MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015417	AAGAA	2	10	4558	4567	80 %	0 %	20 %	0 %	331270871
2	NC_015417	ATGAA	2	10	5064	5073	60 %	20 %	20 %	0 %	331270871
3	NC_015417	TGAAA	2	10	10176	10185	60 %	20 %	20 %	0 %	331270875
4	NC_015417	GAAAA	2	10	10423	10432	80 %	0 %	20 %	0 %	331270875
5	NC_015417	AAGTT	2	10	12755	12764	40 %	40 %	20 %	0 %	331270878
6	NC_015417	AAATA	2	10	14506	14515	80 %	20 %	0 %	0 %	331270880
7	NC_015417	AATAA	2	10	18983	18992	80 %	20 %	0 %	0 %	331270885
8	NC_015417	ATAGA	2	10	19479	19488	60 %	20 %	20 %	0 %	331270885
9	NC_015417	AATTA	2	10	19823	19832	60 %	40 %	0 %	0 %	331270886
10	NC_015417	GTATA	2	10	19959	19968	40 %	40 %	20 %	0 %	331270886
11	NC_015417	AAAAG	2	10	20352	20361	80 %	0 %	20 %	0 %	331270886
12	NC_015417	TTTAA	2	10	20878	20887	40 %	60 %	0 %	0 %	331270886
13	NC_015417	GAAAA	2	10	21225	21234	80 %	0 %	20 %	0 %	331270886
14	NC_015417	ATTTA	2	10	22484	22493	40 %	60 %	0 %	0 %	331270887
15	NC_015417	AAGAA	2	10	23005	23014	80 %	0 %	20 %	0 %	331270889
16	NC_015417	ATGAA	2	10	23511	23520	60 %	20 %	20 %	0 %	331270889
17	NC_015417	TCATA	2	10	26427	26436	40 %	40 %	0 %	20 %	331270891
18	NC_015417	AAAAT	2	10	29505	29514	80 %	20 %	0 %	0 %	331270892
19	NC_015417	ATTTA	2	10	30138	30147	40 %	60 %	0 %	0 %	331270892
20	NC_015417	ATTTA	2	10	30421	30430	40 %	60 %	0 %	0 %	331270892
21	NC_015417	AAAAG	2	10	30854	30863	80 %	0 %	20 %	0 %	331270893
22	NC_015417	AGAAA	2	10	31900	31909	80 %	0 %	20 %	0 %	331270894
23	NC_015417	GAAGA	2	10	32428	32437	60 %	0 %	40 %	0 %	331270894
24	NC_015417	ACTAA	2	10	35761	35770	60 %	20 %	0 %	20 %	331270897
25	NC_015417	TAACT	2	10	38835	38844	40 %	40 %	0 %	20 %	331270899
26	NC_015417	AATTA	2	10	39712	39721	60 %	40 %	0 %	0 %	331270901
27	NC_015417	ATAAC	2	10	41726	41735	60 %	20 %	0 %	20 %	331270905
28	NC_015417	TATAG	2	10	41980	41989	40 %	40 %	20 %	0 %	331270905
29	NC_015417	AATTA	2	10	43442	43451	60 %	40 %	0 %	0 %	331270907
30	NC_015417	AGAAA	2	10	43494	43503	80 %	0 %	20 %	0 %	331270907
31	NC_015417	ATTAA	2	10	43694	43703	60 %	40 %	0 %	0 %	331270907
32	NC_015417	CATTG	2	10	44069	44078	20 %	40 %	20 %	20 %	331270908
33	NC_015417	GAATT	2	10	44731	44740	40 %	40 %	20 %	0 %	331270909
34	NC_015417	TAATT	2	10	45330	45339	40 %	60 %	0 %	0 %	331270911
35	NC_015417	GGCTT	2	10	45612	45621	0 %	40 %	40 %	20 %	331270911
36	NC_015417	TCTTT	2	10	45768	45777	0 %	80 %	0 %	20 %	331270911
37	NC_015417	ATACA	2	10	46771	46780	60 %	20 %	0 %	20 %	331270912
38	NC_015417	TAAAA	2	10	47032	47041	80 %	20 %	0 %	0 %	331270912
39	NC_015417	ATAGT	2	10	47316	47325	40 %	40 %	20 %	0 %	331270912
40	NC_015417	GAGAT	2	10	47544	47553	40 %	20 %	40 %	0 %	331270913
41	NC_015417	AAAAT	2	10	49101	49110	80 %	20 %	0 %	0 %	331270915
42	NC_015417	AAAAG	2	10	49393	49402	80 %	0 %	20 %	0 %	331270916
43	NC_015417	AAATT	3	15	50392	50406	60 %	40 %	0 %	0 %	331270917
44	NC_015417	AATGG	2	10	50504	50513	40 %	20 %	40 %	0 %	331270918
45	NC_015417	AACTA	2	10	54137	54146	60 %	20 %	0 %	20 %	331270924
