MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	GCCA	2	8	1913	1920	25 %	0 %	25 %	50 %	330464830
2	NC_015409	CAAA	2	8	2790	2797	75 %	0 %	0 %	25 %	330464831
3	NC_015409	GCCA	2	8	2940	2947	25 %	0 %	25 %	50 %	330464831
4	NC_015409	CATC	2	8	2968	2975	25 %	25 %	0 %	50 %	330464831
5	NC_015409	ATCG	2	8	3427	3434	25 %	25 %	25 %	25 %	330464832
6	NC_015409	CCGA	2	8	3454	3461	25 %	0 %	25 %	50 %	330464832
7	NC_015409	CTGG	2	8	5097	5104	0 %	25 %	50 %	25 %	330464833
8	NC_015409	CCGG	2	8	5178	5185	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
9	NC_015409	CGGC	2	8	5516	5523	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
10	NC_015409	GCCG	2	8	5598	5605	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
11	NC_015409	GATC	2	8	6104	6111	25 %	25 %	25 %	25 %	330464834
12	NC_015409	TTCA	2	8	7748	7755	25 %	50 %	0 %	25 %	330464835
13	NC_015409	GGCA	2	8	7974	7981	25 %	0 %	50 %	25 %	330464836
14	NC_015409	GCCG	2	8	8337	8344	0 %	0 %	50 %	50 %	330464836
15	NC_015409	ACGG	2	8	9207	9214	25 %	0 %	50 %	25 %	330464837
16	NC_015409	CGGC	2	8	9791	9798	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
17	NC_015409	CGGT	2	8	9805	9812	0 %	25 %	50 %	25 %	330464837
18	NC_015409	CCGC	2	8	9897	9904	0 %	0 %	25 %	75 %	330464837
19	NC_015409	GCAC	2	8	10336	10343	25 %	0 %	25 %	50 %	330464838
20	NC_015409	CCGG	2	8	10589	10596	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
21	NC_015409	TCCT	2	8	10882	10889	0 %	50 %	0 %	50 %	330464838
22	NC_015409	CCGG	2	8	11271	11278	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
23	NC_015409	CCGG	2	8	11369	11376	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
24	NC_015409	GCCA	2	8	11737	11744	25 %	0 %	25 %	50 %	330464838
25	NC_015409	CGGT	2	8	11875	11882	0 %	25 %	50 %	25 %	330464838
26	NC_015409	CACG	2	8	11973	11980	25 %	0 %	25 %	50 %	330464838
27	NC_015409	CGGA	2	8	13033	13040	25 %	0 %	50 %	25 %	330464840
28	NC_015409	CGGT	2	8	13489	13496	0 %	25 %	50 %	25 %	330464840
29	NC_015409	GGTG	2	8	13839	13846	0 %	25 %	75 %	0 %	330464841
30	NC_015409	CGGC	2	8	13969	13976	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
31	NC_015409	CTGG	2	8	14028	14035	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
32	NC_015409	CGCT	2	8	14581	14588	0 %	25 %	25 %	50 %	330464841
33	NC_015409	GTCG	2	8	15276	15283	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
34	NC_015409	CCGG	2	8	15431	15438	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
35	NC_015409	TCGG	2	8	15502	15509	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
36	NC_015409	GGTC	2	8	15545	15552	0 %	25 %	50 %	25 %	330464841
37	NC_015409	GCCG	2	8	15842	15849	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
38	NC_015409	CCGG	2	8	15957	15964	0 %	0 %	50 %	50 %	330464841
39	NC_015409	CCGG	2	8	16451	16458	0 %	0 %	50 %	50 %	330464842
40	NC_015409	GCAG	2	8	16493	16500	25 %	0 %	50 %	25 %	330464842
41	NC_015409	GGTC	2	8	17759	17766	0 %	25 %	50 %	25 %	330464842
42	NC_015409	ACCG	2	8	17793	17800	25 %	0 %	25 %	50 %	330464842
43	NC_015409	CCAG	2	8	18167	18174	25 %	0 %	25 %	50 %	330464842
44	NC_015409	GTCG	2	8	18820	18827	0 %	25 %	50 %	25 %	330464843
45	NC_015409	CCGG	3	12	19004	19015	0 %	0 %	50 %	50 %	330464843
46	NC_015409	GCCG	2	8	19058	19065	0 %	0 %	50 %	50 %	330464843
47	NC_015409	CGGC	2	8	19223	19230	0 %	0 %	50 %	50 %	330464843
48	NC_015409	ACGG	2	8	19257	19264	25 %	0 %	50 %	25 %	330464843
