MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	TGAG	2	8	1303	1310	25 %	25 %	50 %	0 %	331271089
2	NC_015418	ATCT	2	8	1786	1793	25 %	50 %	0 %	25 %	331271089
3	NC_015418	AAAT	2	8	2057	2064	75 %	25 %	0 %	0 %	331271089
4	NC_015418	TATT	2	8	2258	2265	25 %	75 %	0 %	0 %	331271089
5	NC_015418	GAAT	2	8	3213	3220	50 %	25 %	25 %	0 %	331271090
6	NC_015418	ATTA	2	8	3783	3790	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
7	NC_015418	GGAA	2	8	3834	3841	50 %	0 %	50 %	0 %	331271090
8	NC_015418	TGAA	2	8	4134	4141	50 %	25 %	25 %	0 %	331271090
9	NC_015418	AAAG	2	8	4472	4479	75 %	0 %	25 %	0 %	331271091
10	NC_015418	TAAC	2	8	4690	4697	50 %	25 %	0 %	25 %	331271091
11	NC_015418	TAAA	2	8	4717	4724	75 %	25 %	0 %	0 %	331271091
12	NC_015418	TTTG	2	8	5054	5061	0 %	75 %	25 %	0 %	331271091
13	NC_015418	TAAA	2	8	5228	5235	75 %	25 %	0 %	0 %	331271091
14	NC_015418	ATTA	2	8	5411	5418	50 %	50 %	0 %	0 %	331271092
15	NC_015418	CATT	2	8	5688	5695	25 %	50 %	0 %	25 %	331271092
16	NC_015418	TTCT	2	8	6291	6298	0 %	75 %	0 %	25 %	331271092
17	NC_015418	AATT	2	8	6625	6632	50 %	50 %	0 %	0 %	331271093
18	NC_015418	AATA	2	8	7523	7530	75 %	25 %	0 %	0 %	331271095
19	NC_015418	AATA	2	8	7539	7546	75 %	25 %	0 %	0 %	331271095
20	NC_015418	AAAG	2	8	7613	7620	75 %	0 %	25 %	0 %	331271095
21	NC_015418	GAAA	2	8	8223	8230	75 %	0 %	25 %	0 %	331271096
22	NC_015418	ATGG	2	8	8766	8773	25 %	25 %	50 %	0 %	331271096
23	NC_015418	AAGT	2	8	8815	8822	50 %	25 %	25 %	0 %	331271096
24	NC_015418	AAGA	2	8	8883	8890	75 %	0 %	25 %	0 %	331271096
25	NC_015418	AATT	2	8	8908	8915	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
26	NC_015418	ATCT	2	8	9449	9456	25 %	50 %	0 %	25 %	331271097
27	NC_015418	GTTT	2	8	11268	11275	0 %	75 %	25 %	0 %	331271099
28	NC_015418	AAAT	2	8	11284	11291	75 %	25 %	0 %	0 %	331271099
29	NC_015418	TATT	2	8	11621	11628	25 %	75 %	0 %	0 %	331271099
30	NC_015418	AAGA	2	8	11855	11862	75 %	0 %	25 %	0 %	331271099
31	NC_015418	ATTC	2	8	12192	12199	25 %	50 %	0 %	25 %	331271099
32	NC_015418	AAGA	2	8	13095	13102	75 %	0 %	25 %	0 %	331271100
33	NC_015418	TAAA	2	8	13169	13176	75 %	25 %	0 %	0 %	331271100
34	NC_015418	GAAG	2	8	13865	13872	50 %	0 %	50 %	0 %	331271101
35	NC_015418	TCTT	2	8	14166	14173	0 %	75 %	0 %	25 %	331271101
36	NC_015418	AAAG	2	8	14666	14673	75 %	0 %	25 %	0 %	331271103
37	NC_015418	TTAA	2	8	15093	15100	50 %	50 %	0 %	0 %	331271103
38	NC_015418	AATT	2	8	15628	15635	50 %	50 %	0 %	0 %	331271104
39	NC_015418	ATTT	2	8	16176	16183	25 %	75 %	0 %	0 %	331271105
40	NC_015418	TAGT	2	8	16189	16196	25 %	50 %	25 %	0 %	331271105
41	NC_015418	TTTA	2	8	16364	16371	25 %	75 %	0 %	0 %	331271105
42	NC_015418	CTTA	2	8	16373	16380	25 %	50 %	0 %	25 %	331271105
43	NC_015418	GAAG	2	8	16803	16810	50 %	0 %	50 %	0 %	331271105
44	NC_015418	ATTA	2	8	16818	16825	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
45	NC_015418	GATG	2	8	17096	17103	25 %	25 %	50 %	0 %	331271106
46	NC_015418	TATT	2	8	18065	18072	25 %	75 %	0 %	0 %	331271107
47	NC_015418	TTTA	2	8	18681	18688	25 %	75 %	0 %	0 %	331271107
