MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 1332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015416	TTTG	2	8	3238	3245	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015416	AACG	2	8	3832	3839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015416	AATT	2	8	15991	15998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015416	CGCC	2	8	16096	16103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015416	CCTC	2	8	16292	16299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_015416	AAGG	2	8	16588	16595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015416	AGGT	2	8	16877	16884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015416	CTAT	2	8	17367	17374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015416	ACGC	2	8	20982	20989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015416	TCCT	2	8	21073	21080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015416	ATAA	2	8	25029	25036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015416	CATC	2	8	26119	26126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015416	TCAC	2	8	29944	29951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015416	GTTT	2	8	31873	31880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015416	CATG	2	8	35302	35309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015416	GCTG	2	8	35346	35353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015416	GAAG	2	8	39504	39511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015416	CTGA	2	8	39589	39596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015416	GGCT	2	8	40361	40368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015416	CGAG	2	8	40390	40397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015416	CTAT	2	8	46509	46516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015416	TAAA	2	8	47084	47091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015416	ATTA	2	8	47498	47505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015416	AGAA	2	8	47527	47534	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015416	CTGC	2	8	48586	48593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015416	CCTA	2	8	48686	48693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015416	TGCC	2	8	48733	48740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015416	TCAT	2	8	48741	48748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015416	CGTG	2	8	52251	52258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015416	TCAG	2	8	52791	52798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015416	TGGG	2	8	55034	55041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015416	GCAG	2	8	55244	55251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015416	CTCG	2	8	55337	55344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015416	ACCA	2	8	56541	56548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015416	CCTT	2	8	57529	57536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015416	CAAT	2	8	57611	57618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015416	AACA	2	8	77588	77595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015416	TGAT	2	8	82972	82979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015416	TCCT	2	8	83098	83105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015416	GAAT	2	8	89274	89281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015416	AAAT	2	8	93970	93977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015416	GGAA	2	8	94156	94163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015416	CGAT	2	8	98476	98483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015416	ATCC	2	8	98543	98550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015416	ATGA	2	8	113733	113740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015416	TGAT	2	8	115565	115572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015416	TTCA	2	8	115691	115698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015416	ATTA	2	8	115817	115824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015416	ATTT	2	8	115852	115859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015416	TAAA	2	8	115911	115918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015416	TGAA	2	8	116131	116138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015416	ATAA	2	8	116361	116368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015416	TAAT	2	8	116450	116457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015416	ATTA	2	8	116479	116486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015416	TGAG	2	8	116602	116609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015416	CTTT	2	8	116741	116748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015416	GGAT	2	8	120600	120607	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015416	CGTT	2	8	121956	121963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015416	CCGC	2	8	122553	122560	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015416	CTTT	2	8	123160	123167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015416	TTTC	2	8	123630	123637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015416	GATA	2	8	133314	133321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015416	ACGC	2	8	136039	136046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015416	ATAC	2	8	140860	140867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015416	TCTG	2	8	141093	141100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015416	ATGA	2	8	142942	142949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015416	TATT	2	8	146081	146088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015416	TTAT	2	8	148651	148658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015416	ATCA	2	8	148752	148759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015416	ATAC	2	8	153778	153785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015416	CATC	2	8	159830	159837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015416	CTCA	2	8	159858	159865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015416	AGCC	2	8	169420	169427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015416	GCAA	2	8	169488	169495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015416	TGGA	2	8	169591	169598	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015416	AGTG	2	8	169845	169852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015416	GATT	2	8	171939	171946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015416	CCTT	2	8	178002	178009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015416	TCAG	2	8	178228	178235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015416	ATCC	2	8	181369	181376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015416	AACT	2	8	185609	185616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015416	TGGA	2	8	189210	189217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015416	CCAA	2	8	190849	190856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015416	CAGG	2	8	197960	197967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015416	AGCC	2	8	200634	200641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015416	TCCA	2	8	201390	201397	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015416	ATAA	2	8	202203	202210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015416	ATGA	2	8	209323	209330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015416	TGTA	2	8	210122	210129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015416	ATGA	2	8	213816	213823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015416	ACTA	2	8	225012	225019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015416	ATTT	2	8	227472	227479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015416	CTTC	2	8	228099	228106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015416	TTTA	2	8	228202	228209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015416	CCAT	2	8	231997	232004	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015416	GAAT	2	8	232905	232912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015416	TATC	2	8	238361	238368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015416	GCTT	2	8	239067	239074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015416	GCCT	2	8	239882	239889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015416	TGGC	2	8	239974	239981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015416	AGCA	2	8	240127	240134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015416	TCCC	2	8	241010	241017	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_015416	GATC	2	8	241067	241074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015416	TTAT	2	8	242440	242447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015416	TTTC	2	8	242448	242455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015416	CAAG	2	8	242974	242981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015416	TTCC	2	8	243066	243073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015416	ATGG	2	8	244240	244247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015416	ATAA	2	8	245367	245374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015416	TCCC	2	8	245385	245392	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_015416	ATTC	2	8	245414	245421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015416	ATGA	2	8	247400	247407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015416	CCTG	2	8	250130	250137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015416	GAGG	2	8	253651	253658	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015416	TCCT	2	8	253679	253686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015416	TTAA	2	8	254075	254082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015416	CGAT	2	8	257771	257778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015416	TGCC	2	8	257831	257838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015416	TGAA	2	8	270726	270733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015416	AGCA	2	8	273619	273626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015416	AATC	2	8	277270	277277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015416	AAAC	2	8	279060	279067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015416	AATT	2	8	279089	279096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015416	GATG	2	8	279145	279152	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015416	TTTA	2	8	279185	279192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015416	GCAG	2	8	282806	282813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015416	GGAT	2	8	284474	284481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015416	GGCC	2	8	284665	284672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015416	AATA	2	8	288319	288326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015416	GATT	2	8	288372	288379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015416	ATCA	2	8	290892	290899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015416	GCCG	2	8	291891	291898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015416	CGAG	2	8	292409	292416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015416	TGGT	2	8	292554	292561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015416	CTTT	2	8	292753	292760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015416	GCCA	2	8	293194	293201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015416	TGGC	2	8	293709	293716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015416	TCTT	2	8	293742	293749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015416	GTGC	2	8	293919	293926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015416	GTAG	2	8	293965	293972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015416	GCTA	2	8	294902	294909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015416	TAGG	2	8	295326	295333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015416	TGGG	2	8	295441	295448	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015416	GGTT	2	8	295844	295851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015416	CGGA	2	8	296479	296486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015416	CTTT	2	8	296507	296514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015416	GACA	2	8	296647	296654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015416	TTAC	2	8	296685	296692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015416	GACA	2	8	297438	297445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015416	GCCT	2	8	297667	297674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015416	CTTC	2	8	297766	297773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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490	NC_015416	GCAG	2	8	1103472	1103479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_015416	CGCT	2	8	1111003	1111010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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494	NC_015416	CGGC	2	8	1112194	1112201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_015416	GGCA	2	8	1112734	1112741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_015416	GATC	2	8	1112925	1112932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_015416	CTAG	2	8	1114492	1114499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015416	ATTT	2	8	1114526	1114533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015416	CCTT	2	8	1117303	1117310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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