46	NC_015417	AGAAA	2	10	54801	54810	80 %	0 %	20 %	0 %	331270924
47	NC_015417	TAAAT	2	10	55445	55454	60 %	40 %	0 %	0 %	331270925
48	NC_015417	TTTTC	2	10	55968	55977	0 %	80 %	0 %	20 %	331270925
49	NC_015417	AAATT	2	10	56553	56562	60 %	40 %	0 %	0 %	331270925
50	NC_015417	TAATT	2	10	57570	57579	40 %	60 %	0 %	0 %	331270927
51	NC_015417	TAGAA	2	10	59895	59904	60 %	20 %	20 %	0 %	331270932
52	NC_015417	ATTAG	2	10	60955	60964	40 %	40 %	20 %	0 %	331270933
53	NC_015417	AAAGA	2	10	61317	61326	80 %	0 %	20 %	0 %	331270933
54	NC_015417	TAAAA	2	10	61392	61401	80 %	20 %	0 %	0 %	331270933
55	NC_015417	GAAAA	2	10	61728	61737	80 %	0 %	20 %	0 %	331270934
56	NC_015417	GCTTT	2	10	62123	62132	0 %	60 %	20 %	20 %	331270934
57	NC_015417	GTACT	2	10	64961	64970	20 %	40 %	20 %	20 %	331270936
58	NC_015417	AAAAG	2	10	65357	65366	80 %	0 %	20 %	0 %	331270937
59	NC_015417	CATGG	2	10	66184	66193	20 %	20 %	40 %	20 %	331270938
60	NC_015417	ATTAT	2	10	67444	67453	40 %	60 %	0 %	0 %	331270939
61	NC_015417	CATAT	2	10	68326	68335	40 %	40 %	0 %	20 %	331270939
62	NC_015417	ATGGA	2	10	69738	69747	40 %	20 %	40 %	0 %	331270939
63	NC_015417	AAATT	2	10	70238	70247	60 %	40 %	0 %	0 %	331270939
64	NC_015417	AGTAG	2	10	70433	70442	40 %	20 %	40 %	0 %	331270939
65	NC_015417	AAATA	2	10	70984	70993	80 %	20 %	0 %	0 %	331270940
66	NC_015417	GAATA	2	10	71047	71056	60 %	20 %	20 %	0 %	331270940
67	NC_015417	AAAGA	2	10	71268	71277	80 %	0 %	20 %	0 %	331270940
68	NC_015417	AATAT	2	10	71875	71884	60 %	40 %	0 %	0 %	331270940
69	NC_015417	GATGT	2	10	72106	72115	20 %	40 %	40 %	0 %	331270940
70	NC_015417	TATGA	2	10	72255	72264	40 %	40 %	20 %	0 %	331270940
71	NC_015417	AAATA	2	10	77789	77798	80 %	20 %	0 %	0 %	331270947
72	NC_015417	AGAAA	2	10	78276	78285	80 %	0 %	20 %	0 %	331270947
73	NC_015417	TATAT	2	10	80020	80029	40 %	60 %	0 %	0 %	331270949
74	NC_015417	AAGGT	2	10	81260	81269	40 %	20 %	40 %	0 %	331270950
75	NC_015417	AATTA	2	10	81344	81353	60 %	40 %	0 %	0 %	331270951
76	NC_015417	GAAAA	2	10	81356	81365	80 %	0 %	20 %	0 %	331270951
77	NC_015417	TACAA	2	10	81484	81493	60 %	20 %	0 %	20 %	331270951
78	NC_015417	GATAT	2	10	83081	83090	40 %	40 %	20 %	0 %	331270954
79	NC_015417	TAAAT	2	10	83253	83262	60 %	40 %	0 %	0 %	331270954
80	NC_015417	TTTAT	2	10	83691	83700	20 %	80 %	0 %	0 %	331270955
81	NC_015417	ATTAT	2	10	84323	84332	40 %	60 %	0 %	0 %	331270956
82	NC_015417	TAATA	2	10	84732	84741	60 %	40 %	0 %	0 %	331270956
83	NC_015417	TAAAA	2	10	85674	85683	80 %	20 %	0 %	0 %	331270956
84	NC_015417	TACTA	2	10	86309	86318	40 %	40 %	0 %	20 %	331270957
85	NC_015417	ATTTT	2	10	86575	86584	20 %	80 %	0 %	0 %	331270957
86	NC_015417	TAAGA	2	10	87333	87342	60 %	20 %	20 %	0 %	331270958
87	NC_015417	TTTTA	2	10	87360	87369	20 %	80 %	0 %	0 %	331270958
88	NC_015417	TTTGA	2	10	87407	87416	20 %	60 %	20 %	0 %	331270958
89	NC_015417	AGAAC	2	10	88554	88563	60 %	0 %	20 %	20 %	331270959
90	NC_015417	TATAA	2	10	88923	88932	60 %	40 %	0 %	0 %	331270959
91	NC_015417	TTTGG	2	10	89578	89587	0 %	60 %	40 %	0 %	331270959
