MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 2449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015408	CCAA	2	8	478	485	50 %	0 %	0 %	50 %	330443756
2	NC_015408	CTTG	2	8	550	557	0 %	50 %	25 %	25 %	330443756
3	NC_015408	TGTA	2	8	3233	3240	25 %	50 %	25 %	0 %	330443757
4	NC_015408	CAAA	2	8	4320	4327	75 %	0 %	0 %	25 %	330443758
5	NC_015408	TAGC	2	8	4790	4797	25 %	25 %	25 %	25 %	330443759
6	NC_015408	AAGC	2	8	5985	5992	50 %	0 %	25 %	25 %	330443761
7	NC_015408	AAAG	2	8	6086	6093	75 %	0 %	25 %	0 %	330443761
8	NC_015408	AGAA	2	8	6494	6501	75 %	0 %	25 %	0 %	330443761
9	NC_015408	ATTT	2	8	6590	6597	25 %	75 %	0 %	0 %	330443761
10	NC_015408	AAGG	2	8	6788	6795	50 %	0 %	50 %	0 %	330443762
11	NC_015408	CCTA	2	8	6804	6811	25 %	25 %	0 %	50 %	330443762
12	NC_015408	CATA	2	8	6996	7003	50 %	25 %	0 %	25 %	330443762
13	NC_015408	AAAC	2	8	7502	7509	75 %	0 %	0 %	25 %	330443763
14	NC_015408	TCTT	2	8	7640	7647	0 %	75 %	0 %	25 %	330443763
15	NC_015408	ATTT	2	8	8143	8150	25 %	75 %	0 %	0 %	330443763
16	NC_015408	TCCT	2	8	8283	8290	0 %	50 %	0 %	50 %	330443763
17	NC_015408	TTCA	2	8	8573	8580	25 %	50 %	0 %	25 %	330443763
18	NC_015408	GCTC	2	8	8767	8774	0 %	25 %	25 %	50 %	330443764
19	NC_015408	AAAC	2	8	9044	9051	75 %	0 %	0 %	25 %	330443764
20	NC_015408	AGAA	2	8	9090	9097	75 %	0 %	25 %	0 %	330443764
21	NC_015408	AACT	2	8	9928	9935	50 %	25 %	0 %	25 %	330443764
22	NC_015408	GAAA	2	8	10329	10336	75 %	0 %	25 %	0 %	330443765
23	NC_015408	GAAG	2	8	10357	10364	50 %	0 %	50 %	0 %	330443765
24	NC_015408	AATA	2	8	11668	11675	75 %	25 %	0 %	0 %	330443766
25	NC_015408	TACA	2	8	11820	11827	50 %	25 %	0 %	25 %	330443766
26	NC_015408	GCAT	2	8	12424	12431	25 %	25 %	25 %	25 %	330443767
27	NC_015408	CATA	2	8	12605	12612	50 %	25 %	0 %	25 %	330443767
28	NC_015408	CGTC	2	8	12659	12666	0 %	25 %	25 %	50 %	330443767
29	NC_015408	CATA	2	8	12751	12758	50 %	25 %	0 %	25 %	330443767
30	NC_015408	GCAC	2	8	12934	12941	25 %	0 %	25 %	50 %	330443767
31	NC_015408	AAAC	2	8	12975	12982	75 %	0 %	0 %	25 %	330443767
32	NC_015408	TAAA	2	8	13320	13327	75 %	25 %	0 %	0 %	330443767
33	NC_015408	ACAA	2	8	13357	13364	75 %	0 %	0 %	25 %	330443767
34	NC_015408	TCCA	2	8	13553	13560	25 %	25 %	0 %	50 %	330443767
35	NC_015408	AAAC	2	8	13817	13824	75 %	0 %	0 %	25 %	330443768
36	NC_015408	TAGC	2	8	13861	13868	25 %	25 %	25 %	25 %	330443768
37	NC_015408	ATCC	2	8	14124	14131	25 %	25 %	0 %	50 %	330443768
38	NC_015408	AGAA	2	8	14739	14746	75 %	0 %	25 %	0 %	330443768
39	NC_015408	ATTT	2	8	14990	14997	25 %	75 %	0 %	0 %	330443768
40	NC_015408	TCCT	2	8	16024	16031	0 %	50 %	0 %	50 %	330443769
41	NC_015408	TTCA	2	8	16291	16298	25 %	50 %	0 %	25 %	330443769
42	NC_015408	TTCA	2	8	16413	16420	25 %	50 %	0 %	25 %	330443769
43	NC_015408	CATA	2	8	17716	17723	50 %	25 %	0 %	25 %	330443770
44	NC_015408	TTCT	2	8	18619	18626	0 %	75 %	0 %	25 %	330443771
45	NC_015408	ATTT	2	8	18873	18880	25 %	75 %	0 %	0 %	330443771
46	NC_015408	GTGG	2	8	19002	19009	0 %	25 %	75 %	0 %	330443771
