MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	CGCC	2	8	29	36	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_015409	CGCC	2	8	155	162	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015409	GCTT	2	8	261	268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015409	GAGG	2	8	286	293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015409	GCCG	2	8	625	632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015409	CCGC	2	8	634	641	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015409	GCCA	2	8	1191	1198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015409	GGTG	2	8	1339	1346	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015409	CCAG	2	8	1441	1448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015409	CACC	2	8	1657	1664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015409	GCCA	2	8	1913	1920	25 %	0 %	25 %	50 %	330464830
12	NC_015409	TGCC	2	8	2502	2509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015409	CCGC	2	8	2602	2609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015409	GTCG	2	8	2630	2637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015409	CAAA	2	8	2790	2797	75 %	0 %	0 %	25 %	330464831
16	NC_015409	GCCA	2	8	2940	2947	25 %	0 %	25 %	50 %	330464831
17	NC_015409	CATC	2	8	2968	2975	25 %	25 %	0 %	50 %	330464831
18	NC_015409	ATCG	2	8	3427	3434	25 %	25 %	25 %	25 %	330464832
19	NC_015409	CCGA	2	8	3454	3461	25 %	0 %	25 %	50 %	330464832
20	NC_015409	GGCT	2	8	4081	4088	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015409	CATC	2	8	4245	4252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015409	GACC	2	8	4507	4514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015409	CTGG	2	8	5097	5104	0 %	25 %	50 %	25 %	330464833
24	NC_015409	CCGG	2	8	5178	5185	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
25	NC_015409	CGGC	2	8	5516	5523	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
26	NC_015409	GCCG	2	8	5598	5605	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
27	NC_015409	GATC	2	8	6104	6111	25 %	25 %	25 %	25 %	330464834
28	NC_015409	TTCT	2	8	6993	7000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015409	TTCA	2	8	7748	7755	25 %	50 %	0 %	25 %	330464835
30	NC_015409	GGCA	2	8	7974	7981	25 %	0 %	50 %	25 %	330464836
31	NC_015409	GCCG	2	8	8337	8344	0 %	0 %	50 %	50 %	330464836
32	NC_015409	ACGG	2	8	9207	9214	25 %	0 %	50 %	25 %	330464837
33	NC_015409	CGGC	2	8	9791	9798	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
34	NC_015409	CGGT	2	8	9805	9812	0 %	25 %	50 %	25 %	330464837
35	NC_015409	CCGC	2	8	9897	9904	0 %	0 %	25 %	75 %	330464837
36	NC_015409	TTGA	2	8	10116	10123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015409	GCAC	2	8	10336	10343	25 %	0 %	25 %	50 %	330464838
38	NC_015409	CCGG	2	8	10589	10596	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
39	NC_015409	TCCT	2	8	10882	10889	0 %	50 %	0 %	50 %	330464838
40	NC_015409	CCGG	2	8	11271	11278	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
41	NC_015409	CCGG	2	8	11369	11376	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
42	NC_015409	GCCA	2	8	11737	11744	25 %	0 %	25 %	50 %	330464838
43	NC_015409	CGGT	2	8	11875	11882	0 %	25 %	50 %	25 %	330464838
44	NC_015409	CACG	2	8	11973	11980	25 %	0 %	25 %	50 %	330464838
45	NC_015409	GGTG	2	8	12329	12336	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015409	CGGA	2	8	13033	13040	25 %	0 %	50 %	25 %	330464840
47	NC_015409	CGGT	2	8	13489	13496	0 %	25 %	50 %	25 %	330464840
48	NC_015409	GGCG	2	8	13716	13723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015409	CCGC	2	8	13750	13757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_015409	GGTG	2	8	13839	13846	0 %	25 %	75 %	0 %	330464841
