MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015417	TAAAAA	2	12	889	900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331270866
2	NC_015417	ATTAAT	2	12	1051	1062	50 %	50 %	0 %	0 %	331270867
3	NC_015417	CTAAAA	2	12	1083	1094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270867
4	NC_015417	AGAACA	2	12	4888	4899	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270871
5	NC_015417	AGAATT	2	12	7613	7624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270872
6	NC_015417	TATGTA	2	12	7949	7960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270874
7	NC_015417	TGAAAG	2	12	9672	9683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270875
8	NC_015417	AAGAAA	2	12	10669	10680	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331270875
9	NC_015417	TGAATA	2	12	10978	10989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270876
10	NC_015417	ATGTAT	2	12	11570	11581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270876
11	NC_015417	TTCTAT	2	12	12664	12675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270878
12	NC_015417	AATAGT	2	12	18256	18267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270883
13	NC_015417	ATTAAA	2	12	20187	20198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270886
14	NC_015417	AAGTAA	2	12	21318	21329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331270886
15	NC_015417	TAAAAA	2	12	21815	21826	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331270887
16	NC_015417	AGAACA	2	12	23335	23346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270889
17	NC_015417	TATTGA	2	12	24596	24607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270890
18	NC_015417	TATGAT	2	12	24759	24770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270890
19	NC_015417	TATAGA	2	12	28300	28311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270892
20	NC_015417	TAGATA	2	12	29769	29780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270892
21	NC_015417	AAATCA	2	12	31231	31242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270894
22	NC_015417	AAATTA	2	12	31490	31501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270894
23	NC_015417	ATAAAT	2	12	36026	36037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270897
24	NC_015417	TTAAAT	2	12	41177	41188	50 %	50 %	0 %	0 %	331270904
25	NC_015417	AAATCA	2	12	42386	42397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270905
26	NC_015417	TTTAAT	2	12	45717	45728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270911
27	NC_015417	TGATTT	2	12	46534	46545	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331270912
28	NC_015417	TGTGCA	2	12	47637	47648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331270913
29	NC_015417	CATTTT	2	12	48285	48296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270914
30	NC_015417	TATGAA	2	12	51627	51638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270920
31	NC_015417	ATTGTG	2	12	52861	52872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331270922
32	NC_015417	TGTAGA	2	12	54155	54166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270924
33	NC_015417	AGGTAA	2	12	55811	55822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331270925
34	NC_015417	CCAAAG	2	12	56158	56169	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331270925
35	NC_015417	AACAAG	2	12	61541	61552	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270933
36	NC_015417	ATTAAA	2	12	62096	62107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270934
37	NC_015417	AAAGCA	2	12	64704	64715	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270936
38	NC_015417	ATACAA	2	12	64802	64813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331270936
39	NC_015417	TGTAAA	2	12	67945	67956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270939
40	NC_015417	ATGTAA	2	12	68679	68690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331270939
41	NC_015417	TGAAAA	2	12	71567	71578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331270940
42	NC_015417	AAGATA	2	12	71674	71685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331270940
43	NC_015417	ATTTTA	2	12	74105	74116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270942
44	NC_015417	AGAAAA	2	12	77271	77282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	331270946
45	NC_015417	CAGAAA	2	12	77916	77927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	331270947
46	NC_015417	TTAATA	2	12	78702	78713	50 %	50 %	0 %	0 %	331270949
47	NC_015417	AAAATT	2	12	81129	81140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270950
48	NC_015417	ATTTTT	2	12	84742	84753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270956
49	NC_015417	GGTTTT	2	12	86043	86054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331270956
50	NC_015417	TATTTG	2	12	87278	87289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331270958
51	NC_015417	CATTTG	2	12	87524	87535	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331270958
52	NC_015417	TTAAAT	2	12	91081	91092	50 %	50 %	0 %	0 %	331270959
53	NC_015417	TTTTGA	2	12	91792	91803	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331270960
54	NC_015417	TTTTAC	2	12	93097	93108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270960
55	NC_015417	TACTTG	2	12	94776	94787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331270960
56	NC_015417	CTATTA	2	12	94827	94838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270960
57	NC_015417	GGTATA	2	12	95027	95038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331270960
58	NC_015417	AATAAA	2	12	96270	96281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331270961
59	NC_015417	CTTTGG	2	12	101798	101809	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331270969
60	NC_015417	TTTACC	2	12	102144	102155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331270969
61	NC_015417	GGTTTA	2	12	104030	104041	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331270971
62	NC_015417	AAAGGA	2	12	104477	104488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331270971
63	NC_015417	AATTAA	2	12	106576	106587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270971