49	NC_015409	GCCA	2	8	19619	19626	25 %	0 %	25 %	50 %	330464843
50	NC_015409	CGGC	2	8	20733	20740	0 %	0 %	50 %	50 %	330464846
51	NC_015409	CAGG	2	8	20914	20921	25 %	0 %	50 %	25 %	330464846
52	NC_015409	CCGC	2	8	21502	21509	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
53	NC_015409	GCGG	2	8	21569	21576	0 %	0 %	75 %	25 %	330464846
54	NC_015409	CCGC	2	8	21604	21611	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
55	NC_015409	CCGC	2	8	21628	21635	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
56	NC_015409	CCGC	2	8	21658	21665	0 %	0 %	25 %	75 %	330464846
57	NC_015409	TCAC	2	8	22077	22084	25 %	25 %	0 %	50 %	330464846
58	NC_015409	CAGC	2	8	22098	22105	25 %	0 %	25 %	50 %	330464847
59	NC_015409	CCGG	2	8	22151	22158	0 %	0 %	50 %	50 %	330464847
60	NC_015409	CGGC	2	8	22269	22276	0 %	0 %	50 %	50 %	330464847
61	NC_015409	TGCC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	25 %	50 %	330464848
62	NC_015409	CGGC	2	8	22565	22572	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
63	NC_015409	CGGC	2	8	22666	22673	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
64	NC_015409	GCCG	2	8	22731	22738	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
65	NC_015409	GGCC	2	8	22797	22804	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
66	NC_015409	GGCC	2	8	23372	23379	0 %	0 %	50 %	50 %	330464849
67	NC_015409	GCCC	2	8	23425	23432	0 %	0 %	25 %	75 %	330464849
68	NC_015409	CCGG	2	8	23828	23835	0 %	0 %	50 %	50 %	330464850
69	NC_015409	CTCG	2	8	23891	23898	0 %	25 %	25 %	50 %	330464850
70	NC_015409	CCGG	2	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	330464850
71	NC_015409	TGGG	2	8	24015	24022	0 %	25 %	75 %	0 %	330464850
72	NC_015409	CGGT	2	8	24060	24067	0 %	25 %	50 %	25 %	330464850
73	NC_015409	TCGA	2	8	24206	24213	25 %	25 %	25 %	25 %	330464851
74	NC_015409	CCGG	2	8	24456	24463	0 %	0 %	50 %	50 %	330464851
75	NC_015409	CGAG	2	8	25187	25194	25 %	0 %	50 %	25 %	330464852
76	NC_015409	CGAG	2	8	25481	25488	25 %	0 %	50 %	25 %	330464852
77	NC_015409	CGGC	2	8	25571	25578	0 %	0 %	50 %	50 %	330464852
78	NC_015409	CGGC	2	8	26090	26097	0 %	0 %	50 %	50 %	330464853
79	NC_015409	TGAT	2	8	26162	26169	25 %	50 %	25 %	0 %	330464853
80	NC_015409	GACG	2	8	26193	26200	25 %	0 %	50 %	25 %	330464853
81	NC_015409	GAGT	2	8	26204	26211	25 %	25 %	50 %	0 %	330464853
82	NC_015409	CGGC	2	8	27188	27195	0 %	0 %	50 %	50 %	330464854
83	NC_015409	AGCA	2	8	27306	27313	50 %	0 %	25 %	25 %	330464854
84	NC_015409	CGCA	2	8	27518	27525	25 %	0 %	25 %	50 %	330464854
85	NC_015409	GCGG	2	8	27777	27784	0 %	0 %	75 %	25 %	330464855
86	NC_015409	GGCG	2	8	27836	27843	0 %	0 %	75 %	25 %	330464855
87	NC_015409	AGGC	2	8	27958	27965	25 %	0 %	50 %	25 %	330464855
88	NC_015409	GCCC	2	8	28199	28206	0 %	0 %	25 %	75 %	330464856
89	NC_015409	CCTG	2	8	29614	29621	0 %	25 %	25 %	50 %	330464858
90	NC_015409	GAGC	2	8	29683	29690	25 %	0 %	50 %	25 %	330464858
91	NC_015409	CAGC	2	8	30258	30265	25 %	0 %	25 %	50 %	330464858
92	NC_015409	CCGG	2	8	31480	31487	0 %	0 %	50 %	50 %	330464859
93	NC_015409	CGAC	2	8	31581	31588	25 %	0 %	25 %	50 %	330464859
94	NC_015409	GGAT	2	8	31637	31644	25 %	25 %	50 %	0 %	330464859
95	NC_015409	CGGC	2	8	32623	32630	0 %	0 %	50 %	50 %	330464861
96	NC_015409	CGAC	2	8	32838	32845	25 %	0 %	25 %	50 %	330464862
97	NC_015409	CCGG	2	8	32928	32935	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
