MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	GTAGGC	2	12	56	67	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015409	CAGCCG	2	12	1475	1486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015409	GGCCGG	2	12	1508	1519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015409	GGGGAC	2	12	5977	5988	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330464834
5	NC_015409	AGCCCC	2	12	8642	8653	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330464836
6	NC_015409	CGGTCG	2	12	9646	9657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330464837
7	NC_015409	CACTCG	2	12	10267	10278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330464838
8	NC_015409	GTCGGC	2	12	11767	11778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330464838
9	NC_015409	CGGTGG	2	12	12050	12061	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330464838
10	NC_015409	CGGCGT	2	12	13145	13156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330464840
11	NC_015409	GAGCAG	2	12	13200	13211	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330464840
12	NC_015409	TACGGG	2	12	14560	14571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330464841
13	NC_015409	AGGTCG	2	12	15553	15564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330464841
14	NC_015409	CCTCGG	2	12	16181	16192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330464841
15	NC_015409	GCCCAG	2	12	17097	17108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330464842
16	NC_015409	GACCGG	2	12	17802	17813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330464842
17	NC_015409	GGGCGG	2	12	19098	19109	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	330464843
18	NC_015409	GCCACC	2	12	19746	19757	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330464844
19	NC_015409	CACGGG	2	12	20273	20284	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330464845
20	NC_015409	CGCCTG	2	12	21515	21526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330464846
21	NC_015409	CGCAGC	2	12	22894	22905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330464849
22	NC_015409	CCGTCA	2	12	23063	23074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330464849
23	NC_015409	CGGCCT	2	12	23749	23760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330464850
24	NC_015409	CTCCCG	2	12	23792	23803	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	330464850
25	NC_015409	TCAACC	2	12	25378	25389	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330464852
26	NC_015409	CGAGGC	2	12	26526	26537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330464853
27	NC_015409	CTGATC	2	12	34097	34108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330464864
28	NC_015409	TGACCC	2	12	35486	35497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330464865
29	NC_015409	GCCACC	2	12	37534	37545	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330464865
30	NC_015409	CCGAAG	2	12	38176	38187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330464865
31	NC_015409	GGCACC	2	12	38365	38376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330464865
32	NC_015409	CCGTCA	2	12	39005	39016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330464865
33	NC_015409	GGTCTG	2	12	42218	42229	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	330464867
34	NC_015409	GCCGGC	2	12	42977	42988	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
35	NC_015409	ACCGGC	2	12	45374	45385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330464870
36	NC_015409	CCGCCA	2	12	45996	46007	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330464870
37	NC_015409	TCGGCA	2	12	46908	46919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330464872
38	NC_015409	GCATCG	2	12	46991	47002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330464872
39	NC_015409	GCCGGT	2	12	50882	50893	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330464876
40	NC_015409	CCACCG	2	12	51132	51143	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330464877
41	NC_015409	CCTGGT	2	12	52660	52671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330464878
42	NC_015409	CCCGAC	2	12	53000	53011	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330464878

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.