MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	CCAGG	2	10	713	722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015409	CAGTA	2	10	3639	3648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015409	TCCCT	2	10	4398	4407	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015409	CGCGG	2	10	5637	5646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015409	GCGCC	2	10	6955	6964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015409	TCCGC	2	10	8568	8577	0 %	20 %	20 %	60 %	330464836
7	NC_015409	ACGGC	2	10	8852	8861	20 %	0 %	40 %	40 %	330464836
8	NC_015409	CGGCC	2	10	9482	9491	0 %	0 %	40 %	60 %	330464837
9	NC_015409	GCAGC	2	10	9990	9999	20 %	0 %	40 %	40 %	330464837
10	NC_015409	TGGGC	2	10	10202	10211	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015409	GCGCG	2	10	10295	10304	0 %	0 %	60 %	40 %	330464838
12	NC_015409	CGGCG	2	10	10307	10316	0 %	0 %	60 %	40 %	330464838
13	NC_015409	GGCCG	2	10	10518	10527	0 %	0 %	60 %	40 %	330464838
14	NC_015409	CCGGC	2	10	11407	11416	0 %	0 %	40 %	60 %	330464838
15	NC_015409	CCCGG	2	10	15266	15275	0 %	0 %	40 %	60 %	330464841
16	NC_015409	GTGCG	2	10	16066	16075	0 %	20 %	60 %	20 %	330464841
17	NC_015409	CGGCG	2	10	16148	16157	0 %	0 %	60 %	40 %	330464841
18	NC_015409	TGCTC	2	10	16532	16541	0 %	40 %	20 %	40 %	330464842
19	NC_015409	GGTGG	2	10	17907	17916	0 %	20 %	80 %	0 %	330464842
20	NC_015409	CGGCC	2	10	18090	18099	0 %	0 %	40 %	60 %	330464842
21	NC_015409	GCCAC	2	10	18101	18110	20 %	0 %	20 %	60 %	330464842
22	NC_015409	AGGGG	2	10	20449	20458	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015409	GCCGC	2	10	21385	21394	0 %	0 %	40 %	60 %	330464846
24	NC_015409	TGCGG	2	10	21722	21731	0 %	20 %	60 %	20 %	330464846
25	NC_015409	CCACG	2	10	22052	22061	20 %	0 %	20 %	60 %	330464846
26	NC_015409	GGCAG	2	10	22255	22264	20 %	0 %	60 %	20 %	330464847
27	NC_015409	GTCCA	2	10	22296	22305	20 %	20 %	20 %	40 %	330464847
28	NC_015409	CGTGG	2	10	23037	23046	0 %	20 %	60 %	20 %	330464849
29	NC_015409	ACCGC	2	10	23450	23459	20 %	0 %	20 %	60 %	330464849
30	NC_015409	AGGTC	2	10	24507	24516	20 %	20 %	40 %	20 %	330464851
31	NC_015409	TCGGG	2	10	24659	24668	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015409	GGAGT	2	10	24945	24954	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015409	CCTCG	2	10	27431	27440	0 %	20 %	20 %	60 %	330464854
34	NC_015409	CCCGG	2	10	27566	27575	0 %	0 %	40 %	60 %	330464854
35	NC_015409	GTCGG	2	10	30359	30368	0 %	20 %	60 %	20 %	330464858
36	NC_015409	CCGAC	2	10	30399	30408	20 %	0 %	20 %	60 %	330464858
37	NC_015409	CGGCG	2	10	31657	31666	0 %	0 %	60 %	40 %	330464859
38	NC_015409	TGCAT	2	10	31684	31693	20 %	40 %	20 %	20 %	330464859
39	NC_015409	TGGCC	2	10	32133	32142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015409	GCACC	2	10	32641	32650	20 %	0 %	20 %	60 %	330464862
41	NC_015409	GACCG	2	10	32692	32701	20 %	0 %	40 %	40 %	330464862
42	NC_015409	CGCCT	2	10	32750	32759	0 %	20 %	20 %	60 %	330464862
43	NC_015409	GGGGT	2	10	34557	34566	0 %	20 %	80 %	0 %	330464865
44	NC_015409	CCCGG	2	10	35057	35066	0 %	0 %	40 %	60 %	330464865
45	NC_015409	CTCGC	2	10	35471	35480	0 %	20 %	20 %	60 %	330464865
46	NC_015409	CCGGC	2	10	35510	35519	0 %	0 %	40 %	60 %	330464865
47	NC_015409	GCAGC	2	10	36783	36792	20 %	0 %	40 %	40 %	330464865
48	NC_015409	CGGGA	2	10	39031	39040	20 %	0 %	60 %	20 %	330464865
49	NC_015409	CGGCC	2	10	39921	39930	0 %	0 %	40 %	60 %	330464865
50	NC_015409	CGCCC	2	10	40496	40505	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
51	NC_015409	GAGCG	2	10	40524	40533	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015409	GGGCC	2	10	40674	40683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015409	TCGGC	2	10	40730	40739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015409	CCGGG	2	10	42173	42182	0 %	0 %	60 %	40 %	330464867
55	NC_015409	CCGGC	2	10	43095	43104	0 %	0 %	40 %	60 %	330464867
56	NC_015409	GCCCG	2	10	45364	45373	0 %	0 %	40 %	60 %	330464870
57	NC_015409	CCCGG	2	10	46193	46202	0 %	0 %	40 %	60 %	330464871
58	NC_015409	CCATC	2	10	47824	47833	20 %	20 %	0 %	60 %	330464874
59	NC_015409	GCGGT	2	10	49242	49251	0 %	20 %	60 %	20 %	330464875
60	NC_015409	CGGGC	2	10	51554	51563	0 %	0 %	60 %	40 %	330464877
61	NC_015409	GCACC	2	10	51905	51914	20 %	0 %	20 %	60 %	330464877
62	NC_015409	GAGCA	2	10	53264	53273	40 %	0 %	40 %	20 %	330464878
63	NC_015409	CCCCG	2	10	53743	53752	0 %	0 %	20 %	80 %	330464878
64	NC_015409	AGGGC	2	10	56868	56877	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.