MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	ATTT	2	8	145	152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015418	GTTT	2	8	241	248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015418	GATT	2	8	337	344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015418	AAAT	2	8	398	405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015418	ACTC	2	8	492	499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015418	TAAA	2	8	814	821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015418	ATTA	2	8	856	863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015418	TGAG	2	8	1303	1310	25 %	25 %	50 %	0 %	331271089
9	NC_015418	ATCT	2	8	1786	1793	25 %	50 %	0 %	25 %	331271089
10	NC_015418	AAAT	2	8	2057	2064	75 %	25 %	0 %	0 %	331271089
11	NC_015418	TATT	2	8	2258	2265	25 %	75 %	0 %	0 %	331271089
12	NC_015418	GAAT	2	8	3213	3220	50 %	25 %	25 %	0 %	331271090
13	NC_015418	ATTA	2	8	3783	3790	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
14	NC_015418	GGAA	2	8	3834	3841	50 %	0 %	50 %	0 %	331271090
15	NC_015418	TGAA	2	8	4134	4141	50 %	25 %	25 %	0 %	331271090
16	NC_015418	AATT	2	8	4178	4185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015418	AAAG	2	8	4472	4479	75 %	0 %	25 %	0 %	331271091
18	NC_015418	TAAC	2	8	4690	4697	50 %	25 %	0 %	25 %	331271091
19	NC_015418	TAAA	2	8	4717	4724	75 %	25 %	0 %	0 %	331271091
20	NC_015418	TTTG	2	8	5054	5061	0 %	75 %	25 %	0 %	331271091
21	NC_015418	TAAA	2	8	5228	5235	75 %	25 %	0 %	0 %	331271091
22	NC_015418	TAAA	2	8	5327	5334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015418	ATTA	2	8	5411	5418	50 %	50 %	0 %	0 %	331271092
24	NC_015418	CATT	2	8	5688	5695	25 %	50 %	0 %	25 %	331271092
25	NC_015418	TTCT	2	8	6291	6298	0 %	75 %	0 %	25 %	331271092
26	NC_015418	TAAA	2	8	6390	6397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015418	AATT	2	8	6625	6632	50 %	50 %	0 %	0 %	331271093
28	NC_015418	AAAT	2	8	6903	6910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015418	AATA	2	8	7523	7530	75 %	25 %	0 %	0 %	331271095
30	NC_015418	AATA	2	8	7539	7546	75 %	25 %	0 %	0 %	331271095
31	NC_015418	AAAG	2	8	7613	7620	75 %	0 %	25 %	0 %	331271095
32	NC_015418	ATTT	2	8	7830	7837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015418	GAAA	2	8	8223	8230	75 %	0 %	25 %	0 %	331271096
34	NC_015418	ATGG	2	8	8766	8773	25 %	25 %	50 %	0 %	331271096
35	NC_015418	AAGT	2	8	8815	8822	50 %	25 %	25 %	0 %	331271096
36	NC_015418	AAGA	2	8	8883	8890	75 %	0 %	25 %	0 %	331271096
37	NC_015418	AATT	2	8	8908	8915	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
38	NC_015418	ATCT	2	8	9449	9456	25 %	50 %	0 %	25 %	331271097
39	NC_015418	GTTT	2	8	9581	9588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015418	GTTT	2	8	11268	11275	0 %	75 %	25 %	0 %	331271099
41	NC_015418	AAAT	2	8	11284	11291	75 %	25 %	0 %	0 %	331271099
42	NC_015418	TATT	2	8	11621	11628	25 %	75 %	0 %	0 %	331271099
43	NC_015418	AAGA	2	8	11855	11862	75 %	0 %	25 %	0 %	331271099
44	NC_015418	ATTC	2	8	12192	12199	25 %	50 %	0 %	25 %	331271099
45	NC_015418	AAGA	2	8	13095	13102	75 %	0 %	25 %	0 %	331271100
46	NC_015418	TAAA	2	8	13169	13176	75 %	25 %	0 %	0 %	331271100
47	NC_015418	TATT	2	8	13294	13301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015418	AATT	2	8	13351	13358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015418	GAAG	2	8	13865	13872	50 %	0 %	50 %	0 %	331271101
