MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	ATA	2	6	76	81	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015418	GTA	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015418	CTA	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015418	TAA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015418	GAT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015418	TAA	3	9	325	333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015418	ATA	3	9	426	434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015418	ATT	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015418	ATT	2	6	462	467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015418	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015418	TAA	2	6	480	485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015418	ATT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015418	ATT	2	6	572	577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015418	TAT	3	9	669	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015418	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015418	TAA	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015418	TAG	2	6	936	941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015418	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015418	GTA	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015418	TAC	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015418	TAC	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015418	AGT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015418	AGA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015418	TAA	2	6	5286	5291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015418	ATT	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015418	ATT	2	6	6372	6377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015418	TCC	2	6	7309	7314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015418	TTG	2	6	7331	7336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015418	ATA	2	6	7401	7406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015418	ATA	2	6	7810	7815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015418	TAA	2	6	7856	7861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015418	ATA	2	6	7878	7883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015418	AAT	2	6	8020	8025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015418	AGG	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015418	ATT	2	6	9362	9367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015418	TGT	2	6	9649	9654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015418	ATT	2	6	9662	9667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015418	TAA	2	6	9681	9686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015418	TAT	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015418	TAT	2	6	9729	9734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015418	GAA	2	6	9796	9801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015418	TTC	2	6	9814	9819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015418	CCT	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015418	TAT	2	6	10767	10772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015418	AAT	2	6	10773	10778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015418	AAT	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015418	TTA	2	6	10854	10859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015418	ATA	2	6	10877	10882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015418	ATT	2	6	10945	10950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015418	ATT	2	6	10976	10981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015418	AAT	2	6	12301	12306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015418	TGC	2	6	13215	13220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015418	TAT	2	6	13271	13276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015418	TAA	2	6	13277	13282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015418	TAA	2	6	13315	13320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015418	TAA	2	6	13373	13378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015418	AGG	2	6	13447	13452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015418	AAT	2	6	14211	14216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015418	TAT	2	6	14217	14222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015418	ATA	2	6	14248	14253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015418	ATC	2	6	14509	14514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015418	TAA	2	6	14576	14581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015418	GCT	2	6	15433	15438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015418	ACA	2	6	16920	16925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015418	ATG	2	6	19081	19086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015418	AAT	2	6	19162	19167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015418	ATA	2	6	19208	19213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015418	ATT	2	6	19315	19320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015418	TAA	2	6	19327	19332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015418	ATT	2	6	19379	19384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015418	CCT	2	6	19817	19822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015418	ATT	3	9	19823	19831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015418	TTA	2	6	19872	19877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015418	TAT	2	6	19914	19919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015418	ATT	2	6	20724	20729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015418	TTA	2	6	20825	20830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015418	ATA	2	6	20875	20880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015418	ATT	2	6	20909	20914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015418	ACT	2	6	20955	20960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015418	CTT	2	6	21007	21012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015418	TTA	2	6	21153	21158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015418	ATA	2	6	21170	21175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015418	TTA	2	6	23262	23267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015418	TAT	2	6	23285	23290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015418	GAT	2	6	23317	23322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015418	ATA	2	6	23340	23345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015418	TTC	2	6	23535	23540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015418	GTA	2	6	24359	24364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015418	AAC	2	6	24410	24415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015418	GTT	2	6	24429	24434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015418	ACT	2	6	25117	25122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015418	TAG	2	6	25144	25149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015418	TTA	2	6	25160	25165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015418	CTA	2	6	26890	26895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015418	ATA	2	6	26970	26975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015418	TTA	2	6	27085	27090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015418	TAT	2	6	27112	27117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015418	AGT	2	6	27158	27163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015418	ATT	2	6	27178	27183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015418	TGT	2	6	27564	27569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015418	TAT	2	6	27575	27580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015418	TAT	2	6	27585	27590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015418	ATT	2	6	27604	27609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015418	TAT	2	6	28149	28154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015418	AAT	2	6	28267	28272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015418	ATG	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015418	TTG	3	9	28430	28438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015418	ACA	2	6	28442	28447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015418	ATT	3	9	29448	29456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015418	ATA	2	6	29539	29544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015418	ATT	2	6	29563	29568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015418	AAT	2	6	29617	29622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015418	TAT	2	6	29629	29634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015418	AAT	2	6	29722	29727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015418	ATG	2	6	29789	29794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015418	TTG	2	6	31220	31225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015418	TTA	2	6	31238	31243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015418	TAT	2	6	31372	31377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015418	TTA	2	6	31710	31715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015418	TTA	2	6	31723	31728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015418	GTA	2	6	33305	33310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015418	TGA	2	6	33419	33424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015418	AAT	2	6	33443	33448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015418	TTA	2	6	35748	35753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015418	ATT	2	6	35802	35807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015418	ATG	2	6	39005	39010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015418	TAA	2	6	39097	39102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015418	ATA	2	6	39103	39108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015418	TAA	2	6	39179	39184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015418	ATT	2	6	39545	39550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015418	TCT	2	6	39677	39682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015418	TAC	2	6	39703	39708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015418	TTA	2	6	40730	40735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015418	TTC	2	6	40784	40789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015418	TAC	2	6	40892	40897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015418	TAA	2	6	40929	40934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015418	ATA	2	6	40963	40968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015418	CTT	2	6	41942	41947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015418	AAG	2	6	41964	41969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015418	AAC	2	6	42513	42518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015418	ACA	2	6	43090	43095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015418	TAT	2	6	43133	43138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015418	ATT	2	6	43205	43210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_015418	TAA	2	6	77795	77800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_015418	ATA	2	6	78271	78276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015418	TAA	2	6	78314	78319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015418	AAT	2	6	78352	78357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015418	ATT	2	6	78382	78387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015418	TAA	2	6	78449	78454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015418	ACA	2	6	78498	78503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_015418	ATA	2	6	78518	78523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015418	TTA	2	6	78974	78979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015418	TTA	2	6	79038	79043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015418	TAT	3	9	79082	79090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015418	TGT	2	6	79136	79141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.