MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015417	GTATT	2	10	294	303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015417	TATAA	2	10	1938	1947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015417	TAAAT	2	10	8386	8395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015417	GATAA	2	10	8398	8407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015417	ATTAA	2	10	8445	8454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015417	TAAAA	2	10	8662	8671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015417	AAAAT	2	10	16454	16463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015417	AAATA	2	10	16566	16575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015417	ACAAT	2	10	17051	17060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015417	TCTTT	2	10	17839	17848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015417	TTTTG	2	10	18083	18092	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015417	GAAAT	2	10	18504	18513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015417	AATAC	2	10	24927	24936	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015417	TAACC	2	10	32709	32718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015417	AACGA	2	10	33825	33834	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015417	AATAT	2	10	33911	33920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015417	TTGGA	2	10	33967	33976	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015417	TGAAG	2	10	34005	34014	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015417	AGAAA	2	10	34147	34156	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015417	TAAAT	2	10	37246	37255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015417	AAATT	3	15	39284	39298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015417	ATAAA	3	15	40474	40488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015417	TAAAA	2	10	40908	40917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015417	AGTTA	2	10	41344	41353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015417	AATTA	2	10	43203	43212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015417	AATAA	2	10	46340	46349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015417	TAAAT	2	10	50059	50068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015417	ATTAT	2	10	51595	51604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015417	TTAGT	2	10	52153	52162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015417	AAACC	2	10	53094	53103	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015417	TACGT	2	10	53168	53177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015417	ATATA	2	10	58872	58881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015417	ATATT	2	10	58954	58963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015417	AACAA	2	10	59343	59352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015417	ATATA	2	10	74186	74195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015417	ATTAA	2	10	78620	78629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015417	TAAAT	2	10	78632	78641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015417	ATTAA	2	10	82038	82047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015417	ATTAA	2	10	82797	82806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015417	ACTTT	2	10	83537	83546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015417	TATAT	2	10	84257	84266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015417	TGGTG	2	10	95636	95645	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015417	TAAAA	2	10	96396	96405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015417	ATATA	2	10	97856	97865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015417	TCAAT	2	10	98253	98262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015417	AATAT	2	10	100348	100357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015417	ATTTA	2	10	108787	108796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015417	ATTAT	2	10	112626	112635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015417	GTTTT	2	10	120514	120523	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015417	TAAAC	2	10	125913	125922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015417	TAAAA	2	10	126262	126271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015417	TATAA	2	10	131842	131851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015417	TGTAA	2	10	132628	132637	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015417	AAATA	2	10	136124	136133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015417	ATTGT	2	10	153554	153563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015417	TATTT	2	10	157741	157750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015417	CTAAA	2	10	158507	158516	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015417	ATTTT	2	10	158751	158760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015417	TATAA	2	10	161084	161093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015417	TACTC	2	10	174355	174364	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015417	ATTTT	2	10	176617	176626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015417	TAATT	2	10	179153	179162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015417	TAATT	2	10	185037	185046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015417	CATTT	2	10	188401	188410	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015417	TAATT	2	10	188517	188526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015417	ATTTT	2	10	189085	189094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015417	TTCGT	2	10	192065	192074	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015417	CTTTT	2	10	192986	192995	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015417	TATAA	2	10	200021	200030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015417	ATTTT	2	10	202912	202921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.