50	NC_015418	TCTT	2	8	14166	14173	0 %	75 %	0 %	25 %	331271101
51	NC_015418	TAAA	2	8	14306	14313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015418	AAAG	2	8	14666	14673	75 %	0 %	25 %	0 %	331271103
53	NC_015418	TTAA	2	8	15093	15100	50 %	50 %	0 %	0 %	331271103
54	NC_015418	ATGT	2	8	15366	15373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015418	AATT	2	8	15628	15635	50 %	50 %	0 %	0 %	331271104
56	NC_015418	ATTT	2	8	16176	16183	25 %	75 %	0 %	0 %	331271105
57	NC_015418	TAGT	2	8	16189	16196	25 %	50 %	25 %	0 %	331271105
58	NC_015418	TTTA	2	8	16364	16371	25 %	75 %	0 %	0 %	331271105
59	NC_015418	CTTA	2	8	16373	16380	25 %	50 %	0 %	25 %	331271105
60	NC_015418	GAAG	2	8	16803	16810	50 %	0 %	50 %	0 %	331271105
61	NC_015418	ATTA	2	8	16818	16825	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
62	NC_015418	GATG	2	8	17096	17103	25 %	25 %	50 %	0 %	331271106
63	NC_015418	TATT	2	8	18065	18072	25 %	75 %	0 %	0 %	331271107
64	NC_015418	TTTA	2	8	18681	18688	25 %	75 %	0 %	0 %	331271107
65	NC_015418	ATTT	2	8	18775	18782	25 %	75 %	0 %	0 %	331271107
66	NC_015418	AACT	2	8	19282	19289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015418	TAGC	2	8	19571	19578	25 %	25 %	25 %	25 %	331271109
68	NC_015418	TAAA	2	8	20377	20384	75 %	25 %	0 %	0 %	331271110
69	NC_015418	CACT	2	8	20489	20496	25 %	25 %	0 %	50 %	331271110
70	NC_015418	AGAA	2	8	20623	20630	75 %	0 %	25 %	0 %	331271110
71	NC_015418	ATCT	2	8	20677	20684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015418	ATTT	2	8	20772	20779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015418	GTCA	2	8	20945	20952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015418	TTAA	2	8	20979	20986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015418	ACTA	2	8	21034	21041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015418	TTAT	2	8	21430	21437	25 %	75 %	0 %	0 %	331271111
77	NC_015418	TACT	2	8	21475	21482	25 %	50 %	0 %	25 %	331271111
78	NC_015418	TTTC	2	8	22306	22313	0 %	75 %	0 %	25 %	331271112
79	NC_015418	TTTC	2	8	22786	22793	0 %	75 %	0 %	25 %	331271112
80	NC_015418	TTTA	2	8	23144	23151	25 %	75 %	0 %	0 %	331271112
81	NC_015418	CTAT	2	8	23384	23391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015418	TAAA	2	8	24065	24072	75 %	25 %	0 %	0 %	331271113
83	NC_015418	TTTC	2	8	24251	24258	0 %	75 %	0 %	25 %	331271113
84	NC_015418	TTAT	2	8	24270	24277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015418	AAAG	2	8	24478	24485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015418	GAAA	2	8	24843	24850	75 %	0 %	25 %	0 %	331271114
87	NC_015418	AAAT	2	8	25004	25011	75 %	25 %	0 %	0 %	331271114
88	NC_015418	ATTT	2	8	25034	25041	25 %	75 %	0 %	0 %	331271114
89	NC_015418	TTTA	2	8	25171	25178	25 %	75 %	0 %	0 %	331271115
90	NC_015418	TTTA	2	8	25446	25453	25 %	75 %	0 %	0 %	331271115
91	NC_015418	TTTA	2	8	25542	25549	25 %	75 %	0 %	0 %	331271115
92	NC_015418	CTTT	2	8	25684	25691	0 %	75 %	0 %	25 %	331271115
93	NC_015418	TACT	2	8	25850	25857	25 %	50 %	0 %	25 %	331271115
94	NC_015418	TCAC	2	8	26219	26226	25 %	25 %	0 %	50 %	331271116
95	NC_015418	TTAC	2	8	26615	26622	25 %	50 %	0 %	25 %	331271116
96	NC_015418	ATTT	2	8	26707	26714	25 %	75 %	0 %	0 %	331271116
97	NC_015418	ATTT	2	8	26981	26988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015418	TCTT	2	8	27730	27737	0 %	75 %	0 %	25 %	331271118