47	NC_015408	TAAA	2	8	19247	19254	75 %	25 %	0 %	0 %	330443771
48	NC_015408	CTTT	2	8	19291	19298	0 %	75 %	0 %	25 %	330443771
49	NC_015408	ACTC	2	8	20121	20128	25 %	25 %	0 %	50 %	330443771
50	NC_015408	AAAT	2	8	20505	20512	75 %	25 %	0 %	0 %	330443772
51	NC_015408	TAAT	2	8	20987	20994	50 %	50 %	0 %	0 %	330443773
52	NC_015408	AATC	2	8	21402	21409	50 %	25 %	0 %	25 %	330443773
53	NC_015408	TTTA	2	8	22007	22014	25 %	75 %	0 %	0 %	330443774
54	NC_015408	GTAG	2	8	22137	22144	25 %	25 %	50 %	0 %	330443774
55	NC_015408	TGCC	2	8	22312	22319	0 %	25 %	25 %	50 %	330443775
56	NC_015408	AGGA	2	8	22896	22903	50 %	0 %	50 %	0 %	330443775
57	NC_015408	GATC	2	8	22906	22913	25 %	25 %	25 %	25 %	330443775
58	NC_015408	GCAC	2	8	22931	22938	25 %	0 %	25 %	50 %	330443775
59	NC_015408	CCAT	2	8	23531	23538	25 %	25 %	0 %	50 %	330443776
60	NC_015408	CCAA	2	8	23867	23874	50 %	0 %	0 %	50 %	330443776
61	NC_015408	ATAA	2	8	24022	24029	75 %	25 %	0 %	0 %	330443776
62	NC_015408	TTTC	2	8	24236	24243	0 %	75 %	0 %	25 %	330443777
63	NC_015408	ACCT	2	8	25370	25377	25 %	25 %	0 %	50 %	330443779
64	NC_015408	ATAA	2	8	25739	25746	75 %	25 %	0 %	0 %	330443780
65	NC_015408	AACC	2	8	26281	26288	50 %	0 %	0 %	50 %	330443782
66	NC_015408	CTAT	2	8	26442	26449	25 %	50 %	0 %	25 %	330443782
67	NC_015408	TTCA	2	8	27610	27617	25 %	50 %	0 %	25 %	330443784
68	NC_015408	AAAT	2	8	27622	27629	75 %	25 %	0 %	0 %	330443784
69	NC_015408	GAAG	2	8	27898	27905	50 %	0 %	50 %	0 %	330443785
70	NC_015408	GGCC	2	8	28430	28437	0 %	0 %	50 %	50 %	330443786
71	NC_015408	AGAA	2	8	28443	28450	75 %	0 %	25 %	0 %	330443786
72	NC_015408	TCCT	2	8	28486	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	330443786
73	NC_015408	CCTT	2	8	28949	28956	0 %	50 %	0 %	50 %	330443786
74	NC_015408	GCAA	2	8	28971	28978	50 %	0 %	25 %	25 %	330443786
75	NC_015408	TTTA	2	8	29209	29216	25 %	75 %	0 %	0 %	330443786
76	NC_015408	CTGT	2	8	29241	29248	0 %	50 %	25 %	25 %	330443786
77	NC_015408	TCCC	2	8	29331	29338	0 %	25 %	0 %	75 %	330443786
78	NC_015408	CAGT	2	8	29967	29974	25 %	25 %	25 %	25 %	330443786
79	NC_015408	GAAG	2	8	30118	30125	50 %	0 %	50 %	0 %	330443786
80	NC_015408	AAGG	2	8	30185	30192	50 %	0 %	50 %	0 %	330443786
81	NC_015408	CTTA	2	8	30263	30270	25 %	50 %	0 %	25 %	330443786
82	NC_015408	CATC	2	8	31039	31046	25 %	25 %	0 %	50 %	330443787
83	NC_015408	TGCA	2	8	31247	31254	25 %	25 %	25 %	25 %	330443787
84	NC_015408	CCAT	2	8	31401	31408	25 %	25 %	0 %	50 %	330443787
85	NC_015408	ACTG	2	8	32157	32164	25 %	25 %	25 %	25 %	330443787
86	NC_015408	AGAA	2	8	33012	33019	75 %	0 %	25 %	0 %	330443787
87	NC_015408	AGAA	2	8	33496	33503	75 %	0 %	25 %	0 %	330443788
88	NC_015408	TATT	2	8	34800	34807	25 %	75 %	0 %	0 %	330443789
89	NC_015408	TTCT	2	8	35333	35340	0 %	75 %	0 %	25 %	330443789
90	NC_015408	AATT	2	8	35621	35628	50 %	50 %	0 %	0 %	330443790
91	NC_015408	GGGA	2	8	36144	36151	25 %	0 %	75 %	0 %	330443790
92	NC_015408	TAAG	2	8	36842	36849	50 %	25 %	25 %	0 %	330443791
93	NC_015408	GGAA	2	8	37102	37109	50 %	0 %	50 %	0 %	330443791