51	NC_015409	CGGC	2	8	13969	13976	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
52	NC_015409	CTGG	2	8	14028	14035	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
53	NC_015409	CGCT	2	8	14581	14588	0 %	25 %	25 %	50 %	330464841
54	NC_015409	GTCG	2	8	15276	15283	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
55	NC_015409	CCGG	2	8	15431	15438	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
56	NC_015409	TCGG	2	8	15502	15509	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
57	NC_015409	GGTC	2	8	15545	15552	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
58	NC_015409	GCCG	2	8	15842	15849	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
59	NC_015409	CCGG	2	8	15957	15964	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
60	NC_015409	CCGG	2	8	16451	16458	0 %	0 %	50 %	50 %	330464842
61	NC_015409	GCAG	2	8	16493	16500	25 %	0 %	50 %	25 %	330464842
62	NC_015409	GGTC	2	8	17759	17766	0 %	25 %	50 %	25 %	330464842
63	NC_015409	ACCG	2	8	17793	17800	25 %	0 %	25 %	50 %	330464842
64	NC_015409	CCAG	2	8	18167	18174	25 %	0 %	25 %	50 %	330464842
65	NC_015409	GTCG	2	8	18820	18827	0 %	25 %	50 %	25 %	330464843
66	NC_015409	CCGG	3	12	19004	19015	0 %	0 %	50 %	50 %	330464843
67	NC_015409	GCCG	2	8	19058	19065	0 %	0 %	50 %	50 %	330464843
68	NC_015409	CGGC	2	8	19223	19230	0 %	0 %	50 %	50 %	330464843
69	NC_015409	ACGG	2	8	19257	19264	25 %	0 %	50 %	25 %	330464843
70	NC_015409	GCCA	2	8	19619	19626	25 %	0 %	25 %	50 %	330464843
71	NC_015409	CTGG	2	8	20459	20466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015409	CGGT	2	8	20538	20545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015409	CGGC	2	8	20733	20740	0 %	0 %	50 %	50 %	330464846
74	NC_015409	CAGG	2	8	20914	20921	25 %	0 %	50 %	25 %	330464846
75	NC_015409	CCGC	2	8	21502	21509	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
76	NC_015409	GCGG	2	8	21569	21576	0 %	0 %	75 %	25 %	330464846
77	NC_015409	CCGC	2	8	21604	21611	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
78	NC_015409	CCGC	2	8	21628	21635	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
79	NC_015409	CCGC	2	8	21658	21665	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
80	NC_015409	TCAC	2	8	22077	22084	25 %	25 %	0 %	50 %	330464846
81	NC_015409	CAGC	2	8	22098	22105	25 %	0 %	25 %	50 %	330464847
82	NC_015409	CCGG	2	8	22151	22158	0 %	0 %	50 %	50 %	330464847
83	NC_015409	CGGC	2	8	22269	22276	0 %	0 %	50 %	50 %	330464847
84	NC_015409	TGCC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	25 %	50 %	330464848
85	NC_015409	CGGC	2	8	22565	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
86	NC_015409	CGGC	2	8	22666	22673	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
87	NC_015409	GCCG	2	8	22731	22738	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
88	NC_015409	GGCC	2	8	22797	22804	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
89	NC_015409	GGCC	2	8	23372	23379	0 %	0 %	50 %	50 %	330464849
90	NC_015409	GCCC	2	8	23425	23432	0 %	0 %	25 %	75 %	330464849
91	NC_015409	CCGG	2	8	23828	23835	0 %	0 %	50 %	50 %	330464850
92	NC_015409	CTCG	2	8	23891	23898	0 %	25 %	25 %	50 %	330464850
93	NC_015409	CCGG	2	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	330464850
94	NC_015409	TGGG	2	8	24015	24022	0 %	25 %	75 %	0 %	330464850
95	NC_015409	CGGT	2	8	24060	24067	0 %	25 %	50 %	25 %	330464850
96	NC_015409	TCGA	2	8	24206	24213	25 %	25 %	25 %	25 %	330464851
97	NC_015409	CCGG	2	8	24456	24463	0 %	0 %	50 %	50 %	330464851
98	NC_015409	CGCC	2	8	24888	24895	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_015409	CGAG	2	8	25187	25194	25 %	0 %	50 %	25 %	330464852
100	NC_015409	CGAG	2	8	25481	25488	25 %	0 %	50 %	25 %	330464852
101	NC_015409	CGGC	2	8	25571	25578	0 %	0 %	50 %	50 %	330464852