99	NC_015418	CATT	2	8	28365	28372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015418	TAAA	2	8	28665	28672	75 %	25 %	0 %	0 %	331271119
101	NC_015418	ATTT	2	8	29010	29017	25 %	75 %	0 %	0 %	331271119
102	NC_015418	TCAA	2	8	29948	29955	50 %	25 %	0 %	25 %	331271120
103	NC_015418	AAAC	2	8	31146	31153	75 %	0 %	0 %	25 %	331271121
104	NC_015418	TACT	2	8	31326	31333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015418	CTTT	2	8	31443	31450	0 %	75 %	0 %	25 %	331271122
106	NC_015418	ATTT	2	8	31491	31498	25 %	75 %	0 %	0 %	331271122
107	NC_015418	AACT	2	8	31861	31868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015418	AATT	2	8	32267	32274	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
109	NC_015418	TAGA	2	8	32296	32303	50 %	25 %	25 %	0 %	331271123
110	NC_015418	GAAG	2	8	32571	32578	50 %	0 %	50 %	0 %	331271123
111	NC_015418	TTTA	2	8	33066	33073	25 %	75 %	0 %	0 %	331271123
112	NC_015418	AATA	2	8	33238	33245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015418	TAAA	2	8	33291	33298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015418	CAAT	2	8	34790	34797	50 %	25 %	0 %	25 %	331271124
115	NC_015418	AATA	2	8	35279	35286	75 %	25 %	0 %	0 %	331271124
116	NC_015418	AGTA	2	8	36448	36455	50 %	25 %	25 %	0 %	331271125
117	NC_015418	ATGT	2	8	36804	36811	25 %	50 %	25 %	0 %	331271125
118	NC_015418	CTTA	2	8	37129	37136	25 %	50 %	0 %	25 %	331271125
119	NC_015418	ATTT	2	8	37380	37387	25 %	75 %	0 %	0 %	331271126
120	NC_015418	TAAA	2	8	37611	37618	75 %	25 %	0 %	0 %	331271126
121	NC_015418	AGAA	2	8	37801	37808	75 %	0 %	25 %	0 %	331271126
122	NC_015418	TATG	2	8	37963	37970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015418	TCTT	2	8	37989	37996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015418	TTCC	2	8	38328	38335	0 %	50 %	0 %	50 %	331271127
125	NC_015418	ACTA	2	8	38791	38798	50 %	25 %	0 %	25 %	331271127
126	NC_015418	TTTA	2	8	38875	38882	25 %	75 %	0 %	0 %	331271127
127	NC_015418	TACA	2	8	38904	38911	50 %	25 %	0 %	25 %	331271127
128	NC_015418	TAAA	2	8	39228	39235	75 %	25 %	0 %	0 %	331271128
129	NC_015418	ATGT	2	8	39313	39320	25 %	50 %	25 %	0 %	331271128
130	NC_015418	ATGT	2	8	39783	39790	25 %	50 %	25 %	0 %	331271129
131	NC_015418	TAAA	2	8	40189	40196	75 %	25 %	0 %	0 %	331271129
132	NC_015418	TAAT	2	8	40402	40409	50 %	50 %	0 %	0 %	331271130
133	NC_015418	AAAT	2	8	40454	40461	75 %	25 %	0 %	0 %	331271130
134	NC_015418	ATCA	2	8	40495	40502	50 %	25 %	0 %	25 %	331271130
135	NC_015418	AAAT	2	8	40774	40781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015418	TTTA	2	8	40796	40803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015418	AGGT	2	8	41672	41679	25 %	25 %	50 %	0 %	331271131
138	NC_015418	GTAT	2	8	41754	41761	25 %	50 %	25 %	0 %	331271131
139	NC_015418	AGTA	2	8	41830	41837	50 %	25 %	25 %	0 %	331271131
140	NC_015418	GAAT	2	8	41846	41853	50 %	25 %	25 %	0 %	331271131
141	NC_015418	TAAA	2	8	41931	41938	75 %	25 %	0 %	0 %	331271131
142	NC_015418	CATT	2	8	42327	42334	25 %	50 %	0 %	25 %	331271132
143	NC_015418	ACAT	2	8	42346	42353	50 %	25 %	0 %	25 %	331271132
144	NC_015418	ATAC	2	8	42672	42679	50 %	25 %	0 %	25 %	331271133
145	NC_015418	TACA	2	8	43369	43376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015418	TTAA	2	8	43626	43633	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.