48	NC_015418	ATTT	2	8	18775	18782	25 %	75 %	0 %	0 %	331271107
49	NC_015418	TAGC	2	8	19571	19578	25 %	25 %	25 %	25 %	331271109
50	NC_015418	TAAA	2	8	20377	20384	75 %	25 %	0 %	0 %	331271110
51	NC_015418	CACT	2	8	20489	20496	25 %	25 %	0 %	50 %	331271110
52	NC_015418	AGAA	2	8	20623	20630	75 %	0 %	25 %	0 %	331271110
53	NC_015418	TTAT	2	8	21430	21437	25 %	75 %	0 %	0 %	331271111
54	NC_015418	TACT	2	8	21475	21482	25 %	50 %	0 %	25 %	331271111
55	NC_015418	TTTC	2	8	22306	22313	0 %	75 %	0 %	25 %	331271112
56	NC_015418	TTTC	2	8	22786	22793	0 %	75 %	0 %	25 %	331271112
57	NC_015418	TTTA	2	8	23144	23151	25 %	75 %	0 %	0 %	331271112
58	NC_015418	TAAA	2	8	24065	24072	75 %	25 %	0 %	0 %	331271113
59	NC_015418	TTTC	2	8	24251	24258	0 %	75 %	0 %	25 %	331271113
60	NC_015418	GAAA	2	8	24843	24850	75 %	0 %	25 %	0 %	331271114
61	NC_015418	AAAT	2	8	25004	25011	75 %	25 %	0 %	0 %	331271114
62	NC_015418	ATTT	2	8	25034	25041	25 %	75 %	0 %	0 %	331271114
63	NC_015418	TTTA	2	8	25171	25178	25 %	75 %	0 %	0 %	331271115
64	NC_015418	TTTA	2	8	25446	25453	25 %	75 %	0 %	0 %	331271115
65	NC_015418	TTTA	2	8	25542	25549	25 %	75 %	0 %	0 %	331271115
66	NC_015418	CTTT	2	8	25684	25691	0 %	75 %	0 %	25 %	331271115
67	NC_015418	TACT	2	8	25850	25857	25 %	50 %	0 %	25 %	331271115
68	NC_015418	TCAC	2	8	26219	26226	25 %	25 %	0 %	50 %	331271116
69	NC_015418	TTAC	2	8	26615	26622	25 %	50 %	0 %	25 %	331271116
70	NC_015418	ATTT	2	8	26707	26714	25 %	75 %	0 %	0 %	331271116
71	NC_015418	TCTT	2	8	27730	27737	0 %	75 %	0 %	25 %	331271118
72	NC_015418	TAAA	2	8	28665	28672	75 %	25 %	0 %	0 %	331271119
73	NC_015418	ATTT	2	8	29010	29017	25 %	75 %	0 %	0 %	331271119
74	NC_015418	TCAA	2	8	29948	29955	50 %	25 %	0 %	25 %	331271120
75	NC_015418	AAAC	2	8	31146	31153	75 %	0 %	0 %	25 %	331271121
76	NC_015418	CTTT	2	8	31443	31450	0 %	75 %	0 %	25 %	331271122
77	NC_015418	ATTT	2	8	31491	31498	25 %	75 %	0 %	0 %	331271122
78	NC_015418	AATT	2	8	32267	32274	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
79	NC_015418	TAGA	2	8	32296	32303	50 %	25 %	25 %	0 %	331271123
80	NC_015418	GAAG	2	8	32571	32578	50 %	0 %	50 %	0 %	331271123
81	NC_015418	TTTA	2	8	33066	33073	25 %	75 %	0 %	0 %	331271123
82	NC_015418	CAAT	2	8	34790	34797	50 %	25 %	0 %	25 %	331271124
83	NC_015418	AATA	2	8	35279	35286	75 %	25 %	0 %	0 %	331271124
84	NC_015418	AGTA	2	8	36448	36455	50 %	25 %	25 %	0 %	331271125
85	NC_015418	ATGT	2	8	36804	36811	25 %	50 %	25 %	0 %	331271125
86	NC_015418	CTTA	2	8	37129	37136	25 %	50 %	0 %	25 %	331271125
87	NC_015418	ATTT	2	8	37380	37387	25 %	75 %	0 %	0 %	331271126
88	NC_015418	TAAA	2	8	37611	37618	75 %	25 %	0 %	0 %	331271126
89	NC_015418	AGAA	2	8	37801	37808	75 %	0 %	25 %	0 %	331271126
90	NC_015418	TTCC	2	8	38328	38335	0 %	50 %	0 %	50 %	331271127
91	NC_015418	ACTA	2	8	38791	38798	50 %	25 %	0 %	25 %	331271127
92	NC_015418	TTTA	2	8	38875	38882	25 %	75 %	0 %	0 %	331271127
93	NC_015418	TACA	2	8	38904	38911	50 %	25 %	0 %	25 %	331271127
94	NC_015418	TAAA	2	8	39228	39235	75 %	25 %	0 %	0 %	331271128