98	NC_015409	CCGG	2	8	33084	33091	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
99	NC_015409	GGCC	2	8	33220	33227	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
100	NC_015409	CCGG	2	8	33465	33472	0 %	0 %	50 %	50 %	330464863
101	NC_015409	CGGC	2	8	33666	33673	0 %	0 %	50 %	50 %	330464863
102	NC_015409	GGAC	2	8	33927	33934	25 %	0 %	50 %	25 %	330464864
103	NC_015409	GGCC	2	8	34003	34010	0 %	0 %	50 %	50 %	330464864
104	NC_015409	CGGC	2	8	34017	34024	0 %	0 %	50 %	50 %	330464864
105	NC_015409	ACGA	2	8	34118	34125	50 %	0 %	25 %	25 %	330464864
106	NC_015409	CCGA	2	8	34205	34212	25 %	0 %	25 %	50 %	330464864
107	NC_015409	GACC	2	8	34510	34517	25 %	0 %	25 %	50 %	330464865
108	NC_015409	CCGG	2	8	34930	34937	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
109	NC_015409	CCGG	2	8	35246	35253	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
110	NC_015409	GCCG	2	8	35339	35346	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
111	NC_015409	TGCC	2	8	35630	35637	0 %	25 %	25 %	50 %	330464865
112	NC_015409	CTCG	2	8	35712	35719	0 %	25 %	25 %	50 %	330464865
113	NC_015409	CCTT	2	8	36419	36426	0 %	50 %	0 %	50 %	330464865
114	NC_015409	GAGC	2	8	36709	36716	25 %	0 %	50 %	25 %	330464865
115	NC_015409	CCGA	2	8	37339	37346	25 %	0 %	25 %	50 %	330464865
116	NC_015409	CTAC	2	8	37494	37501	25 %	25 %	0 %	50 %	330464865
117	NC_015409	GCGG	2	8	37977	37984	0 %	0 %	75 %	25 %	330464865
118	NC_015409	GAAG	2	8	38679	38686	50 %	0 %	50 %	0 %	330464865
119	NC_015409	GCCG	2	8	38905	38912	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
120	NC_015409	CGCC	2	8	39195	39202	0 %	0 %	25 %	75 %	330464865
121	NC_015409	CGCC	2	8	39249	39256	0 %	0 %	25 %	75 %	330464865
122	NC_015409	CCGC	2	8	39845	39852	0 %	0 %	25 %	75 %	330464865
123	NC_015409	GACC	2	8	40047	40054	25 %	0 %	25 %	50 %	330464865
124	NC_015409	GCCA	2	8	41525	41532	25 %	0 %	25 %	50 %	330464866
125	NC_015409	GGCG	2	8	41662	41669	0 %	0 %	75 %	25 %	330464866
126	NC_015409	GCCA	2	8	41711	41718	25 %	0 %	25 %	50 %	330464866
127	NC_015409	GTCG	2	8	42198	42205	0 %	25 %	50 %	25 %	330464867
128	NC_015409	GCCG	2	8	42250	42257	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
129	NC_015409	GCGA	2	8	42605	42612	25 %	0 %	50 %	25 %	330464867
130	NC_015409	GCCG	2	8	42652	42659	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
131	NC_015409	GCCC	2	8	42768	42775	0 %	0 %	25 %	75 %	330464867
132	NC_015409	CGGC	2	8	42831	42838	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
133	NC_015409	CCGG	2	8	43063	43070	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
134	NC_015409	CGCC	2	8	43426	43433	0 %	0 %	25 %	75 %	330464867
135	NC_015409	CGGC	2	8	43734	43741	0 %	0 %	50 %	50 %	330464868
136	NC_015409	CGGC	2	8	43869	43876	0 %	0 %	50 %	50 %	330464868
137	NC_015409	CGAC	2	8	44756	44763	25 %	0 %	25 %	50 %	330464869
138	NC_015409	CACC	2	8	45355	45362	25 %	0 %	0 %	75 %	330464870
139	NC_015409	CCGA	2	8	45665	45672	25 %	0 %	25 %	50 %	330464870
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141	NC_015409	CTGC	2	8	45921	45928	0 %	25 %	25 %	50 %	330464870
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177	NC_015409	TCAC	2	8	56106	56113	25 %	25 %	0 %	50 %	330464881
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179	NC_015409	GCCG	2	8	57429	57436	0 %	0 %	50 %	50 %	330464882

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.