64	NC_015417	ACAATT	2	12	106891	106902	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331270971
65	NC_015417	AAACAA	2	12	106963	106974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	331270971
66	NC_015417	TTCTCT	2	12	109450	109461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331270975
67	NC_015417	CTTCCT	2	12	110386	110397	0 %	50 %	0 %	50 %	331270977
68	NC_015417	TCTTCA	2	12	110581	110592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331270977
69	NC_015417	TTTATT	2	12	110814	110825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270977
70	NC_015417	AATCAT	2	12	112858	112869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331270980
71	NC_015417	TTTATA	2	12	114996	115007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331270981
72	NC_015417	ATTGTA	2	12	116360	116371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270982
73	NC_015417	TTATAA	2	12	117600	117611	50 %	50 %	0 %	0 %	331270985
74	NC_015417	ATAGTT	2	12	119467	119478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331270986
75	NC_015417	AAAATT	2	12	119670	119681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331270986
76	NC_015417	TTTATT	2	12	119799	119810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270986
77	NC_015417	CAATAT	2	12	119831	119842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331270986
78	NC_015417	TCTTTA	2	12	120213	120224	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331270987
79	NC_015417	GGATTG	2	12	122164	122175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	331270989
80	NC_015417	TATCAT	2	12	124484	124495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331270994
81	NC_015417	TTTTTA	2	12	125293	125304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270994
82	NC_015417	ATTTTT	2	12	126596	126607	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331270997
83	NC_015417	TAAATC	2	12	128746	128757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331271001
84	NC_015417	TTGTTT	2	12	129071	129082	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	331271001
85	NC_015417	GTATTA	2	12	129619	129630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331271003
86	NC_015417	TTAATA	2	12	130696	130707	50 %	50 %	0 %	0 %	331271005
87	NC_015417	TTTTTA	2	12	133703	133714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331271009
88	NC_015417	TTCTTT	2	12	139561	139572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	331271014
89	NC_015417	ATCTAT	2	12	139648	139659	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331271014
90	NC_015417	TTATCT	2	12	140948	140959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271014
91	NC_015417	ACATCC	2	12	141086	141097	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	331271015
92	NC_015417	TTCATC	2	12	144184	144195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331271021
93	NC_015417	TTTGCT	2	12	147436	147447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	331271024
94	NC_015417	TAGATT	2	12	149590	149601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331271024
95	NC_015417	TTTTAA	2	12	149951	149962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331271024
96	NC_015417	CACTTG	2	12	150013	150024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	331271024
97	NC_015417	CTAATT	2	12	152982	152993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331271027
98	NC_015417	TTTACT	2	12	153473	153484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271027
99	NC_015417	CATCTT	2	12	158137	158148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331271035
100	NC_015417	TCAACT	2	12	165654	165665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331271045
101	NC_015417	TGCTAC	2	12	165857	165868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	331271045
102	NC_015417	AGTACA	2	12	166117	166128	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331271046
103	NC_015417	TTATCT	2	12	166928	166939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271046
104	NC_015417	TTCTAT	2	12	170937	170948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271051
105	NC_015417	AGAATC	2	12	171783	171794	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331271053
106	NC_015417	TTAATT	2	12	171875	171886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331271053
107	NC_015417	TATCAT	2	12	172412	172423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331271053
108	NC_015417	CTTCAT	2	12	172622	172633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331271053
109	NC_015417	TACGTT	2	12	175002	175013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331271055
110	NC_015417	ATTCAT	2	12	175621	175632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331271056
111	NC_015417	TTTGCT	2	12	175941	175952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	331271056
112	NC_015417	TTTTCA	2	12	178303	178314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271059
113	NC_015417	TCTTCA	2	12	178807	178818	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331271059
114	NC_015417	TTATAT	2	12	189538	189549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331271070
115	NC_015417	ATATGT	2	12	190153	190164	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	331271071
116	NC_015417	TCTTTT	2	12	190991	191002	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	331271072
117	NC_015417	CTATTT	2	12	192227	192238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271073
118	NC_015417	AATAAA	2	12	197525	197536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331271080
119	NC_015417	ATTTAT	2	12	198180	198191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331271080
120	NC_015417	TCTAAA	2	12	198872	198883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331271080
121	NC_015417	AAAATG	2	12	199332	199343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331271080
122	NC_015417	ATTAAG	2	12	200745	200756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331271082
123	NC_015417	TCAATA	2	12	202777	202788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	331271086

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.