102	NC_015409	CGGC	2	8	26090	26097	0 %	0 %	50 %	50 %	330464853
103	NC_015409	TGAT	2	8	26162	26169	25 %	50 %	25 %	0 %	330464853
104	NC_015409	GACG	2	8	26193	26200	25 %	0 %	50 %	25 %	330464853
105	NC_015409	GAGT	2	8	26204	26211	25 %	25 %	50 %	0 %	330464853
106	NC_015409	CGGC	2	8	27188	27195	0 %	0 %	50 %	50 %	330464854
107	NC_015409	AGCA	2	8	27306	27313	50 %	0 %	25 %	25 %	330464854
108	NC_015409	CGCA	2	8	27518	27525	25 %	0 %	25 %	50 %	330464854
109	NC_015409	GCGG	2	8	27777	27784	0 %	0 %	75 %	25 %	330464855
110	NC_015409	GGCG	2	8	27836	27843	0 %	0 %	75 %	25 %	330464855
111	NC_015409	AGGC	2	8	27958	27965	25 %	0 %	50 %	25 %	330464855
112	NC_015409	GCCC	2	8	28199	28206	0 %	0 %	25 %	75 %	330464856
113	NC_015409	CCGG	2	8	28407	28414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015409	CCAG	2	8	28471	28478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015409	GGTA	2	8	28548	28555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015409	CGGG	2	8	28890	28897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015409	CGGG	2	8	28921	28928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015409	GACC	2	8	29118	29125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015409	ATCG	2	8	29209	29216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015409	CCTG	2	8	29614	29621	0 %	25 %	25 %	50 %	330464858
121	NC_015409	GAGC	2	8	29683	29690	25 %	0 %	50 %	25 %	330464858
122	NC_015409	CAGC	2	8	30258	30265	25 %	0 %	25 %	50 %	330464858
123	NC_015409	CCGG	2	8	31480	31487	0 %	0 %	50 %	50 %	330464859
124	NC_015409	CGAC	2	8	31581	31588	25 %	0 %	25 %	50 %	330464859
125	NC_015409	GGAT	2	8	31637	31644	25 %	25 %	50 %	0 %	330464859
126	NC_015409	GGGT	2	8	32044	32051	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015409	CGGC	2	8	32173	32180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015409	ACCC	2	8	32190	32197	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_015409	CGAC	2	8	32285	32292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015409	GGGT	2	8	32417	32424	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015409	CGGC	2	8	32623	32630	0 %	0 %	50 %	50 %	330464861
132	NC_015409	CGAC	2	8	32838	32845	25 %	0 %	25 %	50 %	330464862
133	NC_015409	CCGG	2	8	32928	32935	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
134	NC_015409	CCGG	2	8	33084	33091	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
135	NC_015409	GGCC	2	8	33220	33227	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
136	NC_015409	CCGG	2	8	33465	33472	0 %	0 %	50 %	50 %	330464863
137	NC_015409	CGGC	2	8	33666	33673	0 %	0 %	50 %	50 %	330464863
138	NC_015409	GGAC	2	8	33927	33934	25 %	0 %	50 %	25 %	330464864
139	NC_015409	GGCC	2	8	34003	34010	0 %	0 %	50 %	50 %	330464864
140	NC_015409	CGGC	2	8	34017	34024	0 %	0 %	50 %	50 %	330464864
141	NC_015409	ACGA	2	8	34118	34125	50 %	0 %	25 %	25 %	330464864
142	NC_015409	CCGA	2	8	34205	34212	25 %	0 %	25 %	50 %	330464864
143	NC_015409	GACC	2	8	34510	34517	25 %	0 %	25 %	50 %	330464865
144	NC_015409	CCGG	2	8	34930	34937	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
145	NC_015409	CCGG	2	8	35246	35253	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
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182	NC_015409	CTGC	2	8	45921	45928	0 %	25 %	25 %	50 %	330464870
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216	NC_015409	CCCG	2	8	54788	54795	0 %	0 %	25 %	75 %	330464879
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225	NC_015409	GCCG	2	8	57429	57436	0 %	0 %	50 %	50 %	330464882
226	NC_015409	CGAT	2	8	57686	57693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
227	NC_015409	CGCC	2	8	57947	57954	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.