95	NC_015418	ATGT	2	8	39313	39320	25 %	50 %	25 %	0 %	331271128
96	NC_015418	ATGT	2	8	39783	39790	25 %	50 %	25 %	0 %	331271129
97	NC_015418	TAAA	2	8	40189	40196	75 %	25 %	0 %	0 %	331271129
98	NC_015418	TAAT	2	8	40402	40409	50 %	50 %	0 %	0 %	331271130
99	NC_015418	AAAT	2	8	40454	40461	75 %	25 %	0 %	0 %	331271130
100	NC_015418	ATCA	2	8	40495	40502	50 %	25 %	0 %	25 %	331271130
101	NC_015418	AGGT	2	8	41672	41679	25 %	25 %	50 %	0 %	331271131
102	NC_015418	GTAT	2	8	41754	41761	25 %	50 %	25 %	0 %	331271131
103	NC_015418	AGTA	2	8	41830	41837	50 %	25 %	25 %	0 %	331271131
104	NC_015418	GAAT	2	8	41846	41853	50 %	25 %	25 %	0 %	331271131
105	NC_015418	TAAA	2	8	41931	41938	75 %	25 %	0 %	0 %	331271131
106	NC_015418	CATT	2	8	42327	42334	25 %	50 %	0 %	25 %	331271132
107	NC_015418	ACAT	2	8	42346	42353	50 %	25 %	0 %	25 %	331271132
108	NC_015418	ATAC	2	8	42672	42679	50 %	25 %	0 %	25 %	331271133
109	NC_015418	TTAA	2	8	43626	43633	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
110	NC_015418	CTTT	2	8	44727	44734	0 %	75 %	0 %	25 %	331271135
111	NC_015418	CTAT	2	8	45285	45292	25 %	50 %	0 %	25 %	331271135
112	NC_015418	TAGC	2	8	45561	45568	25 %	25 %	25 %	25 %	331271136
113	NC_015418	ATTC	2	8	46001	46008	25 %	50 %	0 %	25 %	331271136
114	NC_015418	ATTT	2	8	49033	49040	25 %	75 %	0 %	0 %	331271137
115	NC_015418	ATTA	2	8	49148	49155	50 %	50 %	0 %	0 %	331271137
116	NC_015418	ATTA	2	8	50023	50030	50 %	50 %	0 %	0 %	331271138
117	NC_015418	TTAG	2	8	50333	50340	25 %	50 %	25 %	0 %	331271138
118	NC_015418	TTTA	2	8	50401	50408	25 %	75 %	0 %	0 %	331271138
119	NC_015418	AGTT	2	8	50646	50653	25 %	50 %	25 %	0 %	331271138
120	NC_015418	ATTG	2	8	50675	50682	25 %	50 %	25 %	0 %	331271138
121	NC_015418	TATT	2	8	51195	51202	25 %	75 %	0 %	0 %	331271139
122	NC_015418	TCAT	2	8	53437	53444	25 %	50 %	0 %	25 %	331271140
123	NC_015418	TAAT	2	8	54841	54848	50 %	50 %	0 %	0 %	331271142
124	NC_015418	AGAA	2	8	54991	54998	75 %	0 %	25 %	0 %	331271142
125	NC_015418	TTTA	2	8	56409	56416	25 %	75 %	0 %	0 %	331271143
126	NC_015418	TAAC	2	8	57705	57712	50 %	25 %	0 %	25 %	331271145
127	NC_015418	AAAC	2	8	58431	58438	75 %	0 %	0 %	25 %	331271146
128	NC_015418	TAAT	2	8	58484	58491	50 %	50 %	0 %	0 %	331271146
129	NC_015418	AAAT	2	8	59456	59463	75 %	25 %	0 %	0 %	331271147
130	NC_015418	ATGA	2	8	59635	59642	50 %	25 %	25 %	0 %	331271148
131	NC_015418	AAAT	2	8	59697	59704	75 %	25 %	0 %	0 %	331271148
132	NC_015418	AAAT	2	8	59868	59875	75 %	25 %	0 %	0 %	331271148
133	NC_015418	TAAA	2	8	59879	59886	75 %	25 %	0 %	0 %	331271148
134	NC_015418	GGTA	2	8	60791	60798	25 %	25 %	50 %	0 %	331271149
135	NC_015418	AACT	2	8	60808	60815	50 %	25 %	0 %	25 %	331271149
136	NC_015418	ATTT	2	8	61298	61305	25 %	75 %	0 %	0 %	331271150
137	NC_015418	CTTA	2	8	62306	62313	25 %	50 %	0 %	25 %	331271152
138	NC_015418	TAAT	2	8	62825	62832	50 %	50 %	0 %	0 %	331271153
139	NC_015418	AATG	2	8	62833	62840	50 %	25 %	25 %	0 %	331271153
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.