92	NC_015417	ATGCA	2	10	92112	92121	40 %	20 %	20 %	20 %	331270960
93	NC_015417	AATAC	2	10	93938	93947	60 %	20 %	0 %	20 %	331270960
94	NC_015417	ACAAA	2	10	94042	94051	80 %	0 %	0 %	20 %	331270960
95	NC_015417	ATATT	2	10	94720	94729	40 %	60 %	0 %	0 %	331270960
96	NC_015417	GTATA	2	10	96047	96056	40 %	40 %	20 %	0 %	331270961
97	NC_015417	AGTTT	2	10	97450	97459	20 %	60 %	20 %	0 %	331270964
98	NC_015417	ATTAT	2	10	98494	98503	40 %	60 %	0 %	0 %	331270966
99	NC_015417	AGTAG	2	10	98636	98645	40 %	20 %	40 %	0 %	331270966
100	NC_015417	AGATA	2	10	98893	98902	60 %	20 %	20 %	0 %	331270966
101	NC_015417	AAATA	2	10	99604	99613	80 %	20 %	0 %	0 %	331270967
102	NC_015417	TAATT	2	10	101404	101413	40 %	60 %	0 %	0 %	331270969
103	NC_015417	AGAAA	2	10	101989	101998	80 %	0 %	20 %	0 %	331270969
104	NC_015417	ATTTA	2	10	102516	102525	40 %	60 %	0 %	0 %	331270969
105	NC_015417	AAAAT	2	10	104693	104702	80 %	20 %	0 %	0 %	331270971
106	NC_015417	AAAAG	2	10	104827	104836	80 %	0 %	20 %	0 %	331270971
107	NC_015417	TAAAT	2	10	106354	106363	60 %	40 %	0 %	0 %	331270971
108	NC_015417	AACAA	2	10	107944	107953	80 %	0 %	0 %	20 %	331270971
109	NC_015417	AAAAG	2	10	108398	108407	80 %	0 %	20 %	0 %	331270973
110	NC_015417	CAAAT	2	10	108488	108497	60 %	20 %	0 %	20 %	331270973
111	NC_015417	CTTTT	2	10	110261	110270	0 %	80 %	0 %	20 %	331270977
112	NC_015417	AATAA	2	10	110454	110463	80 %	20 %	0 %	0 %	331270977
113	NC_015417	TATAA	2	10	111769	111778	60 %	40 %	0 %	0 %	331270979
114	NC_015417	ATGCT	2	10	114979	114988	20 %	40 %	20 %	20 %	331270981
115	NC_015417	TTTTA	2	10	115559	115568	20 %	80 %	0 %	0 %	331270981
116	NC_015417	ATTAA	2	10	116258	116267	60 %	40 %	0 %	0 %	331270982
117	NC_015417	ATTTT	2	10	118668	118677	20 %	80 %	0 %	0 %	331270985
118	NC_015417	ATTTT	2	10	118793	118802	20 %	80 %	0 %	0 %	331270986
119	NC_015417	TAAAT	2	10	118860	118869	60 %	40 %	0 %	0 %	331270986
120	NC_015417	TATCA	2	10	119169	119178	40 %	40 %	0 %	20 %	331270986
121	NC_015417	AAATC	2	10	120169	120178	60 %	20 %	0 %	20 %	331270987
122	NC_015417	TAATT	2	10	120604	120613	40 %	60 %	0 %	0 %	331270988
123	NC_015417	ATATA	2	10	123440	123449	60 %	40 %	0 %	0 %	331270992
124	NC_015417	TAAAT	2	10	123965	123974	60 %	40 %	0 %	0 %	331270993
125	NC_015417	TAATA	2	10	125268	125277	60 %	40 %	0 %	0 %	331270994
126	NC_015417	TATTT	2	10	130875	130884	20 %	80 %	0 %	0 %	331271005
127	NC_015417	TTTCT	2	10	133687	133696	0 %	80 %	0 %	20 %	331271009
128	NC_015417	ACATT	2	10	133722	133731	40 %	40 %	0 %	20 %	331271009
129	NC_015417	TAATA	2	10	133837	133846	60 %	40 %	0 %	0 %	331271009
130	NC_015417	TAAAT	2	10	134014	134023	60 %	40 %	0 %	0 %	331271010
131	NC_015417	AAAAT	2	10	137091	137100	80 %	20 %	0 %	0 %	331271013
132	NC_015417	CATAC	2	10	137490	137499	40 %	20 %	0 %	40 %	331271014
133	NC_015417	TTCCA	2	10	138285	138294	20 %	40 %	0 %	40 %	331271014
134	NC_015417	ATAAC	2	10	142955	142964	60 %	20 %	0 %	20 %	331271018
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.