94	NC_015408	CTGC	2	8	37135	37142	0 %	25 %	25 %	50 %	330443791
95	NC_015408	GAAT	2	8	37210	37217	50 %	25 %	25 %	0 %	330443791
96	NC_015408	TCTA	2	8	37424	37431	25 %	50 %	0 %	25 %	330443791
97	NC_015408	ACTT	2	8	37597	37604	25 %	50 %	0 %	25 %	330443791
98	NC_015408	AAAG	2	8	39165	39172	75 %	0 %	25 %	0 %	330443792
99	NC_015408	ATGT	2	8	39362	39369	25 %	50 %	25 %	0 %	330443792
100	NC_015408	TAGA	2	8	39393	39400	50 %	25 %	25 %	0 %	330443792
101	NC_015408	TGAA	2	8	39504	39511	50 %	25 %	25 %	0 %	330443792
102	NC_015408	ATCT	2	8	39594	39601	25 %	50 %	0 %	25 %	330443792
103	NC_015408	GCTT	2	8	40207	40214	0 %	50 %	25 %	25 %	330443793
104	NC_015408	GCTT	2	8	40706	40713	0 %	50 %	25 %	25 %	330443795
105	NC_015408	TCTT	2	8	40805	40812	0 %	75 %	0 %	25 %	330443795
106	NC_015408	TATT	2	8	40998	41005	25 %	75 %	0 %	0 %	330443795
107	NC_015408	AGTA	2	8	41355	41362	50 %	25 %	25 %	0 %	330443797
108	NC_015408	TTCC	2	8	41732	41739	0 %	50 %	0 %	50 %	330443798
109	NC_015408	ATTC	2	8	42450	42457	25 %	50 %	0 %	25 %	330443799
110	NC_015408	TTTA	2	8	44371	44378	25 %	75 %	0 %	0 %	330443801
111	NC_015408	TGCC	2	8	44998	45005	0 %	25 %	25 %	50 %	330443801
112	NC_015408	TCCT	2	8	46011	46018	0 %	50 %	0 %	50 %	330443802
113	NC_015408	TACA	2	8	46450	46457	50 %	25 %	0 %	25 %	330443802
114	NC_015408	AGAA	2	8	47069	47076	75 %	0 %	25 %	0 %	330443802
115	NC_015408	TTTA	2	8	47759	47766	25 %	75 %	0 %	0 %	330443802
116	NC_015408	AACA	2	8	48455	48462	75 %	0 %	0 %	25 %	330443802
117	NC_015408	TTAT	2	8	48974	48981	25 %	75 %	0 %	0 %	330443803
118	NC_015408	GGTT	2	8	49281	49288	0 %	50 %	50 %	0 %	330443803
119	NC_015408	TCTT	2	8	49611	49618	0 %	75 %	0 %	25 %	330443803
120	NC_015408	TCTT	2	8	49738	49745	0 %	75 %	0 %	25 %	330443804
121	NC_015408	ACCT	2	8	50373	50380	25 %	25 %	0 %	50 %	330443804
122	NC_015408	AGAC	2	8	50384	50391	50 %	0 %	25 %	25 %	330443804
123	NC_015408	TTCT	2	8	50564	50571	0 %	75 %	0 %	25 %	330443804
124	NC_015408	AGAA	2	8	51931	51938	75 %	0 %	25 %	0 %	330443805
125	NC_015408	ATGG	2	8	52001	52008	25 %	25 %	50 %	0 %	330443805
126	NC_015408	ATAA	2	8	52048	52055	75 %	25 %	0 %	0 %	330443805
127	NC_015408	TCCT	2	8	52688	52695	0 %	50 %	0 %	50 %	330443805
128	NC_015408	TACA	2	8	52821	52828	50 %	25 %	0 %	25 %	330443805
129	NC_015408	TTCT	2	8	52969	52976	0 %	75 %	0 %	25 %	330443805
130	NC_015408	CAGG	2	8	54221	54228	25 %	0 %	50 %	25 %	330443806
131	NC_015408	CTTT	2	8	55324	55331	0 %	75 %	0 %	25 %	330443806
132	NC_015408	CTTC	2	8	55824	55831	0 %	50 %	0 %	50 %	330443807
133	NC_015408	TAAA	2	8	56829	56836	75 %	25 %	0 %	0 %	330443807
134	NC_015408	CTCC	2	8	57274	57281	0 %	25 %	0 %	75 %	330443808
135	NC_015408	GATG	2	8	57482	57489	25 %	25 %	50 %	0 %	330443808
136	NC_015408	TAGC	2	8	58275	58282	25 %	25 %	25 %	25 %	330443809
137	NC_015408	ATCC	2	8	58960	58967	25 %	25 %	0 %	50 %	330443809
138	NC_015408	AACT	2	8	59133	59140	50 %	25 %	0 %	25 %	330443810
139	NC_015408	GTTT	2	8	59569	59576	0 %	75 %	25 %	0 %	330443811
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