MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	TCCGC	2	10	8568	8577	0 %	20 %	20 %	60 %	330464836
2	NC_015409	ACGGC	2	10	8852	8861	20 %	0 %	40 %	40 %	330464836
3	NC_015409	CGGCC	2	10	9482	9491	0 %	0 %	40 %	60 %	330464837
4	NC_015409	GCAGC	2	10	9990	9999	20 %	0 %	40 %	40 %	330464837
5	NC_015409	GCGCG	2	10	10295	10304	0 %	0 %	60 %	40 %	330464838
6	NC_015409	CGGCG	2	10	10307	10316	0 %	0 %	60 %	40 %	330464838
7	NC_015409	GGCCG	2	10	10518	10527	0 %	0 %	60 %	40 %	330464838
8	NC_015409	CCGGC	2	10	11407	11416	0 %	0 %	40 %	60 %	330464838
9	NC_015409	CCCGG	2	10	15266	15275	0 %	0 %	40 %	60 %	330464841
10	NC_015409	GTGCG	2	10	16066	16075	0 %	20 %	60 %	20 %	330464841
11	NC_015409	CGGCG	2	10	16148	16157	0 %	0 %	60 %	40 %	330464841
12	NC_015409	TGCTC	2	10	16532	16541	0 %	40 %	20 %	40 %	330464842
13	NC_015409	GGTGG	2	10	17907	17916	0 %	20 %	80 %	0 %	330464842
14	NC_015409	CGGCC	2	10	18090	18099	0 %	0 %	40 %	60 %	330464842
15	NC_015409	GCCAC	2	10	18101	18110	20 %	0 %	20 %	60 %	330464842
16	NC_015409	GCCGC	2	10	21385	21394	0 %	0 %	40 %	60 %	330464846
17	NC_015409	TGCGG	2	10	21722	21731	0 %	20 %	60 %	20 %	330464846
18	NC_015409	CCACG	2	10	22052	22061	20 %	0 %	20 %	60 %	330464846
19	NC_015409	GGCAG	2	10	22255	22264	20 %	0 %	60 %	20 %	330464847
20	NC_015409	GTCCA	2	10	22296	22305	20 %	20 %	20 %	40 %	330464847
21	NC_015409	CGTGG	2	10	23037	23046	0 %	20 %	60 %	20 %	330464849
22	NC_015409	ACCGC	2	10	23450	23459	20 %	0 %	20 %	60 %	330464849
23	NC_015409	AGGTC	2	10	24507	24516	20 %	20 %	40 %	20 %	330464851
24	NC_015409	CCTCG	2	10	27431	27440	0 %	20 %	20 %	60 %	330464854
25	NC_015409	CCCGG	2	10	27566	27575	0 %	0 %	40 %	60 %	330464854
26	NC_015409	GTCGG	2	10	30359	30368	0 %	20 %	60 %	20 %	330464858
27	NC_015409	CCGAC	2	10	30399	30408	20 %	0 %	20 %	60 %	330464858
28	NC_015409	CGGCG	2	10	31657	31666	0 %	0 %	60 %	40 %	330464859
29	NC_015409	TGCAT	2	10	31684	31693	20 %	40 %	20 %	20 %	330464859
30	NC_015409	GCACC	2	10	32641	32650	20 %	0 %	20 %	60 %	330464862
31	NC_015409	GACCG	2	10	32692	32701	20 %	0 %	40 %	40 %	330464862
32	NC_015409	CGCCT	2	10	32750	32759	0 %	20 %	20 %	60 %	330464862
33	NC_015409	GGGGT	2	10	34557	34566	0 %	20 %	80 %	0 %	330464865
34	NC_015409	CCCGG	2	10	35057	35066	0 %	0 %	40 %	60 %	330464865
35	NC_015409	CTCGC	2	10	35471	35480	0 %	20 %	20 %	60 %	330464865
36	NC_015409	CCGGC	2	10	35510	35519	0 %	0 %	40 %	60 %	330464865
37	NC_015409	GCAGC	2	10	36783	36792	20 %	0 %	40 %	40 %	330464865
38	NC_015409	CGGGA	2	10	39031	39040	20 %	0 %	60 %	20 %	330464865
39	NC_015409	CGGCC	2	10	39921	39930	0 %	0 %	40 %	60 %	330464865
40	NC_015409	CCGGG	2	10	42173	42182	0 %	0 %	60 %	40 %	330464867
41	NC_015409	CCGGC	2	10	43095	43104	0 %	0 %	40 %	60 %	330464867
42	NC_015409	GCCCG	2	10	45364	45373	0 %	0 %	40 %	60 %	330464870
43	NC_015409	CCCGG	2	10	46193	46202	0 %	0 %	40 %	60 %	330464871
44	NC_015409	CCATC	2	10	47824	47833	20 %	20 %	0 %	60 %	330464874
45	NC_015409	GCGGT	2	10	49242	49251	0 %	20 %	60 %	20 %	330464875
46	NC_015409	CGGGC	2	10	51554	51563	0 %	0 %	60 %	40 %	330464877
47	NC_015409	GCACC	2	10	51905	51914	20 %	0 %	20 %	60 %	330464877
48	NC_015409	GAGCA	2	10	53264	53273	40 %	0 %	40 %	20 %	330464878
49	NC_015409	CCCCG	2	10	53743	53752	0 %	0 %	20 %	80 %	330464878

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.