCT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015419	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015419	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015419	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015419	ATT	2	6	2838	2843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015419	ATA	3	9	2844	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015419	ATA	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015419	TAT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015419	GTT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015419	AAC	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015419	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015419	GAT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015419	ATA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015419	ATA	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015419	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015419	TAG	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015419	CCA	2	6	5158	5163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015419	CTA	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015419	ATT	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015419	GTA	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015419	TAC	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015419	TTA	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015419	AAC	2	6	5791	5796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015419	TTA	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015419	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015419	ATT	2	6	6295	6300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015419	TAT	2	6	6476	6481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015419	TAT	2	6	6503	6508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015419	CAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015419	ATA	3	9	7099	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015419	AAT	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015419	TCC	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015419	AGT	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015419	TCA	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015419	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015419	ATT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015419	TAT	2	6	7954	7959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015419	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015419	GTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015419	TTG	2	6	8671	8676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015419	TTG	2	6	8705	8710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015419	CTT	2	6	8809	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015419	CAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015419	AAT	2	6	10779	10784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015419	AGT	2	6	10929	10934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015419	TTG	2	6	12370	12375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.